1.几大常用格式

这张ppt介绍了现在常用的三种格式:dicom主要由扫描器产生,一般是一个slice一个文件;analyze 格式= .img/.hdr spm下用的最多;nifti ,由fsl & afni & spm几个老大哥共同确定的格式,支持3d或者4d。

2.利用spm的dicom import 把dicom原始数据转换成分析格式

  一般从sanner拷出来的文件夹中,每一个文件夹里的dicom文件,代表一个被试一次run的结果。spm会自动将dicom转成hdr/img格式。

3.利用matlab从hdr/img中读取文件信息,绘图,抽取出矩阵数据等等。

  学会使用spm自带的两条命令:spm_vol :读取相应的img文件的hdr文件信息;

                spm_read_vols:按照矩阵格式,读取img文件内容。

4.利用matlab 批量读取img文件,然后自动转换成四维的数据。(这张ppt的spm_get命令似乎有问题,最好还是利用其他方法进行3d-》4d)

5.绘制时间序列

 5.利用spm进行3d转4d:
  hankfully, SPM has a semi-hidden utility for this conversion.

The GUI is located within the Batch Editor’s SPM>Util menu, and be default saves the specified 3D NIFTI images to a single 4D NIFTI image within the same directory.

6. 把nii格式转成hdr和img格式

  利用mricron软件的import—》 convert nifti .nii to .hdr/.img

fmri数据分析图像格式及转换问题——基于spm讨论的更多相关文章

  1. fMRI数据分析处理原理及方法————转自网络

    fMRI数据分析处理原理及方法 来源: 整理文件的时候翻到的,来源已经找不到了囧感觉写得还是不错,贴在这里保存. 近年来,血氧水平依赖性磁共振脑功能成像(Blood oxygenation level ...

  2. 关于fmri数据分析的两大类,四种方法

    关于fmri数据分析的两大类,四种方法: 数据驱动: tca:其实这种方法,主要是提取时间维的特征.如果用它来进行数据的分析,则必须要利用其他的数据方法,比如结合ICA. ica:作为pca的一般化实 ...

  3. fMRI数据分析处理原理及方法(转载)

    原文地址:http://www.cnblogs.com/minks/p/4889497.html 近年来,血氧水平依赖性磁共振脑功能成像(Blood oxygenation level-depende ...

  4. fMRI数据分析处理原理及方法

    来源: 整理文件的时候翻到的,来源已经找不到了囧感觉写得还是不错,贴在这里保存. 近年来,血氧水平依赖性磁共振脑功能成像(Blood oxygenation level-dependent funct ...

  5. Hive数据分析——Spark是一种基于rdd(弹性数据集)的内存分布式并行处理框架,比于Hadoop将大量的中间结果写入HDFS,Spark避免了中间结果的持久化

    转自:http://blog.csdn.net/wh_springer/article/details/51842496 近十年来,随着Hadoop生态系统的不断完善,Hadoop早已成为大数据事实上 ...

  6. convert图像格式批量转换

    问题:利用GMT绘制生成了eps格式的图像,为了将图像插入到word中,且保持较高的分辨率,利用convert进行图像格式转换,将eps转换成tiff格式. code:  $i ${name}.tif ...

  7. Java 大小端转换(基于ByteBuffer)

    大小端的基础知识: 小端( little-endian):低位字节在前,高位字节在后.大端( Big-Endian),则反之.具体而言,就是为了说清楚,CPU架构1 字(word)中byte的存储顺序 ...

  8. Python图像处理库PIL中图像格式转换

    o 在数字图像处理中,针对不同的图像格式有其特定的处理算法.所以,在做图像处理之前,我们需要考虑清楚自己要基于哪种格式的图像进行算法设计及其实现.本文基于这个需求,使用python中的图像处理库PIL ...

  9. Python图像处理库PIL中图像格式转换(一)

    在数字图像处理中,针对不同的图像格式有其特定的处理算法. 所以,在做图像处理之前,我们须要考虑清楚自己要基于哪种格式的图像进行算法设计及事实上现.本文基于这个需求.使用python中的图像处理库PIL ...

随机推荐

  1. mysql 1709: Index column size too large. The maximum column size is 767 bytes.

    1709: Index column size too large. The maximum column size is 767 bytes. 修改排序规则解决 utf8_general_ci

  2. Spring,tk-mapper源码阅读

    Mybatis的源码学习(一): 前言: 结合spring本次学习会先从spring-mybatis开始分析 在学习mybatis之前,应该要对spring的bean有所了解,本文略过 先贴一下myb ...

  3. vue页面高度填充,不出现滚动条

    现在的需求是这样:vue单页工程化开发,上面有一个header,左边有一个侧边栏,右边内容展示.要求左边侧边栏的高度,要填充满整个页面(除了header外,header:height:60px)--如 ...

  4. Matcher匹配器查找字符串指定内容

    public static void main(String[] args) { String s = "我的手机号码是18988888888,曾经用过18987654321,还用过1881 ...

  5. 【python】日志系统

    来源: http://blog.csdn.net/wykgf/article/details/11576721 http://www.jb51.net/article/42626.htm http:/ ...

  6. [转载] 更改pip源至国内镜像,显著提升下载速度

    原文地址: https://blog.csdn.net/lambert310/article/details/52412059 经常在使用python的时候需要安装各种模块,而pip是很强大的模块安装 ...

  7. 【转】Jmeter-----函数引用和函数重定向

    详见内文

  8. 按书上的例子,写了个长的go代码

    用于实现快速排序和冒泡排序的东东. 包括了蛮多东西的实现,输入输出,字符串处理等.... bubblesort.go package bubblesort func BubbleSort(values ...

  9. 删除元素(LintCode)

    删除元素 给定一个数组和一个值,在原地删除与值相同的数字,返回新数组的长度. 元素的顺序可以改变,并且对新的数组不会有影响. 样例 给出一个数组 [0,4,4,0,0,2,4,4],和值 4 返回 4 ...

  10. ubuntu的boot分区报警,删除无用内核文件。

    1. 查看当前使用内核:uname -r4.4.0-97-generic 2. 查看安装的内核dpkg --list 'linux-image*' 3. 删除旧内核sudo apt-get remov ...