A single-cell molecular map of mouse gastrulation and early organogenesis

Here we report the transcriptional profiles of 116,312 single cells from mouse embryos collected at nine sequential time points ranging from 6.5 to 8.5 days post-fertilization.

另一篇的姐妹篇，本文测了E6.5到E8.5的老鼠胚胎发育的数据。

数据下载：

Data availability
Raw sequencing data are available on ArrayExpress with the following accessions: Atlas: E-MTAB-6967; Smart-seq2 endothelial cells: E-MTAB-6970; Tal1−/− chimaeras: E-MTAB-7325; wild-type chimaeras: E-MTAB-7324. Processed data may be downloaded following the instructions at https://github.com/MarioniLab/EmbryoTimecourse2018. Gene Expression Omnibus (GEO) accession GSE87038 was used to support the annotation of myeloid cells (see Methods). All code is available upon request, and at https://github.com/MarioniLab/EmbryoTimecourse2018. Our atlas can be explored at https://marionilab.cruk.cam.ac.uk/MouseGastrulation2018/. All other data are available from the corresponding authors on reasonable request.

待续~

文献阅读 | A single-cell molecular map of mouse gastrulation and early organogenesis的更多相关文章

  1. 文献阅读 | Benchmarking single cell RNA-sequencing analysis pipelines using mixture control experiments

    资源: sci-hub paper CellBench package - github CellBench_data - code for the paper 现在单细胞领域的突出问题就是工具过多, ...

  2. 文献阅读 | The single-cell transcriptional landscape of mammalian organogenesis | 器官形成 | 单细胞转录组

    The single-cell transcriptional landscape of mammalian organogenesis 老板已经提了无数遍的文章,确实很nb,这个工作是之前我们无法想 ...

  3. Advances in Single Cell Genomics to Study Brain Cell Types | 会议概览

    单细胞在脑科学方面的应用 Session 1: Deciphering the Cellular Landscape of the Brain Using Single Cell Transcript ...

  4. 文献阅读笔记——group sparsity and geometry constrained dictionary

    周五实验室有同学报告了ICCV2013的一篇论文group sparsity and geometry constrained dictionary learning for action recog ...

  5. 单细胞参考文献 single cell

    许多分析软件 : https://github.com/seandavi/awesome-single-cell#software-packages Smart-seq.CEL-seq.SCRB-se ...

  6. 单细胞测序技术(single cell sequencing)

    单细胞测序技术(single cell sequencing) 2018-03-02 11:02   来源: 一呼百诺  点击次数:6587关键词:   前言 单细胞生物学最近几年是非常热门的研究方向 ...

  7. Analysis of single cell RNA-seq data（单细胞终极课程）

    业界良心啊,开源的单细胞课程. 随便看了几章,课程写得非常用心,非常适合新手. 课程地址:Analysis of single cell RNA-seq data 源码地址:hemberg-lab/s ...

  8. Multiclonal Invasion in Breast Tumors Identified by Topographic Single Cell Sequencing

    Title:  Multiclonal Invasion in Breast Tumors Identified by Topographic Single Cell Sequencing 课题的目的 ...

  9. Single Cell Genomics Day: A Practical Workshop

    干货满满! Single Cell Genomics Day: A Practical Workshop

随机推荐

  1. jQuery知识梳理20190818

    目录 jQuery知识梳理20190818 1. 时间绑定和解绑 2. 区别mouseover与mouseenter 3. 时间委托(委派/代理) 4 . 多库共存 5.window.onload与$ ...

  2. GNS3、Wireshark、SecureCRT 环境部署

    本次GNS3环境部署教程基于官方推荐的稳定版1.5.4.初次接触此软件,详细的使用方法不是很清楚,所以以此作为学习记录,仅供参考,后期补充. 软件介绍 GNS3 GNS3是一款具有图形化界面可以运行在 ...

  3. 推荐一个Web漏洞靶场

    https://github.com/zhuifengshaonianhanlu/pikachu 暂时先空着 安装好是这样的 博主先去玩了,回来再写博客,2333

  4. python3爬虫--反爬虫应对机制

    python3爬虫--反爬虫应对机制 内容来源于: Python3网络爬虫开发实战: 网络爬虫教程(python2): 前言: 反爬虫更多是一种攻防战,针对网站的反爬虫处理来采取对应的应对机制,一般需 ...

  5. expect工具实现脚本的自动交互

    1 安装expect工具 expect是建立在tcl基础上的一个自动化交互套件, 在一些需要交互输入指令的场景下, 可通过脚本设置自动进行交互通信. 其交互流程是: spawn启动指定进程 -> ...

  6. webpack-dev-server 本地代理proxy

    proxy: [ { context: ['/user', '/rights', '/resource/getAdNotice'], target: 'https://plus.m.jd.com', ...

  7. java构建简单的HTTP服务器

    使用Java技术构建Web应用时, 我们通常离不开tomcat和jetty之类的servlet容器,这些Web服务器功能强大,性能强劲,深受欢迎,是运行大型Web应用的必备神器. 虽然Java的设计初 ...

  8. 跨子域的iframe高度自适应

    一.跨子域的iframe高度自适应 比如 'a.jd.com/3.html' 嵌入了 'b.jd.com/4.html',这种跨子域的页面 3.html 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 ...

  9. ubuntu18.04 + python3 安装pip3

    最近在学习python 网络爬虫,正好接触到python的requests模块 我的开发环境是ubuntu18.04+python3,这个系统是默认自带了python3,且版本是python 3.6. ...

  10. 10-Flutter移动电商实战-使用FlutterSwiper制作轮播效果

    1.引入flutter_swiper插件 flutter最强大的siwiper, 多种布局方式,无限轮播,Android和IOS双端适配. 好牛X得介绍,一般敢用“最”的一般都是神级大神,看到这个介绍 ...