the comment lines of the blast tabular format
进行Blast比对,用参数-m 6 可以以列表的方式输出结果,结果中从左到右每一列的意义分别是:
[00] Query id
[01] Subject id
[02] % identity
[03] alignment length
[04] mismatches
[05] gap openings
[06] q. start
[07] q. end
[08] s. start
[09] s. end
[10] e-value
[11] bit score
the comment lines of the blast tabular format的更多相关文章
- blast | diamond 输出结果选择和解析 | 比对
之前的文章:构建NCBI本地BLAST数据库 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast构建索引 | makeblastdb 本地运行blast时,需要指定out fo ...
- 构建NCBI本地BLAST数据库 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast构建索引 | makeblastdb
参考链接: FTP README 如何下载 NCBI NR NT数据库? 下载blast:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+ 先了解 ...
- 比对软件Blast,Blast+,Diamond比较
1. Blast (1)格式化数据库 formatdb -i db.seq -p T -o T -l logfile 主要参数: -i 输入需要格式化的源数据库名称 -p 文件类型,是核苷酸序列数据库 ...
- Blast本地化
转载]Blast本地化:使用Blastall进行数据库比对 (2012-02-13 21:25:31) 用blastall进行序列比对 blastall是最常用的blast程序之一,其功能非常强大 ...
- Linux下BLAST的使用---转载
1.把BLAST的压缩文件解压,然后将bin目录下的文件拷贝至/usr/local/bin下:2.制作软链接,将解压后的文件中bin目录链接至/home/username下,eg:ln -s /hom ...
- blast+学习之search tools
search tools:blastn, blastp, blastx, tblastx, tblastn, psiblast, rpsblast, and rpstblastn 1.blastn: ...
- [Javascript] Logging Pretty-Printing Tabular Data to the Console
Learn how to use console.table to render arrays and objects in a tabular format for easy scanning ov ...
- 27、BLASTN的参数
转载:http://blog.sina.com.cn/s/blog_5ecfd9d90100ksui.html http://www.docin.com/p-704735699.html 与之前的bl ...
- RTP Tools
RTP Tools (Version 1.20) https://wiki.wireshark.org/RTP_statistics Here is a small example: Install ...
随机推荐
- 理解android.intent.action.MAIN 与 android.intent.category.LAUNCHER
刚才看了一下sundy的视频<LLY110426_Android应用程序启动>,里面讲到luncher这个activity通过获取应用程序信息来加载应用程序,显示给用户,其中就是通过一个应 ...
- avalon.js路由
之前自己写了一个AJAX加载页面的方法:有时候一个页面里面会分区域加载不同的东西(div,html),但是IE的回退按钮,就失去任何意义了: 这两天研究了一下avalon.js的路由: 需要准备: 1 ...
- django复习笔记2:models
关于models,主要想说的是django shell以及生成测试数据的脚本这两部分. 一个models中的类相当于数据库的一张表,先看一个设置了外键的models. from django.db i ...
- PAT 1005. 继续(3n+1)猜想 (25) JAVA
当我们验证卡拉兹猜想的时候,为了避免重复计算,可以记录下递推过程中遇到的每一个数.例如对n=3进行验证的时候,我们需要计算3.5.8.4.2.1,则当我们对n=5.8.4.2进行验证的时候,就可以直接 ...
- html代码中显示系统时间
可以显示系统的静态时间和动态时间 1,静态时间 <script type="text/javascript"> var myDate = new Date(); doc ...
- Web Api其中的PUT功能演示
Insus.NET这几天均在学习Web API知识,并练习.怎样获取数据,提交数据或是保存数据.你可以温习一下<Post model至Web Api创建或是保存数据>http://www. ...
- Html5 Egret游戏开发 成语大挑战(六)游戏界面构建和设计
本篇将主要讲解游戏界面的构建和设计,会应用到egret.eui的自定义组件,可以很直观的构建一个游戏整体,这里我们仍然只需要使用EgretWing就可以达到目的,本篇可能是篇幅最少的一个,但是涉及自定 ...
- js禁止用户右键等操作
<script type="text/javascript"> document.oncontextmenu=function(){return false}; ...
- cookie记住密码功能
很多门户网站都提供了记住密码功能,虽然现在的浏览器都已经提供了相应的记住密码功能 效果就是你每次进入登录页面后就不需要再进行用户名和密码的输入: 记住密码功能基本都是使用cookie来进行实现的,因此 ...
- Windows数据类型
WORD:16位无符号整形数据 DWORD:32字节无符号整型数据(DWORD32) DWORD64:64字节无符号整型数据 INT:32位有符号整型数据类型 INT_PTR:指向INT数据类型的指针 ...