the comment lines of the blast tabular format
进行Blast比对,用参数-m 6 可以以列表的方式输出结果,结果中从左到右每一列的意义分别是:
[00] Query id
[01] Subject id
[02] % identity
[03] alignment length
[04] mismatches
[05] gap openings
[06] q. start
[07] q. end
[08] s. start
[09] s. end
[10] e-value
[11] bit score
the comment lines of the blast tabular format的更多相关文章
- blast | diamond 输出结果选择和解析 | 比对
之前的文章:构建NCBI本地BLAST数据库 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast构建索引 | makeblastdb 本地运行blast时,需要指定out fo ...
- 构建NCBI本地BLAST数据库 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast构建索引 | makeblastdb
参考链接: FTP README 如何下载 NCBI NR NT数据库? 下载blast:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+ 先了解 ...
- 比对软件Blast,Blast+,Diamond比较
1. Blast (1)格式化数据库 formatdb -i db.seq -p T -o T -l logfile 主要参数: -i 输入需要格式化的源数据库名称 -p 文件类型,是核苷酸序列数据库 ...
- Blast本地化
转载]Blast本地化:使用Blastall进行数据库比对 (2012-02-13 21:25:31) 用blastall进行序列比对 blastall是最常用的blast程序之一,其功能非常强大 ...
- Linux下BLAST的使用---转载
1.把BLAST的压缩文件解压,然后将bin目录下的文件拷贝至/usr/local/bin下:2.制作软链接,将解压后的文件中bin目录链接至/home/username下,eg:ln -s /hom ...
- blast+学习之search tools
search tools:blastn, blastp, blastx, tblastx, tblastn, psiblast, rpsblast, and rpstblastn 1.blastn: ...
- [Javascript] Logging Pretty-Printing Tabular Data to the Console
Learn how to use console.table to render arrays and objects in a tabular format for easy scanning ov ...
- 27、BLASTN的参数
转载:http://blog.sina.com.cn/s/blog_5ecfd9d90100ksui.html http://www.docin.com/p-704735699.html 与之前的bl ...
- RTP Tools
RTP Tools (Version 1.20) https://wiki.wireshark.org/RTP_statistics Here is a small example: Install ...
随机推荐
- ES5特性之Object.freeze
Object.freeze方法比Object.seal方法更严格,不仅不能扩展新对象和不可重新配置属性的特性,还不能改变对象属性的值writable(不可写)
- mysql连接数设置操作(Too many connections)
mysql在使用过程中,发现连接数超了~~~~ [root@linux-node1 ~]# mysql -u glance -h 192.168.1.17 -pEnter password: ERRO ...
- Linux收集
1.rsync快速删除文件 rsync --delete -avH /empty /rmdir 选项说明: –delete-before 接收者在传输之前进行删除操作 –progress 在传输时显示 ...
- CastleActiveRecord在多线程 事务提交时数据库资源竞争导致更新失败的测试结果记录
CastleActiveRecord 经过测试,隔离级别: // 摘要: , , , , , , , ...
- C#以post方式调用struts rest-plugin service的问题
struts2: 玩转 rest-plugin一文中,学习了用struts2开发restful service的方法,发现用c#以post方式调用时各种报错,但java.ajax,包括firefox ...
- 前端见微知著工具篇:Grunt实现自动化
转载说明 本篇文章为转载文章,来源为[前端福利]用grunt搭建自动化的web前端开发环境-完整教程,之所以转载,是因为本文写的太详细了,我很想自己来写,但是发现跳不出这篇文章的圈子,因为写的详尽,所 ...
- [C语言]一个很实用的服务端和客户端进行UDP通信的实例
前段时间发了个TCP通信的例子,现在再来一个UDP通信的例子.这些可以作为样本程序,用到开发中.“裸写”socket老是记不住步骤,经常被鄙视…… 下面的例子很简单,写一个UDP的server用于收包 ...
- winform程序自动升级
可参考下面这个链接,描述挺详细的,下次用的时候试试,感谢牛逼的作者. http://www.fishlee.net/soft/simple_autoupdater/
- Bootstrap系列 -- 43. 固定导航条
很多情况之一,设计师希望导航条固定在浏览器顶部或底部,这种固定式导航条的应用在移动端开发中更为常见.Bootstrap框架提供了两种固定导航条的方式: .navbar-fixed-top:导航条固定 ...
- 用程序集编写clr表值函数:把正则表达式引入数据库中
正则表达式非常好,但在数据库中就是没有,但可以通过程序集方式扩展 先编写一个dll,标量函数很好写,表值函数麻烦一点 下面是C#代码 using System; using System.Data; ...