GTF/GFF的更多相关文章

  1. GTF/GFF文件的差异及其相互转换

    我们在做生物分析的时候,经常会碰到GFF格式的文件以及GTF格式的注释文件.他们有着相似的名字,甚至连内容都极为相似~那么,他们究竟差在哪里呢? GFF全称为general feature forma ...

  2. GFF format

    后记: ************************************************************************ 在使用cufflinks和cuffmerge中 ...

  3. StringTie用法详解

    StringTie 参考链接: https://ccb.jhu.edu/software/stringtie/index.shtml?t=manual#input https://www.cnblog ...

  4. RNA-seq分析htseq-count的使用

    HTSeq作为一款可以处理高通量数据的python包,由Simon Anders, Paul Theodor Pyl, Wolfgang Huber等人携手推出HTSeq — A Python fra ...

  5. tophat的用法

    概述:tophat是以bowtie2为核心的一款比对软件. tophat工作分两步: 1.将reads用bowtie比对到参考基因组上. 2.将unmapped-reads打断成更小的fragment ...

  6. 32、Differential Gene Expression using RNA-Seq (Workflow)

    转载: https://github.com/twbattaglia/RNAseq-workflow Introduction RNAseq is becoming the one of the mo ...

  7. 12、IGV-Integrative Genomics Viewer

    1.IGV的网址:http://software.broadinstitute.org/software/igv/(java环境) 常见的几种输入格式bam/sam(比对文件)  TDF(bam的精简 ...

  8. 【基因组预测】braker2基因结构注释要点记录

    目录 流程使用 问题 记录下braker2的使用要点,以备忘记. 流程使用 braker2有很多流程,根据你的数据:组装的基因组.转录组.蛋白(同源,包括近缘或远缘)选择不同流程,官网有说明: htt ...

  9. miRAN 分析以及mRNA分析

    一些参考资料 http://www.360doc.com/content/17/0528/22/19913717_658086490.shtml https://www.cnblogs.com/tri ...

随机推荐

  1. Cache 和 Buffer 区别是什么

    一 从常识来说,cache叫缓存,buffer叫缓冲. 二 尴尬的是缓存是什么?缓冲是什么? 缓冲,缓和冲击.也就是100次保存数据库,先把操作保存到本地,然后满10次才保存到数据库. 缓存,就是缓冲 ...

  2. mysql连接error,Establishing SSL connection without server's identity verification is not recommended. According to MySQL 5.5.45+, 5.6.26+ and 5.7.6+ requirements SSL connection .....

    完整error Establishing SSL connection without server's identity verification is not recommended. Accor ...

  3. log4net 最快速体验

    本文供实习司机快速上手log4net最基本功能,共4步,3分钟搞定. 一.添加log4net.dll引用,可使用nuget安装或直接引用文件 二.添加配置 在app.config或web.config ...

  4. linux启动mysql报错 Starting MySQL... ERROR! The server quit without updating PID file (XXXX pid文件位置)

    最近在云服务器上安装mysql  启动时报错了,从错误中可以看出,定位在pid文件上,有三种解决方案 1.重启服务器:因为服务器更新时,可能会禁用某些守护进程,重启后即可恢复 2.删除配置文件,重启试 ...

  5. springBoot 定时器任务

    1.新建一个计划任务类(只能和主类平级或在主类的下级) import java.text.SimpleDateFormat; import java.util.Date; import org.slf ...

  6. JSP对象和JavaBean

    1. JSP 客户端请求 当浏览器请求一个网页时,它会向网络服务器发送一系列不能被直接读取的信息,因为这些信息是作为HTTP信息头的一部分来传送的,如下图所示: Http请求头对应的内容如下: 对应方 ...

  7. pixhawk原生固件在Windows下环境搭建笔记

    首先参考了以下几篇博客 博客1:https://zhuanlan.zhihu.com/p/25198079 博客2:http://blog.csdn.net/oqqenvy12/article/det ...

  8. BZOJ 4541: [Hnoi2016]矿区 平面图转对偶图+DFS树

    4541: [Hnoi2016]矿区 Time Limit: 30 Sec  Memory Limit: 512 MBSubmit: 433  Solved: 182[Submit][Status][ ...

  9. UVALive 4727 Jump(约瑟夫环,递推)

    分析: 如果问题是要求最后一个删除的数,重新编号为0到n-1,f[n]表示答案,那么f[n] = (f[n-1]+k)%n. 因为删掉下标k-1以后可以从下标k重新编号为0. 在这个问题只需要推出最后 ...

  10. 2018.6.15 Java对象序列化详解

    一.定义 Serializable 序列化:把Java对象转换为字节序列的过程. 反序列化:把字节序列恢复为Java对象的过程. ObjectOutputStream对象输出流 可以将实现了Seria ...