fmri数据分析图像格式及转换问题——基于spm讨论
1.几大常用格式
这张ppt介绍了现在常用的三种格式:dicom主要由扫描器产生,一般是一个slice一个文件;analyze 格式= .img/.hdr spm下用的最多;nifti ,由fsl & afni & spm几个老大哥共同确定的格式,支持3d或者4d。


2.利用spm的dicom import 把dicom原始数据转换成分析格式。
一般从sanner拷出来的文件夹中,每一个文件夹里的dicom文件,代表一个被试一次run的结果。spm会自动将dicom转成hdr/img格式。

3.利用matlab从hdr/img中读取文件信息,绘图,抽取出矩阵数据等等。
学会使用spm自带的两条命令:spm_vol :读取相应的img文件的hdr文件信息;
spm_read_vols:按照矩阵格式,读取img文件内容。


4.利用matlab 批量读取img文件,然后自动转换成四维的数据。(这张ppt的spm_get命令似乎有问题,最好还是利用其他方法进行3d-》4d)

5.绘制时间序列

5.利用spm进行3d转4d:
hankfully, SPM has a semi-hidden utility for this conversion.
The GUI is located within the Batch Editor’s SPM>Util menu, and be default saves the specified 3D NIFTI images to a single 4D NIFTI image within the same directory.
6. 把nii格式转成hdr和img格式
利用mricron软件的import—》 convert nifti .nii to .hdr/.img
fmri数据分析图像格式及转换问题——基于spm讨论的更多相关文章
- fMRI数据分析处理原理及方法————转自网络
fMRI数据分析处理原理及方法 来源: 整理文件的时候翻到的,来源已经找不到了囧感觉写得还是不错,贴在这里保存. 近年来,血氧水平依赖性磁共振脑功能成像(Blood oxygenation level ...
- 关于fmri数据分析的两大类,四种方法
关于fmri数据分析的两大类,四种方法: 数据驱动: tca:其实这种方法,主要是提取时间维的特征.如果用它来进行数据的分析,则必须要利用其他的数据方法,比如结合ICA. ica:作为pca的一般化实 ...
- fMRI数据分析处理原理及方法(转载)
原文地址:http://www.cnblogs.com/minks/p/4889497.html 近年来,血氧水平依赖性磁共振脑功能成像(Blood oxygenation level-depende ...
- fMRI数据分析处理原理及方法
来源: 整理文件的时候翻到的,来源已经找不到了囧感觉写得还是不错,贴在这里保存. 近年来,血氧水平依赖性磁共振脑功能成像(Blood oxygenation level-dependent funct ...
- Hive数据分析——Spark是一种基于rdd(弹性数据集)的内存分布式并行处理框架,比于Hadoop将大量的中间结果写入HDFS,Spark避免了中间结果的持久化
转自:http://blog.csdn.net/wh_springer/article/details/51842496 近十年来,随着Hadoop生态系统的不断完善,Hadoop早已成为大数据事实上 ...
- convert图像格式批量转换
问题:利用GMT绘制生成了eps格式的图像,为了将图像插入到word中,且保持较高的分辨率,利用convert进行图像格式转换,将eps转换成tiff格式. code: $i ${name}.tif ...
- Java 大小端转换(基于ByteBuffer)
大小端的基础知识: 小端( little-endian):低位字节在前,高位字节在后.大端( Big-Endian),则反之.具体而言,就是为了说清楚,CPU架构1 字(word)中byte的存储顺序 ...
- Python图像处理库PIL中图像格式转换
o 在数字图像处理中,针对不同的图像格式有其特定的处理算法.所以,在做图像处理之前,我们需要考虑清楚自己要基于哪种格式的图像进行算法设计及其实现.本文基于这个需求,使用python中的图像处理库PIL ...
- Python图像处理库PIL中图像格式转换(一)
在数字图像处理中,针对不同的图像格式有其特定的处理算法. 所以,在做图像处理之前,我们须要考虑清楚自己要基于哪种格式的图像进行算法设计及事实上现.本文基于这个需求.使用python中的图像处理库PIL ...
随机推荐
- C后端设计开发 - 第2章-内功-数据结构上卷
正文 第2章-内功-数据结构上卷 后记 如果有错误, 欢迎指正. 有好的补充, 和疑问欢迎交流, 一块提高. 在此谢谢大家了.
- VPS性能综合测试(7):服务器压力测试,VPS系统负载测试
1.可能有的VPS主机使用性能测评工具得出的结果很优秀,但是最终运用到实际生产时却发现VPS主机根本无法承受理论上应该达到的流量压力,这时我们就不得不要怀疑VPS商是不是对VPS主机的参数进行了“篡改 ...
- vue-router 基础
安装 NPM npm install vue-router 如果在一个模块化工程中使用它,必须要通过 Vue.use() 明确地安装路由功能: import Vue from 'vue' import ...
- Canvas开发库封装
一.Canvas第三方类库 1.常见的第三方类库 konva.js <style> body{ margin:0; } </style> </head> <b ...
- [linux]通过ssh远程设定各服务器时间,从而实现集群时间同步
#!/usr/bin/env bash #all hosts should to sync time, all hosts should no password login echo other sy ...
- 如何在datepicker滚动完毕后触发事件去获得日期
本来以为这件事情应该需要借助datepicker的委托来处理的,但是并没有找到此空间的委托. 其实最最简单的做法就是在IB中将次控件connect到一个Action上. 经过测试,当datepicke ...
- MapReduce案例一:天气温度
1.需求 2.思路 3.代码实现 3.1MyWeather 类代码: 这个类主要是用来定义hadoop的配置,在执行计算程序时所需加载的一些类. package com.hadoop.mr.weath ...
- redis之(四)redis的字符串类型的命令
[一]获得符合规则的键名列表 -->命令 keys [pattern] -->keys命令需要遍历Redis中所有的键,当键的数量比较多会影响性能,生产环境不建议用 -->pat ...
- 走进 UnitTest for Xamarin.Forms
之前讲了 Xamarin.Forms 的 UITest 走进 UITest for Xamarin.Forms 走进 Xamarin Test Recorder for Xamarin.Forms 但 ...
- JavaScript如何判断变量是数组还是对象
编辑 方法一:通过判断变量的类型,并且变量的length属性(除了有一种例外是arguments对象–当给函数传参时数据存储的地方) var arr=[2,3,4]; var obj={"n ...