进行Blast比对，用参数-m 6 可以以列表的方式输出结果，结果中从左到右每一列的意义分别是：

[00] Query id

[01] Subject id

[02] % identity

[03] alignment length

[04] mismatches

[05] gap openings

[06] q. start

[07] q. end

[08] s. start

[09] s. end

[10] e-value

[11] bit score

the comment lines of the blast tabular format的更多相关文章

  1. blast | diamond 输出结果选择和解析 | 比对

    之前的文章:构建NCBI本地BLAST数据库 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast构建索引 | makeblastdb 本地运行blast时,需要指定out fo ...

  2. 构建NCBI本地BLAST数据库 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast构建索引 | makeblastdb

    参考链接: FTP README 如何下载 NCBI NR NT数据库? 下载blast:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+ 先了解 ...

  3. 比对软件Blast，Blast+，Diamond比较

    1. Blast (1)格式化数据库 formatdb -i db.seq -p T -o T -l logfile 主要参数: -i 输入需要格式化的源数据库名称 -p 文件类型,是核苷酸序列数据库 ...

  4. Blast本地化

    转载]Blast本地化:使用Blastall进行数据库比对 (2012-02-13 21:25:31)   用blastall进行序列比对 blastall是最常用的blast程序之一,其功能非常强大 ...

  5. Linux下BLAST的使用---转载

    1.把BLAST的压缩文件解压,然后将bin目录下的文件拷贝至/usr/local/bin下:2.制作软链接,将解压后的文件中bin目录链接至/home/username下,eg:ln -s /hom ...

  6. blast+学习之search tools

    search tools:blastn, blastp, blastx, tblastx, tblastn, psiblast, rpsblast, and rpstblastn 1.blastn: ...

  7. [Javascript] Logging Pretty-Printing Tabular Data to the Console

    Learn how to use console.table to render arrays and objects in a tabular format for easy scanning ov ...

  8. 27、BLASTN的参数

    转载:http://blog.sina.com.cn/s/blog_5ecfd9d90100ksui.html http://www.docin.com/p-704735699.html 与之前的bl ...

  9. RTP Tools

    RTP Tools (Version 1.20) https://wiki.wireshark.org/RTP_statistics Here is a small example: Install ...

随机推荐

  1. gitlab两种连接方式:ssh和http配置介绍

    gitlab环境部署好后,创建project工程,在本地或远程下载gitlab代码,有两种方式:ssh和http (1)ssh方式:这是一种相对安全的方式 这要求将本地的公钥上传到gitlab中,如下 ...

  2. 获取iTextSharp 的image 报错

    获取itextsharp类库的image对象的时候报错  outofmemory  .经过艰苦的测试发现jpeg类型是可行的的 iTextSharp.text.Image je = iTextShar ...

  3. ASP.NET中获取当日，当周，当月，当年的日期

     ASP.NET中获取当日,当周,当月,当年的日期 在ASP.NET开发中,经常会碰到要获取当日,当周,当月,当年的日期. 以下将源码贴出来和大家分享. aspx中代码如下: <table ce ...

  4. Kth Smallest Element in a BST

    Given a binary search tree, write a function kthSmallest to find the kth smallest element in it. Not ...

  5. codevs1910 递归函数

    难度等级:黄金 codevs1910 递归函数 题目描述 Description 对于一个递归函数w(a, b, c). 如果a <= 0 or b <= 0 or c <= 0就返 ...

  6. Windows 提高效率的常用快捷键

    开发中减少使用鼠标次数,是一个很cool的体验!下面的快捷键在Win7上测试有效 快捷键 说明 Ctrl+Shift+N 创建一个新的文件夹. (Ctrl + N  打开桌面) Ctrl+Shift+ ...

  7. easyui layout 折叠后显示标题

    (function($){ var buttonDir = {north:'down',south:'up',east:'left',west:'right'}; $.extend($.fn.layo ...

  8. c++ this *this

    在一个类里每个成员函数都有一个this指针.this指针指向调用对象.如果方法需要引用整个调用 对象可以使用*this.this是对象的地址,而不是对象本身. *this是对象本身.可以将*this ...

  9. Javascript中判断数组的正确姿势

    在 Javascript 中,如何判断一个变量是否是数组? 最好的方式是用 ES5 提供的 Array.isArray() 方法(毕竟原生的才是最屌的): var a = [0, 1, 2]; con ...

  10. .NET Core VS Code 环境配置

    VSCode .NET环境配置     在此之前我一直是使用notepad++配置的C/C#环境来写代码,比起打开"笨重"的VS要方便很多.VSCode出来之后,本来也想折腾了一下 ...