进行Blast比对,用参数-m 6 可以以列表的方式输出结果,结果中从左到右每一列的意义分别是:

[00] Query id

[01] Subject id

[02] % identity

[03] alignment length

[04] mismatches

[05] gap openings

[06] q. start

[07] q. end

[08] s. start

[09] s. end

[10] e-value

[11] bit score

the comment lines of the blast tabular format的更多相关文章

  1. blast | diamond 输出结果选择和解析 | 比对

    之前的文章:构建NCBI本地BLAST数据库 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast构建索引 | makeblastdb 本地运行blast时,需要指定out fo ...

  2. 构建NCBI本地BLAST数据库 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast构建索引 | makeblastdb

    参考链接: FTP README 如何下载 NCBI NR NT数据库? 下载blast:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+ 先了解 ...

  3. 比对软件Blast,Blast+,Diamond比较

    1. Blast (1)格式化数据库 formatdb -i db.seq -p T -o T -l logfile 主要参数: -i 输入需要格式化的源数据库名称 -p 文件类型,是核苷酸序列数据库 ...

  4. Blast本地化

    转载]Blast本地化:使用Blastall进行数据库比对 (2012-02-13 21:25:31)   用blastall进行序列比对 blastall是最常用的blast程序之一,其功能非常强大 ...

  5. Linux下BLAST的使用---转载

    1.把BLAST的压缩文件解压,然后将bin目录下的文件拷贝至/usr/local/bin下:2.制作软链接,将解压后的文件中bin目录链接至/home/username下,eg:ln -s /hom ...

  6. blast+学习之search tools

    search tools:blastn, blastp, blastx, tblastx, tblastn, psiblast, rpsblast, and rpstblastn 1.blastn: ...

  7. [Javascript] Logging Pretty-Printing Tabular Data to the Console

    Learn how to use console.table to render arrays and objects in a tabular format for easy scanning ov ...

  8. 27、BLASTN的参数

    转载:http://blog.sina.com.cn/s/blog_5ecfd9d90100ksui.html http://www.docin.com/p-704735699.html 与之前的bl ...

  9. RTP Tools

    RTP Tools (Version 1.20) https://wiki.wireshark.org/RTP_statistics Here is a small example: Install ...

随机推荐

  1. appid账号创建及A D-U-M-S码创建

    APPID  企业账号创建流程及A D-U-N-S® Number 码创建(需要等2到3周时间,可以先创建成个人账号然后升级成公司账号)   021 26107504  邓白氏编码  1.需要VISI ...

  2. 程序员级别鉴定书(.NET面试问答集锦)

    作为一个.NET程序员,应该知道的不仅仅是拖拽一个控件到设计时窗口中.就像一个赛车手,一定要了解他的爱车 – 能做什么不能做什么. 本文参考Scott Hanselman给出的.NET问题列表,整理如 ...

  3. http协议(二)请求和响应报文的构成

    http协议用于客户端和服务器之间的通信,请求访问资源的一方称为客户端,而提供资源响应的一方称为服务器端. 下面就是客户端和服务端之间简单的通信过程 PS:请求必须从客户端建立通信,服务端没收到请求之 ...

  4. JAVA_HOME环境变量失效的解决办法

    晚上把oracle自带的weblogic给卸载了,然后打开eclipse,发现报错了:Error: could not open `C:\Java\jre7\lib\amd64\jvm.cfg' JA ...

  5. stm32调试记录一

    ..\..\SYSTEM\usart\usart.c(1): error:  #5: cannot open source input file "sys.h": No such ...

  6. jQuery 之 Callback 实现

    在 js 开发中,由于没有多线程,经常会遇到回调这个概念,比如说,在 ready 函数中注册回调函数,注册元素的事件处理等等.在比较复杂的场景下,当一个事件发生的时候,可能需要同时执行多个回调方法,可 ...

  7. 更好的逐帧动画函数 — requestAnimationFrame 简介

    本文将会简单讲讲 requestAnimationFrame 函数的用法,与 setTimeout/setInterval 的区别和联系,以及当标签页隐藏时 requestAnimationFrame ...

  8. JSON简介以及用法汇总

    什么是JSON? JavaScript 对象表示法(JavaScript Object Notation). JSON是一种轻量级的数据交换格式,某个JSON格式的文件内部譬如可以长成这样: { &q ...

  9. 迭代器模式的一种应用场景以及C#对于迭代器的内置支持

    迭代器模式 先放上gof中对于迭代器模式的介绍镇楼 意图 提供一种方法顺序访问一个聚合对象中各个元素, 而又不需暴露该对象的内部表示. 别名 游标(Cursor). 动机 一个聚合对象, 如列表(li ...

  10. 【python游戏编程之旅】第七篇---pygame中的冲突检测技术

    本系列博客介绍以python+pygame库进行小游戏的开发.有写的不对之处还望各位海涵. 上一个博客我们一起学习了pygame中的Sprite模块和如何加载动画:http://www.cnblogs ...