进行Blast比对，用参数-m 6 可以以列表的方式输出结果，结果中从左到右每一列的意义分别是：

[00] Query id

[01] Subject id

[02] % identity

[03] alignment length

[04] mismatches

[05] gap openings

[06] q. start

[07] q. end

[08] s. start

[09] s. end

[10] e-value

[11] bit score

the comment lines of the blast tabular format的更多相关文章

  1. blast | diamond 输出结果选择和解析 | 比对

    之前的文章:构建NCBI本地BLAST数据库 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast构建索引 | makeblastdb 本地运行blast时,需要指定out fo ...

  2. 构建NCBI本地BLAST数据库 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast构建索引 | makeblastdb

    参考链接: FTP README 如何下载 NCBI NR NT数据库? 下载blast:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+ 先了解 ...

  3. 比对软件Blast，Blast+，Diamond比较

    1. Blast (1)格式化数据库 formatdb -i db.seq -p T -o T -l logfile 主要参数: -i 输入需要格式化的源数据库名称 -p 文件类型,是核苷酸序列数据库 ...

  4. Blast本地化

    转载]Blast本地化:使用Blastall进行数据库比对 (2012-02-13 21:25:31)   用blastall进行序列比对 blastall是最常用的blast程序之一,其功能非常强大 ...

  5. Linux下BLAST的使用---转载

    1.把BLAST的压缩文件解压,然后将bin目录下的文件拷贝至/usr/local/bin下:2.制作软链接,将解压后的文件中bin目录链接至/home/username下,eg:ln -s /hom ...

  6. blast+学习之search tools

    search tools:blastn, blastp, blastx, tblastx, tblastn, psiblast, rpsblast, and rpstblastn 1.blastn: ...

  7. [Javascript] Logging Pretty-Printing Tabular Data to the Console

    Learn how to use console.table to render arrays and objects in a tabular format for easy scanning ov ...

  8. 27、BLASTN的参数

    转载:http://blog.sina.com.cn/s/blog_5ecfd9d90100ksui.html http://www.docin.com/p-704735699.html 与之前的bl ...

  9. RTP Tools

    RTP Tools (Version 1.20) https://wiki.wireshark.org/RTP_statistics Here is a small example: Install ...

随机推荐

  1. javascript中String的fromCharCode()方法

    前几天遇到一个bug,后端的模板引擎在输出形如: <div title="111 aaa">内容</div> 这样的内容时,无法输出' '空格,所以只能用' ...

  2. angular的uiRouter服务学习(5) --- $state.includes()方法

    $state.includes方法用于判断当前激活状态是否是指定的状态或者是指定状态的子状态. $state.includes(stateOrName,params,options) $state.i ...

  3. checkbox与jq<转>

    题:经常使用jQuery插件的attr方法获取checked属性值,获取的值的大小为未定义,此时可以用prop方法获取其真实值,下面介绍这两种方法的区别: 1.通过prop方法获取checked属性, ...

  4. 使用SecureCRT连接AWS EC2

    AWS提供的XXX.pem文件, 如果使用Ubuntu等linux系统,直接使用ssh命令即可访问AWS上的Linux-EC2实例. $ ssh -i XXX.pem ec2-user@{IP/hos ...

  5. Java设计模式之-----工厂模式(简单工厂，抽象工厂)

    一.工厂模式主要是为创建对象提供过渡接口,以便将创建对象的具体过程屏蔽隔离起来,达到提高灵活性的目的. 工厂模式在<Java与模式>中分为三类:1)简单工厂模式(Simple Factor ...

  6. VS2010 生成Xml格式的注释文档

    项目, 属性, build, 勾选xml document file, 重新build, 即可生成xml注释文件, 然后还得找工具软件(看到anytao推荐SandCastle) 生成更易读的帮助文档 ...

  7. [转]Python 命令行参数和getopt模块详解

    FROM : http://www.tuicool.com/articles/jaqQvq 有时候我们需要写一些脚本处理一些任务,这时候往往需要提供一些命令行参数,根据不同参数进行不同的处理,在Pyt ...

  8. 关于NOIP2016与NOI2018

    NOIP2016惨淡收场了,距离省一还有相当一大段距离,省队更是差了十条街去了,不过没关系. 既然已经对信息学产生了兴趣,竞赛无疑是最好的锻炼场所. 路是自己选择的,伤痕累累也要走下去. 还有一年,事 ...

  9. SQL Server对Xml字段的操作

    T-Sql操作Xml数据 一.前言 SQL Server 2005 引入了一种称为 XML 的本机数据类型.用户可以创建这样的表,它在关系列之外还有一个或多个 XML 类型的列:此外,还允许带有变量和 ...

  10. 航空货运：运价类别Rate Class

    1．普通货物运价(1)基础运价(代号N -注:Normal的首字母)民航总局统一规定各航段货物基础运价为45公斤以下普通货物运价.(2)重量分界点运价(代号Q  -注:Quantity的首字母)国内航 ...