进行Blast比对,用参数-m 6 可以以列表的方式输出结果,结果中从左到右每一列的意义分别是:

[00] Query id

[01] Subject id

[02] % identity

[03] alignment length

[04] mismatches

[05] gap openings

[06] q. start

[07] q. end

[08] s. start

[09] s. end

[10] e-value

[11] bit score

the comment lines of the blast tabular format的更多相关文章

  1. blast | diamond 输出结果选择和解析 | 比对

    之前的文章:构建NCBI本地BLAST数据库 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast构建索引 | makeblastdb 本地运行blast时,需要指定out fo ...

  2. 构建NCBI本地BLAST数据库 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast构建索引 | makeblastdb

    参考链接: FTP README 如何下载 NCBI NR NT数据库? 下载blast:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+ 先了解 ...

  3. 比对软件Blast,Blast+,Diamond比较

    1. Blast (1)格式化数据库 formatdb -i db.seq -p T -o T -l logfile 主要参数: -i 输入需要格式化的源数据库名称 -p 文件类型,是核苷酸序列数据库 ...

  4. Blast本地化

    转载]Blast本地化:使用Blastall进行数据库比对 (2012-02-13 21:25:31)   用blastall进行序列比对 blastall是最常用的blast程序之一,其功能非常强大 ...

  5. Linux下BLAST的使用---转载

    1.把BLAST的压缩文件解压,然后将bin目录下的文件拷贝至/usr/local/bin下:2.制作软链接,将解压后的文件中bin目录链接至/home/username下,eg:ln -s /hom ...

  6. blast+学习之search tools

    search tools:blastn, blastp, blastx, tblastx, tblastn, psiblast, rpsblast, and rpstblastn 1.blastn: ...

  7. [Javascript] Logging Pretty-Printing Tabular Data to the Console

    Learn how to use console.table to render arrays and objects in a tabular format for easy scanning ov ...

  8. 27、BLASTN的参数

    转载:http://blog.sina.com.cn/s/blog_5ecfd9d90100ksui.html http://www.docin.com/p-704735699.html 与之前的bl ...

  9. RTP Tools

    RTP Tools (Version 1.20) https://wiki.wireshark.org/RTP_statistics Here is a small example: Install ...

随机推荐

  1. 借助91助手,将ibook中的pdf文件拷贝至其它的pdf阅读器中(ios设备无需越狱)

    有时候在使用ios自带的ibook阅读pdf文件的时候,会发现ibook有些功能并不是那么方便.最近我就遇到了一例,我想在ibook中放一本比较大的pdf书,页数有几百吧,pdf文件本身每一章节都是有 ...

  2. js物理弹性窗口

    js物理弹性窗口 点击下载代码

  3. PAT 1005. 继续(3n+1)猜想 (25)

    卡拉兹(Callatz)猜想已经在1001中给出了描述.在这个题目里,情况稍微有些复杂. 当我们验证卡拉兹猜想的时候,为了避免重复计算,可以记录下递推过程中遇到的每一个数.例如对n=3进行验证的时候, ...

  4. 047医疗项目-模块四:采购单模块—采购单审核提交(Dao,Service,Action三层)

    我们之前把采购单都审核了,这篇文章说的就是审核之后提交. 其实就是改变(update)采购单的审核状态. 需求: 用户要先查看采购单的内容. 查看采购单页面:页面布局同采购单修改页面. 选择审核结果. ...

  5. 搜索引擎关键词劫持之.net篇

    摘要:蛋疼写的,有需要的就拿去,注意要保存为Global.asax. 重要说明:为避免编码问题,请在劫持页面(data_url)指向页面加入meta标记来指明编码,如 meta content=tex ...

  6. 【MySQL】使用trim函数删除两侧字符

    第一个LEADING,可以删除左侧指定的字符以及字符串 SELECT trim(LEADING '/' FROM `path`) 第二个TRAILING,可以删除右侧的指定字符以及字符串 SELECT ...

  7. ASP.NET Web API Help Pages using Swagger

    Understanding the various methods of an API can be a challenge for a developer when building a consu ...

  8. 漫谈 Java 实例化类

    Java 中实例化类的动作,你是否还是一成不变 new 对应对象呢? 经手的项目多了,代码编写量自然会增加,渐渐的会对设计模式产生感觉. 怎样使书写出来的类实例化动作,高内聚,低耦合,又兼具一定的扩展 ...

  9. Java 基础【08】.class getClass () forName() 详解

    类名.class是Class对象的句柄,每个被加载的类,在jvm中都会有一个Class对象与之相对应. 如果要创建新的对象,直接使用Class对象的局部class.forName就可以了,不需要用ne ...

  10. Theano2.1.10-基础知识之循环

    来自:http://deeplearning.net/software/theano/tutorial/loop.html loop 一.Scan 一个递归的通常的形式,可以用来作为循环语句. 约间和 ...