IGV软件
它支持各种各样的数据类型,包括基于芯片测序、二代测序数据和基因组注释数据等。整合基因组浏览器(IGV,Integrative Genomics Viewer)进行可视化浏览,它支持各种各式的数据类型,包括基于芯片测序、二代测序数据和基因。IGV具有以下特点:
(1) 能在不同尺度下显示单个或多个Reads在参考基因组上的位置,包括Reads在各个染色体上的分布情况和在注释的外显子、内含子、剪接接合区、基因间区的分布情况等;
(2) 能在不同尺度下显示不同区域的Reads丰度,以反映不同区域的转录水平;
(3) 能显示基因及其剪接异构体的注释信息;
(4) 能显示其他注释信息;
(5) 既可以从远程服务器端下载各种注释信息,又可以从本地加载注释信息。
安装可参考:http://www.wtoutiao.com/p/x2dFKv.html
IGV软件的更多相关文章
- 可视化工具之 IGV 使用方法
整合基因组浏览器(IGV)是一种高性能的可视化工具,用来交互式地探索大型综合基因组数据.它支持各种数据类型,包括array-based的和下一代测序的数据和基因注释. IGV这个工具很牛,发了NB: ...
- IGV解读
复制于:https://www.cnblogs.com/leezx/p/5603481.html 整合基因组浏览器(IGV)是一种高性能的可视化工具,用来交互式地探索大型综合基因组数据.它支持各种数据 ...
- RNA-seq 数据文件处理
http://www.fungenomics.com/article/30 [专题]基因组学技术专题(二)-- 为什么说FPKM/RPKM是错的 下载数据 wget是linux下一个从网络上自动下载文 ...
- mac osx App store 安装软件 发生错误
app store 安装软件时发生错误 解决办法: 1. 进入如下目录: sh-3.2# cd Library/Application\ Support/App\ Store/ sh-3.2# pwd ...
- PSI-BLAST|PHI-BLAST|UniProt|IGV|Galaxy|clustalx
生物信息学软件: NCBI:BLAST,设定k-mer 默认是全局比对,Blastn是局部比对. PSI-BLAST最灵敏的BLAST,选中部分矩阵后在数据库中查找相应蛋白. PHI-BLAST找氨基 ...
- DBImport V3.7版本发布及软件稳定性(自动退出问题)解决过程分享
DBImport V3.7介绍: 1:先上图,再介绍亮点功能: 主要的升级功能为: 1:增加(Truncate Table)清表再插入功能: 清掉再插,可以保证两个库的数据一致,自己很喜欢这个功能. ...
- nw.js桌面软件开发系列 第0.1节 HTML5和桌面软件开发的碰撞
第0.1节 HTML5和桌面软件开发的碰撞 当我们谈论桌面软件开发技术的时候,你会想到什么?如果不对技术本身进行更为深入的探讨,在我的世界里,有这么多技术概念可以被罗列出来(请原谅我本质上是一个Win ...
- 标准产品+定制开发:专注打造企业OA、智慧政务云平台——山东森普软件,交付率最高的技术型软件公司
一.公司简介山东森普信息技术有限公司(以下简称森普软件)是一家专门致力于移动互联网产品.企业管理软件定制开发的技术型企业.公司总部设在全国五大软件园之一的济南齐鲁软件园.森普SimPro是由Simpl ...
- JAVA程序员常用软件整理下载
********为了大家学习方便,特意整理软件下载如下:*************Java类软件:-------------------------------JDK7.0:http://pan.ba ...
随机推荐
- 第六次作业——利用MFC实现计算器图形界面以及简单四则运算表达式批处理
参考资料: 1.MFC响应键盘 2.计算器实例 3.MFC文件对话框 4.MFCUpdateData()函数的使用 5.MFC教程 6.wi ...
- UpdateSourceTrigger Property in WPF Binding
介绍 这篇文章我将介绍在WPF和Silverlight中更新绑定源的概念.正如您所知道的,当我们用TwoWay的模式绑定时,任何在目标控件上发生的变化都会影响绑定源的值. 请注意只是在用TwoWay绑 ...
- MooseFs-分布式文件系统系列(二)之安装总结
preface 上篇博客写了如何安装MFS,那么现在就说说经验总结把 安装方式有源码和yum安装,在官网地址:https://moosefs.com/download/centosfedorarhel ...
- markdown安装和使用
下载 运行markdownpad2-setup.exe文件,下一步一直到结束. 使用 标题 列表 引用.网页链接.图片链接 代码框 星号
- python wmi使用
python wmi 官方开发文档https://msdn.microsoft.com/en-us/library/aa394388(v=vs.85).aspx WMI使用的WIN32_类库名 htt ...
- MySQL安装图解
MySQL安装图解 打开下载的mysql安装文件mysql-5.0.27-win32.zip,双击解压缩,运行“setup.exe”,出现如下界面: mysql安装向导启动,按“N ...
- maven学习讲解
参考链接:http://www.cnblogs.com/bigtall/archive/2011/03/23/1993253.html 1.前言 Maven,发音是[`meivin],"专家 ...
- Java http方式提交短信到短信网关
URL url = new URL("短信网关url"); 一般短信内容需要用URLEncoder.encode()编码一下 HttpURLConnection httpCon = ...
- JavaWeb学习笔记——JavaEE基础知识
- DB服务器中的参数优化
1.swappiness 禁止系统使用swap空间,配置/etc/sysctl.conf中的vm.swappiness=0 2.Scheduler调度 Scheduler调度,指的是磁盘的IO调度算法 ...