1.几大常用格式

这张ppt介绍了现在常用的三种格式：dicom主要由扫描器产生，一般是一个slice一个文件；analyze 格式= .img/.hdr spm下用的最多；nifti ，由fsl & afni & spm几个老大哥共同确定的格式，支持3d或者4d。

2.利用spm的dicom import 把dicom原始数据转换成分析格式。

　　一般从sanner拷出来的文件夹中，每一个文件夹里的dicom文件，代表一个被试一次run的结果。spm会自动将dicom转成hdr/img格式。

3.利用matlab从hdr/img中读取文件信息，绘图，抽取出矩阵数据等等。

　　学会使用spm自带的两条命令：spm_vol ：读取相应的img文件的hdr文件信息；

　　　　　　　　　　　　　　　　spm_read_vols:按照矩阵格式，读取img文件内容。

4.利用matlab 批量读取img文件，然后自动转换成四维的数据。(这张ppt的spm_get命令似乎有问题，最好还是利用其他方法进行3d-》4d)

5.绘制时间序列

 5.利用spm进行3d转4d：
　　hankfully, SPM has a semi-hidden utility for this conversion.

The GUI is located within the Batch Editor’s SPM>Util menu, and be default saves the specified 3D NIFTI images to a single 4D NIFTI image within the same directory.

6. 把nii格式转成hdr和img格式

　　利用mricron软件的import—》 convert nifti .nii to .hdr/.img

fmri数据分析图像格式及转换问题——基于spm讨论的更多相关文章

  1. fMRI数据分析处理原理及方法————转自网络

    fMRI数据分析处理原理及方法 来源: 整理文件的时候翻到的,来源已经找不到了囧感觉写得还是不错,贴在这里保存. 近年来,血氧水平依赖性磁共振脑功能成像(Blood oxygenation level ...

  2. 关于fmri数据分析的两大类，四种方法

    关于fmri数据分析的两大类,四种方法: 数据驱动: tca:其实这种方法,主要是提取时间维的特征.如果用它来进行数据的分析,则必须要利用其他的数据方法,比如结合ICA. ica:作为pca的一般化实 ...

  3. fMRI数据分析处理原理及方法（转载）

    原文地址:http://www.cnblogs.com/minks/p/4889497.html 近年来,血氧水平依赖性磁共振脑功能成像(Blood oxygenation level-depende ...

  4. fMRI数据分析处理原理及方法

    来源: 整理文件的时候翻到的,来源已经找不到了囧感觉写得还是不错,贴在这里保存. 近年来,血氧水平依赖性磁共振脑功能成像(Blood oxygenation level-dependent funct ...

  5. Hive数据分析——Spark是一种基于rdd（弹性数据集）的内存分布式并行处理框架，比于Hadoop将大量的中间结果写入HDFS，Spark避免了中间结果的持久化

    转自:http://blog.csdn.net/wh_springer/article/details/51842496 近十年来,随着Hadoop生态系统的不断完善,Hadoop早已成为大数据事实上 ...

  6. convert图像格式批量转换

    问题:利用GMT绘制生成了eps格式的图像,为了将图像插入到word中,且保持较高的分辨率,利用convert进行图像格式转换,将eps转换成tiff格式. code:  $i ${name}.tif ...

  7. Java 大小端转换（基于ByteBuffer）

    大小端的基础知识: 小端( little-endian):低位字节在前,高位字节在后.大端( Big-Endian),则反之.具体而言,就是为了说清楚,CPU架构1 字(word)中byte的存储顺序 ...

  8. Python图像处理库PIL中图像格式转换

    o 在数字图像处理中,针对不同的图像格式有其特定的处理算法.所以,在做图像处理之前,我们需要考虑清楚自己要基于哪种格式的图像进行算法设计及其实现.本文基于这个需求,使用python中的图像处理库PIL ...

  9. Python图像处理库PIL中图像格式转换（一）

    在数字图像处理中,针对不同的图像格式有其特定的处理算法. 所以,在做图像处理之前,我们须要考虑清楚自己要基于哪种格式的图像进行算法设计及事实上现.本文基于这个需求.使用python中的图像处理库PIL ...

随机推荐

  1. Vim的分屏功能(转)

    注:本文属于转载,源地址:http://blog.csdn.net/ithomer/article/details/6035627(博主很牛,欢迎关注) 本篇文章主要教你如何使用 Vim 分屏功能 分 ...

  2. mysql数据库隔离级别

    # 原创,转载请留言联系 事务的隔离级别 (由高到低)1.串行化(serializable):一个事务一个事务的执行2.可重复读(Repeatable-Read) 可重复读,无论其他事务是否修改并提交 ...

  3. 21：序列化django对象

    django的序列化框架提供了一个把django对象转换成其他格式的机制,通常这些其他的格式都是基于文本的并且用于通过一个管道发送django对象,但一个序列器是可能处理任何一个格式的(基于文本或者不 ...

  4. AC日记——[SCOI2009]游戏 bzoj 1025

    [SCOI2009]游戏 思路: 和为n的几个数最小公倍数有多少种. dp即可: 代码: #include <bits/stdc++.h> using namespace std; #de ...

  5. ubuntu16.04下安装docker

    原文地址:传送门 本文开发环境为Ubuntu 16.04 LTS 64位系统,通过apt的docker官方源安装最新的Docker CE(Community Edition),即Docker社区版,是 ...

  6. redis三种连接方式

    安装 tar zxvf redis-2.8.9.tar.gz cd redis-2.8.9 #直接make 编译 make #可使用root用户执行`make install`,将可执行文件拷贝到/u ...

  7. 开源游戏地图编辑器MarbleMap

    开源游戏地图编辑器MarbleMap MIT协议,MarbleMap是一款as3开发的游戏地图编辑器,他免费开源,同时支持Cocos2d-x坐标系和AS3坐标系,功能丰富,不过是一款新推出的开源项目, ...

  8. 【C#】构建可枚举类型(IEnumerable和IEnumerator)

    为了开始对实现既有接口的了解,我们就看一下IEnumerable和IEnumerator的作用,想一下,C#支持关键字foreach,允许我们遍历任何数组类型的内容: //遍历数组的项 ,,} for ...

  9. 转:vscode中调试php

    转:http://blog.csdn.net/x356982611/article/details/52664334 简介 PHP是动态语言没有调试器的话排错起来很是麻烦.vscode可以说是程序员的 ...

  10. NestedScrollView

    参考文章: Android滑动到顶部悬停 NestedScrollView的使用 效果图: 实现步骤: 将需要悬浮的layout放到CollapsingToolbarLayout之外,AppBarLa ...