IGV软件
它支持各种各样的数据类型,包括基于芯片测序、二代测序数据和基因组注释数据等。整合基因组浏览器(IGV,Integrative Genomics Viewer)进行可视化浏览,它支持各种各式的数据类型,包括基于芯片测序、二代测序数据和基因。IGV具有以下特点:
(1) 能在不同尺度下显示单个或多个Reads在参考基因组上的位置,包括Reads在各个染色体上的分布情况和在注释的外显子、内含子、剪接接合区、基因间区的分布情况等;
(2) 能在不同尺度下显示不同区域的Reads丰度,以反映不同区域的转录水平;
(3) 能显示基因及其剪接异构体的注释信息;
(4) 能显示其他注释信息;
(5) 既可以从远程服务器端下载各种注释信息,又可以从本地加载注释信息。
安装可参考:http://www.wtoutiao.com/p/x2dFKv.html
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