进行Blast比对,用参数-m 6 可以以列表的方式输出结果,结果中从左到右每一列的意义分别是:

[00] Query id

[01] Subject id

[02] % identity

[03] alignment length

[04] mismatches

[05] gap openings

[06] q. start

[07] q. end

[08] s. start

[09] s. end

[10] e-value

[11] bit score

the comment lines of the blast tabular format的更多相关文章

  1. blast | diamond 输出结果选择和解析 | 比对

    之前的文章:构建NCBI本地BLAST数据库 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast构建索引 | makeblastdb 本地运行blast时,需要指定out fo ...

  2. 构建NCBI本地BLAST数据库 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast构建索引 | makeblastdb

    参考链接: FTP README 如何下载 NCBI NR NT数据库? 下载blast:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+ 先了解 ...

  3. 比对软件Blast,Blast+,Diamond比较

    1. Blast (1)格式化数据库 formatdb -i db.seq -p T -o T -l logfile 主要参数: -i 输入需要格式化的源数据库名称 -p 文件类型,是核苷酸序列数据库 ...

  4. Blast本地化

    转载]Blast本地化:使用Blastall进行数据库比对 (2012-02-13 21:25:31)   用blastall进行序列比对 blastall是最常用的blast程序之一,其功能非常强大 ...

  5. Linux下BLAST的使用---转载

    1.把BLAST的压缩文件解压,然后将bin目录下的文件拷贝至/usr/local/bin下:2.制作软链接,将解压后的文件中bin目录链接至/home/username下,eg:ln -s /hom ...

  6. blast+学习之search tools

    search tools:blastn, blastp, blastx, tblastx, tblastn, psiblast, rpsblast, and rpstblastn 1.blastn: ...

  7. [Javascript] Logging Pretty-Printing Tabular Data to the Console

    Learn how to use console.table to render arrays and objects in a tabular format for easy scanning ov ...

  8. 27、BLASTN的参数

    转载:http://blog.sina.com.cn/s/blog_5ecfd9d90100ksui.html http://www.docin.com/p-704735699.html 与之前的bl ...

  9. RTP Tools

    RTP Tools (Version 1.20) https://wiki.wireshark.org/RTP_statistics Here is a small example: Install ...

随机推荐

  1. SQLite 增、删、改、查

    1.iOS中实现SQLite的增.删.改.查  http://www.jianshu.com/p/0b9b78e704a4. 2.用数据库实现收藏功能 http://www.jianshu.com/p ...

  2. 修复ext4日志(jbd2)bug( Ext4 文件系统有以下 Bug)

    from:http://blog.donghao.org/2013/03/20/%E4%BF%AE%E5%A4%8Dext4%E6%97%A5%E5%BF%97%EF%BC%88jbd2%EF%BC% ...

  3. GNU Trove trove4j

    GNU Trove (http://trove4j.sourceforge.net/) 是一个Java 集合类库.在某些场景下,Trove集合类库提供了更好的性能,而且内存使用更少.以下是Trove中 ...

  4. C#.NET 大型通用信息化系统集成快速开发平台 4.0 版本 - 导入导出Microsoft Excel 2010的例子

    1:能支持多种Excel版本,早期的.现在的版本都支持.2:能导入.3:能导出.4:有简单的例子可以参考.

  5. Linux socket多进程服务器框架一

    重点:socket共用方法中错误码的定义以及错误码的解析 底层辅助代码 //serhelp.h #ifndef _vxser #define _vxser #ifdef __cplusplus ext ...

  6. 有的机器不能通过session登录

    web.config <system.web>    <sessionState mode="InProc" cookieless="AutoDetec ...

  7. 简单高效的nodejs爬虫模型

    这篇文章讲解一下yunshare项目的爬虫模型. 使用nodejs开发爬虫很简单,不需要类似python的scrapy这样的爬虫框架,只需要用request或者superagent这样的http库就能 ...

  8. JAVA反射其实就是那么一回事

    概念:什么是反射 java反射机制: JAVA反射机制是在运行状态中, 对于任意一个类,都能够知道这个类的所有属性和方法: 对于任意一个对象,都能够调用它的任意一个方法和属性: 这种动态获取的信息以及 ...

  9. checkboxlist 下拉框多选功能 ,模拟dropdownlist带复选框效果

    前台代码 01.<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml"> 02.<head runat="server&q ...

  10. ALinq Dynamic 使用指南——前言

    一.简介 ALinq Dynamic 为ALinq以及Linq to SQL提供了一个Entiy SQL的查询接口,使得它们能够应用Entity SQL 进行数据的查询.它的原理是将Entiy SQL ...