医学图像dcm2d切片文件转3dnii文件

安装

conda:

conda install -c conda-forge dicom2nifti

pip:

pip install dicom2nifti

更新

conda：

conda update dicom2nifti

pip：

pip install dicom2nifti --upgrade

可以将包含dcm文件的目录转换为nii文件，也可以只转一个文件夹，详情

执行下列程序：

import dicom2nifti
# 多个dicom文件转化为3D nii文件
# 'E:/COVID-19CTimageAnal/data'为存放dcm2d切片文件的目录
original_dicom_directory = 'E:/COVID-19CTimageAnal/data'
# '0007686236.nii'为要生成的nii文件名
output_file = '0007686236.nii'
dicom2nifti.dicom_series_to_nifti(original_dicom_directory, output_file, reorient_nifti=True)