它支持各种各样的数据类型,包括基于芯片测序、二代测序数据和基因组注释数据等。整合基因组浏览器(IGV,Integrative Genomics Viewer)进行可视化浏览,它支持各种各式的数据类型,包括基于芯片测序、二代测序数据和基因。IGV具有以下特点:

  (1) 能在不同尺度下显示单个或多个Reads在参考基因组上的位置,包括Reads在各个染色体上的分布情况和在注释的外显子、内含子、剪接接合区、基因间区的分布情况等;

  (2) 能在不同尺度下显示不同区域的Reads丰度,以反映不同区域的转录水平;

  (3) 能显示基因及其剪接异构体的注释信息;

  (4) 能显示其他注释信息;

  (5) 既可以从远程服务器端下载各种注释信息,又可以从本地加载注释信息。

  安装可参考:http://www.wtoutiao.com/p/x2dFKv.html

IGV软件的更多相关文章

  1. 可视化工具之 IGV 使用方法

    整合基因组浏览器(IGV)是一种高性能的可视化工具,用来交互式地探索大型综合基因组数据.它支持各种数据类型,包括array-based的和下一代测序的数据和基因注释. IGV这个工具很牛,发了NB: ...

  2. IGV解读

    复制于:https://www.cnblogs.com/leezx/p/5603481.html 整合基因组浏览器(IGV)是一种高性能的可视化工具,用来交互式地探索大型综合基因组数据.它支持各种数据 ...

  3. RNA-seq 数据文件处理

    http://www.fungenomics.com/article/30 [专题]基因组学技术专题(二)-- 为什么说FPKM/RPKM是错的 下载数据 wget是linux下一个从网络上自动下载文 ...

  4. mac osx App store 安装软件 发生错误

    app store 安装软件时发生错误 解决办法: 1. 进入如下目录: sh-3.2# cd Library/Application\ Support/App\ Store/ sh-3.2# pwd ...

  5. PSI-BLAST|PHI-BLAST|UniProt|IGV|Galaxy|clustalx

    生物信息学软件: NCBI:BLAST,设定k-mer 默认是全局比对,Blastn是局部比对. PSI-BLAST最灵敏的BLAST,选中部分矩阵后在数据库中查找相应蛋白. PHI-BLAST找氨基 ...

  6. DBImport V3.7版本发布及软件稳定性(自动退出问题)解决过程分享

    DBImport V3.7介绍: 1:先上图,再介绍亮点功能: 主要的升级功能为: 1:增加(Truncate Table)清表再插入功能: 清掉再插,可以保证两个库的数据一致,自己很喜欢这个功能. ...

  7. nw.js桌面软件开发系列 第0.1节 HTML5和桌面软件开发的碰撞

    第0.1节 HTML5和桌面软件开发的碰撞 当我们谈论桌面软件开发技术的时候,你会想到什么?如果不对技术本身进行更为深入的探讨,在我的世界里,有这么多技术概念可以被罗列出来(请原谅我本质上是一个Win ...

  8. 标准产品+定制开发:专注打造企业OA、智慧政务云平台——山东森普软件,交付率最高的技术型软件公司

    一.公司简介山东森普信息技术有限公司(以下简称森普软件)是一家专门致力于移动互联网产品.企业管理软件定制开发的技术型企业.公司总部设在全国五大软件园之一的济南齐鲁软件园.森普SimPro是由Simpl ...

  9. JAVA程序员常用软件整理下载

    ********为了大家学习方便,特意整理软件下载如下:*************Java类软件:-------------------------------JDK7.0:http://pan.ba ...

随机推荐

  1. PHP预定义接口

    目录 引言 IteratorAggregate(聚合式aggregate迭代器Iterator) Countable ArrayAccess Iterator 总结 引言 在PHP中有好几个预定义的接 ...

  2. Npoi实现Excel绘制功能

    使用Npoi操作Excel,是我一直很喜欢的一种方式. 说简单也简单,但是封装好重用性,易用性,也稍稍费了些时间.在这里做个记录,免得以后遗忘. 首先说一下需求,需求有两点 1.新建Excel,并下载 ...

  3. AngularJs Angular数据类型判断

    angular.isArray 判断括号内的值是否为数组. 格式:angular.isArray(value); value: 被判断是否为数组的值. ------------------------ ...

  4. spring+hibernate ---laobai

    biz包: package com.etc.biz; import java.util.List; import org.springframework.orm.hibernate3.support. ...

  5. Tomcat 用户访问控制

    要设置Tomcat下的Host都有哪些ip能访问,可以在conf/server.xml的相应Host元素内加Value标签,示例: <Valve className="org.apac ...

  6. codeforces 724B Batch Sort(暴力-列交换一次每行交换一次)

    题目链接:http://codeforces.com/problemset/problem/724/B 题目大意: 给出N*M矩阵,对于该矩阵有两种操作: (保证,每行输入的数是 1-m 之间的数且不 ...

  7. Which is the best opencv or matlab for image processing?

    http://www.researchgate.net/post/Which_is_the_best_opencv_or_matlab_for_image_processing Annette Mor ...

  8. ajax成功跨域_自己写的

    跨域的简单原理:一般浏览器会阻止js请求异端服务器(A服务器请求B服务器).js连接却除外 如:<script type="text/jscript" src="h ...

  9. mac pro在公司连WiFi正常,回家回宿舍就找不到WiFI信号,需要重启才能找到WiFI热点

    解决办法:修改路由器的频段到1-11这个范围. 之前一直没时间去找原因,项目也急,这几天项目不是特别急了,就找找了,原因. 因为之前还是好好的,主要是之前有次修改了下路由器的配置. 改了下默认的发送频 ...

  10. Quartz.NET总结(二)CronTrigger和Cron表达式

    Quartz.NET的任务调度,主要就是依靠CronTrigger和Cron表达式.Cron是已经在UNIX存在了很长一段时间,它有着强大和可靠的调度能力.CronTrigger类也正是是基于Cron ...