the comment lines of the blast tabular format
进行Blast比对,用参数-m 6 可以以列表的方式输出结果,结果中从左到右每一列的意义分别是:
[00] Query id
[01] Subject id
[02] % identity
[03] alignment length
[04] mismatches
[05] gap openings
[06] q. start
[07] q. end
[08] s. start
[09] s. end
[10] e-value
[11] bit score
the comment lines of the blast tabular format的更多相关文章
- blast | diamond 输出结果选择和解析 | 比对
之前的文章:构建NCBI本地BLAST数据库 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast构建索引 | makeblastdb 本地运行blast时,需要指定out fo ...
- 构建NCBI本地BLAST数据库 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast构建索引 | makeblastdb
参考链接: FTP README 如何下载 NCBI NR NT数据库? 下载blast:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+ 先了解 ...
- 比对软件Blast,Blast+,Diamond比较
1. Blast (1)格式化数据库 formatdb -i db.seq -p T -o T -l logfile 主要参数: -i 输入需要格式化的源数据库名称 -p 文件类型,是核苷酸序列数据库 ...
- Blast本地化
转载]Blast本地化:使用Blastall进行数据库比对 (2012-02-13 21:25:31) 用blastall进行序列比对 blastall是最常用的blast程序之一,其功能非常强大 ...
- Linux下BLAST的使用---转载
1.把BLAST的压缩文件解压,然后将bin目录下的文件拷贝至/usr/local/bin下:2.制作软链接,将解压后的文件中bin目录链接至/home/username下,eg:ln -s /hom ...
- blast+学习之search tools
search tools:blastn, blastp, blastx, tblastx, tblastn, psiblast, rpsblast, and rpstblastn 1.blastn: ...
- [Javascript] Logging Pretty-Printing Tabular Data to the Console
Learn how to use console.table to render arrays and objects in a tabular format for easy scanning ov ...
- 27、BLASTN的参数
转载:http://blog.sina.com.cn/s/blog_5ecfd9d90100ksui.html http://www.docin.com/p-704735699.html 与之前的bl ...
- RTP Tools
RTP Tools (Version 1.20) https://wiki.wireshark.org/RTP_statistics Here is a small example: Install ...
随机推荐
- LazyInitializationException: could not initialize proxy no session
这完全是框架设计者的锅,讲道理 无论是SSH SSM都太重了, Hibernate几乎把SQL完全封装了一遍,简单的一对多关系,如果开启LazyLoad 这样实体类会被代理,直到访问这个多方实体的属 ...
- 利用substring()方法,把一个表的不同分级所对应的字段名取出来。
实例:现在有一个物料分类的表.知道表的第四级的值,要取前面的2,3级值. 例如,如图所示: 可以通过取前面几个字段的值,得到对应级别的值.利用substring(),但是因为要写在一句话里. 因此可以 ...
- js的scroll详解
scrollTop : 滚动条滚动距离 说明:chrome下他会以为滚动条是文档元素的,所以需要做兼容 ...
- js双层动画幻灯
js双层动画幻灯 点击下载
- Java集合系列:-----------04fail-fast总结(通过ArrayList来说明fail-fast的原理以及解决办法)
前面,我们已经学习了ArrayList.接下来,我们以ArrayList为例,对Iterator的fail-fast机制进行了解.内容包括::1 fail-fast简介2 fail-fast示例3 f ...
- IE浏览器下ajax缓存导致数据不更新的解决方法
摘自:http://www.iefans.net/ie-ajax-json-shuju-huancun/ 最近做设计的时候遇到一个小问题,当你用jquery的getjson函数从后台获取数据的时候,I ...
- Android动画学习笔记-Android Animation
Android动画学习笔记-Android Animation 3.0以前,android支持两种动画模式,tween animation,frame animation,在android3.0中 ...
- 目录结构-内置(AJAX)帮助文档
Discuz common.js 内置(AJAX)函数帮助文档 作者:cr180 / 整理日期:1970-01-01 / 个人站点:www.cr180.com / Discuz超级管家 showMen ...
- 本地的html怎么直接通过路径就读取本地文件。
我要做的事情是已知一个目录的相对路径,获得这个路径下面所有的txt文件,然后读到一个JS Script里面做下一步处理. 网上的例子都是使用input的,既然我是local的html文件,也知道路径了 ...
- c++ 头文件
可以将程序分为二部分: 头文件:包含结构声明和使用这些结构的函数的原型 源代码文件: 包含与结构有关的函数的代码 不要将函数的定义或变量的声明放在头文件里, 一般头文件可以包含以下内容 >函数原 ...