进行Blast比对,用参数-m 6 可以以列表的方式输出结果,结果中从左到右每一列的意义分别是:

[00] Query id

[01] Subject id

[02] % identity

[03] alignment length

[04] mismatches

[05] gap openings

[06] q. start

[07] q. end

[08] s. start

[09] s. end

[10] e-value

[11] bit score

the comment lines of the blast tabular format的更多相关文章

  1. blast | diamond 输出结果选择和解析 | 比对

    之前的文章:构建NCBI本地BLAST数据库 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast构建索引 | makeblastdb 本地运行blast时,需要指定out fo ...

  2. 构建NCBI本地BLAST数据库 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast构建索引 | makeblastdb

    参考链接: FTP README 如何下载 NCBI NR NT数据库? 下载blast:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+ 先了解 ...

  3. 比对软件Blast,Blast+,Diamond比较

    1. Blast (1)格式化数据库 formatdb -i db.seq -p T -o T -l logfile 主要参数: -i 输入需要格式化的源数据库名称 -p 文件类型,是核苷酸序列数据库 ...

  4. Blast本地化

    转载]Blast本地化:使用Blastall进行数据库比对 (2012-02-13 21:25:31)   用blastall进行序列比对 blastall是最常用的blast程序之一,其功能非常强大 ...

  5. Linux下BLAST的使用---转载

    1.把BLAST的压缩文件解压,然后将bin目录下的文件拷贝至/usr/local/bin下:2.制作软链接,将解压后的文件中bin目录链接至/home/username下,eg:ln -s /hom ...

  6. blast+学习之search tools

    search tools:blastn, blastp, blastx, tblastx, tblastn, psiblast, rpsblast, and rpstblastn 1.blastn: ...

  7. [Javascript] Logging Pretty-Printing Tabular Data to the Console

    Learn how to use console.table to render arrays and objects in a tabular format for easy scanning ov ...

  8. 27、BLASTN的参数

    转载:http://blog.sina.com.cn/s/blog_5ecfd9d90100ksui.html http://www.docin.com/p-704735699.html 与之前的bl ...

  9. RTP Tools

    RTP Tools (Version 1.20) https://wiki.wireshark.org/RTP_statistics Here is a small example: Install ...

随机推荐

  1. LazyInitializationException: could not initialize proxy no session

    这完全是框架设计者的锅,讲道理  无论是SSH SSM都太重了, Hibernate几乎把SQL完全封装了一遍,简单的一对多关系,如果开启LazyLoad 这样实体类会被代理,直到访问这个多方实体的属 ...

  2. 利用substring()方法,把一个表的不同分级所对应的字段名取出来。

    实例:现在有一个物料分类的表.知道表的第四级的值,要取前面的2,3级值. 例如,如图所示: 可以通过取前面几个字段的值,得到对应级别的值.利用substring(),但是因为要写在一句话里. 因此可以 ...

  3. js的scroll详解

    scrollTop : 滚动条滚动距离        说明:chrome下他会以为滚动条是文档元素的,所以需要做兼容                                           ...

  4. js双层动画幻灯

    js双层动画幻灯 点击下载

  5. Java集合系列:-----------04fail-fast总结(通过ArrayList来说明fail-fast的原理以及解决办法)

    前面,我们已经学习了ArrayList.接下来,我们以ArrayList为例,对Iterator的fail-fast机制进行了解.内容包括::1 fail-fast简介2 fail-fast示例3 f ...

  6. IE浏览器下ajax缓存导致数据不更新的解决方法

    摘自:http://www.iefans.net/ie-ajax-json-shuju-huancun/ 最近做设计的时候遇到一个小问题,当你用jquery的getjson函数从后台获取数据的时候,I ...

  7. Android动画学习笔记-Android Animation

    Android动画学习笔记-Android Animation   3.0以前,android支持两种动画模式,tween animation,frame animation,在android3.0中 ...

  8. 目录结构-内置(AJAX)帮助文档

    Discuz common.js 内置(AJAX)函数帮助文档 作者:cr180 / 整理日期:1970-01-01 / 个人站点:www.cr180.com / Discuz超级管家 showMen ...

  9. 本地的html怎么直接通过路径就读取本地文件。

    我要做的事情是已知一个目录的相对路径,获得这个路径下面所有的txt文件,然后读到一个JS Script里面做下一步处理. 网上的例子都是使用input的,既然我是local的html文件,也知道路径了 ...

  10. c++ 头文件

    可以将程序分为二部分: 头文件:包含结构声明和使用这些结构的函数的原型 源代码文件: 包含与结构有关的函数的代码 不要将函数的定义或变量的声明放在头文件里, 一般头文件可以包含以下内容 >函数原 ...