进行Blast比对,用参数-m 6 可以以列表的方式输出结果,结果中从左到右每一列的意义分别是:

[00] Query id

[01] Subject id

[02] % identity

[03] alignment length

[04] mismatches

[05] gap openings

[06] q. start

[07] q. end

[08] s. start

[09] s. end

[10] e-value

[11] bit score

the comment lines of the blast tabular format的更多相关文章

  1. blast | diamond 输出结果选择和解析 | 比对

    之前的文章:构建NCBI本地BLAST数据库 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast构建索引 | makeblastdb 本地运行blast时,需要指定out fo ...

  2. 构建NCBI本地BLAST数据库 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast构建索引 | makeblastdb

    参考链接: FTP README 如何下载 NCBI NR NT数据库? 下载blast:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+ 先了解 ...

  3. 比对软件Blast,Blast+,Diamond比较

    1. Blast (1)格式化数据库 formatdb -i db.seq -p T -o T -l logfile 主要参数: -i 输入需要格式化的源数据库名称 -p 文件类型,是核苷酸序列数据库 ...

  4. Blast本地化

    转载]Blast本地化:使用Blastall进行数据库比对 (2012-02-13 21:25:31)   用blastall进行序列比对 blastall是最常用的blast程序之一,其功能非常强大 ...

  5. Linux下BLAST的使用---转载

    1.把BLAST的压缩文件解压,然后将bin目录下的文件拷贝至/usr/local/bin下:2.制作软链接,将解压后的文件中bin目录链接至/home/username下,eg:ln -s /hom ...

  6. blast+学习之search tools

    search tools:blastn, blastp, blastx, tblastx, tblastn, psiblast, rpsblast, and rpstblastn 1.blastn: ...

  7. [Javascript] Logging Pretty-Printing Tabular Data to the Console

    Learn how to use console.table to render arrays and objects in a tabular format for easy scanning ov ...

  8. 27、BLASTN的参数

    转载:http://blog.sina.com.cn/s/blog_5ecfd9d90100ksui.html http://www.docin.com/p-704735699.html 与之前的bl ...

  9. RTP Tools

    RTP Tools (Version 1.20) https://wiki.wireshark.org/RTP_statistics Here is a small example: Install ...

随机推荐

  1. http协议(一)基础知识

    我自己写的随笔一般是偏学习笔记性质的,或者一点个人理解,适合新人,大牛可以忽略这个...... 参考书籍——<图解http> 当我们在浏览器的地址栏中输入网址,然后点击回车,接着,浏览器就 ...

  2. JS的递归与TCO尾调用优化

    转自:https://segmentfault.com/a/1190000004018047 这两天搜了下JS递归的相关文章, 觉得这篇文章很不错, 就顺手翻译了下,也算给自己做个笔记,题目是我自己加 ...

  3. 在Java代码中使用pdfBox将PDF转换为图片

    生成图片 // 生成图片 PDDocument pd = PDDocument.load(new File(filePath)); PDFRenderer pdfRenderer = new PDFR ...

  4. Centos5.8 iptables管理

    使用第三方提供的Centos5.8 vmx安装的虚拟机实例, 在安装Tomcat时发现启动后8080端口无法访问, 先检查是否selinux作了限制 查看selinux状态: sestatus 查看s ...

  5. DefaultFilesMiddleware中间件如何显示默认页面

    DefaultFilesMiddleware中间件如何显示默认页面 DefaultFilesMiddleware中间件的目的在于将目标目录下的默认文件作为响应内容.我们知道,如果直接请求的就是这个默认 ...

  6. C# 多重overide

    overide 是覆盖的意思,用在且仅用在虚函数上,虚函数可以是virtual或abstract修饰的,或者是overide修饰的. 文档大概是这么说的. 由此知道,由overide修饰的函数都是虚函 ...

  7. PRML读书会第十四章 Combining Models(committees,Boosting,AdaBoost,决策树,条件混合模型)

    主讲人 网神 (新浪微博: @豆角茄子麻酱凉面) 网神(66707180) 18:57:18 大家好,今天我们讲一下第14章combining models,这一章是联合模型,通过将多个模型以某种形式 ...

  8. 每一个C#开发者必须知道的13件事情

    1.开发流程 程序的Bug与瑕疵往往出现于开发流程当中.只要对工具善加利用,就有助于在你发布程序之前便将问题发现,或避开这些问题. 标准化代码书写 标准化代码书写可以使代码更加易于维护,尤其是在代码由 ...

  9. MVC 中的 ispostback

    总之呢就是在MVC中试下 ispostback那种效果, 环境就是:登录验证loinger, if (Request.HttpMethod == "POST"){} 没理解透彻 源 ...

  10. iOS 自定义NavigationBar右侧按钮rightBarButtonItem--button

    //两个按钮的父类view UIView *rightButtonView = [[UIView alloc] initWithFrame:CGRectMake(, , , )]; //历史浏览按钮 ...