进行Blast比对,用参数-m 6 可以以列表的方式输出结果,结果中从左到右每一列的意义分别是:

[00] Query id

[01] Subject id

[02] % identity

[03] alignment length

[04] mismatches

[05] gap openings

[06] q. start

[07] q. end

[08] s. start

[09] s. end

[10] e-value

[11] bit score

the comment lines of the blast tabular format的更多相关文章

  1. blast | diamond 输出结果选择和解析 | 比对

    之前的文章:构建NCBI本地BLAST数据库 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast构建索引 | makeblastdb 本地运行blast时,需要指定out fo ...

  2. 构建NCBI本地BLAST数据库 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast构建索引 | makeblastdb

    参考链接: FTP README 如何下载 NCBI NR NT数据库? 下载blast:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+ 先了解 ...

  3. 比对软件Blast,Blast+,Diamond比较

    1. Blast (1)格式化数据库 formatdb -i db.seq -p T -o T -l logfile 主要参数: -i 输入需要格式化的源数据库名称 -p 文件类型,是核苷酸序列数据库 ...

  4. Blast本地化

    转载]Blast本地化:使用Blastall进行数据库比对 (2012-02-13 21:25:31)   用blastall进行序列比对 blastall是最常用的blast程序之一,其功能非常强大 ...

  5. Linux下BLAST的使用---转载

    1.把BLAST的压缩文件解压,然后将bin目录下的文件拷贝至/usr/local/bin下:2.制作软链接,将解压后的文件中bin目录链接至/home/username下,eg:ln -s /hom ...

  6. blast+学习之search tools

    search tools:blastn, blastp, blastx, tblastx, tblastn, psiblast, rpsblast, and rpstblastn 1.blastn: ...

  7. [Javascript] Logging Pretty-Printing Tabular Data to the Console

    Learn how to use console.table to render arrays and objects in a tabular format for easy scanning ov ...

  8. 27、BLASTN的参数

    转载:http://blog.sina.com.cn/s/blog_5ecfd9d90100ksui.html http://www.docin.com/p-704735699.html 与之前的bl ...

  9. RTP Tools

    RTP Tools (Version 1.20) https://wiki.wireshark.org/RTP_statistics Here is a small example: Install ...

随机推荐

  1. Lambda表达式详解(转载)

    原文链接:http://www.cnblogs.com/knowledgesea/p/3163725.html lambda简介 lambda运算符:所有的lambda表达式都是用新的lambda运算 ...

  2. C#.NET 大型通用信息化系统集成快速开发平台 4.0 版本 - 组织机构的名称编号是否允许重复?

    通常情况下,一个公司内部的部门名称,编号是不可能重复的.但是是在多公司的情况下,很可能有部门名称重复的问题存在,这时需要允许部门名称重复. 例如一个大型IT公司,在2个地区都有研发部或者客户服务部,这 ...

  3. NFine的后台源码

    Chloe官网及基于NFine的后台源码毫无保留开放   扯淡 经过不少日夜的赶工,Chloe 的官网于上周正式上线.上篇博客中LZ说过要将官网以及后台源码都会开放出来,为了尽快兑现我说过的话,趁周末 ...

  4. Linux system函数详解

    system 功能:system()函数调用"/bin/sh -c command"执行特定的命令,阻塞当前进程直到command命令执行完毕 原型 int system(cons ...

  5. Oracle 创建 split 和 splitstr 函数

    Sql语句最好依次执行创建 /************************************** * name:        split * author:      sean zhang ...

  6. 用python代码做configure文件

    在lua中,我一直用lua作为config文件,或者承载数据的文件 - 好处是lua本身就很好阅读,然后无需额外写解析的代码,还支持在configure文件中读环境变量,条件判断等,方便又强大! (在 ...

  7. 关于code reiview

    先谈谈三个code review的关键因素: 一.创建review要简单 code reivew是一个程序员日常工作中经常做的一件事,理论上来讲,任何一个将要submit到SCM的change,都必须 ...

  8. 各地IT薪资待遇讨论

    作为一个搞.net开发的程序员,在北京混了三年半,最近准备辞职到上海找工作.由于对上海的IT行业还不是很了解,在这里想让上海的同行们说下你们的情况,以方便我对自己在上海的定位,当然,其余城市的的同行们 ...

  9. Tyk API网关介绍及安装说明

    Tyk API网关介绍及安装说明 Tyk是一个开源的轻量级API网关程序. 什么是API网关 API网关是一个各类不同API的前置服务器.API网关封装了系统内部架构,对外提供统一服务.此外还可以实现 ...

  10. Web软件安全攻击