blast+有三大工具类型：

功能 search database filter
命令

blastn, blastp, blastx,

tblastx, tblastn,

psiblast, rpsblast, and rpstblastn

makeblastdb,

blastdb_aliastool,

makeprofiledb, and blastdbcmd

segmasker,

dustmasker,

and windowmasker.
       
       
       

1.search:

2.database:

makeblastdb:Application to create BLAST databases.

blastdbcmd: BLAST database client

blastdb_aliastool:Application to create BLAST database aliases.

makeprofiledb: Application to create databases for rpsblast, cobalt and deltablast

3.filter:

Segmasker is an application that identifies and masks low complexity regions of protein sequences.

The dustmasker application provides a similar functionality for nucleotide sequences.

Windowmasker uses a genome to identify sequences represented too often to be of interest to most users.

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