它支持各种各样的数据类型,包括基于芯片测序、二代测序数据和基因组注释数据等。整合基因组浏览器(IGV,Integrative Genomics Viewer)进行可视化浏览,它支持各种各式的数据类型,包括基于芯片测序、二代测序数据和基因。IGV具有以下特点:

  (1) 能在不同尺度下显示单个或多个Reads在参考基因组上的位置,包括Reads在各个染色体上的分布情况和在注释的外显子、内含子、剪接接合区、基因间区的分布情况等;

  (2) 能在不同尺度下显示不同区域的Reads丰度,以反映不同区域的转录水平;

  (3) 能显示基因及其剪接异构体的注释信息;

  (4) 能显示其他注释信息;

  (5) 既可以从远程服务器端下载各种注释信息,又可以从本地加载注释信息。

  安装可参考:http://www.wtoutiao.com/p/x2dFKv.html

IGV软件的更多相关文章

  1. 可视化工具之 IGV 使用方法

    整合基因组浏览器(IGV)是一种高性能的可视化工具,用来交互式地探索大型综合基因组数据.它支持各种数据类型,包括array-based的和下一代测序的数据和基因注释. IGV这个工具很牛,发了NB: ...

  2. IGV解读

    复制于:https://www.cnblogs.com/leezx/p/5603481.html 整合基因组浏览器(IGV)是一种高性能的可视化工具,用来交互式地探索大型综合基因组数据.它支持各种数据 ...

  3. RNA-seq 数据文件处理

    http://www.fungenomics.com/article/30 [专题]基因组学技术专题(二)-- 为什么说FPKM/RPKM是错的 下载数据 wget是linux下一个从网络上自动下载文 ...

  4. mac osx App store 安装软件 发生错误

    app store 安装软件时发生错误 解决办法: 1. 进入如下目录: sh-3.2# cd Library/Application\ Support/App\ Store/ sh-3.2# pwd ...

  5. PSI-BLAST|PHI-BLAST|UniProt|IGV|Galaxy|clustalx

    生物信息学软件: NCBI:BLAST,设定k-mer 默认是全局比对,Blastn是局部比对. PSI-BLAST最灵敏的BLAST,选中部分矩阵后在数据库中查找相应蛋白. PHI-BLAST找氨基 ...

  6. DBImport V3.7版本发布及软件稳定性(自动退出问题)解决过程分享

    DBImport V3.7介绍: 1:先上图,再介绍亮点功能: 主要的升级功能为: 1:增加(Truncate Table)清表再插入功能: 清掉再插,可以保证两个库的数据一致,自己很喜欢这个功能. ...

  7. nw.js桌面软件开发系列 第0.1节 HTML5和桌面软件开发的碰撞

    第0.1节 HTML5和桌面软件开发的碰撞 当我们谈论桌面软件开发技术的时候,你会想到什么?如果不对技术本身进行更为深入的探讨,在我的世界里,有这么多技术概念可以被罗列出来(请原谅我本质上是一个Win ...

  8. 标准产品+定制开发:专注打造企业OA、智慧政务云平台——山东森普软件,交付率最高的技术型软件公司

    一.公司简介山东森普信息技术有限公司(以下简称森普软件)是一家专门致力于移动互联网产品.企业管理软件定制开发的技术型企业.公司总部设在全国五大软件园之一的济南齐鲁软件园.森普SimPro是由Simpl ...

  9. JAVA程序员常用软件整理下载

    ********为了大家学习方便,特意整理软件下载如下:*************Java类软件:-------------------------------JDK7.0:http://pan.ba ...

随机推荐

  1. centos安装altas

    centos6.6 atlas2.2.1 atlas项目 https://github.com/Qihoo360/Atlas/releases yum -y install gcc make ncur ...

  2. 数据结构算法C语言实现(七)--- 3.1栈的线性实现及应用举例

    一.简述 栈,LIFO.是操作受限的线性表,和线性表一样有两种存储表示方法.下面以顺序存储为例,实现. 二.ADT 暂无. 三.头文件 //3_1.h /** author:zhaoyu email: ...

  3. C语言实现penna模型

    一年前写的代码,偶然翻出来.发现自己当时水平还不赖吗. # include <stdio.h> # include <stdlib.h> # include <time. ...

  4. 净捡软柿子捏--jQuery

    恩现在是在学习阶段,所以还只是一个小小的搬运工, 大部分参考自 http://www.w3school.com.cn/ 和http://www.zhangxinxu.com/ 超级好的两个学习网站,因 ...

  5. 几个容易被忽略的mysql知识

    为什么标题要起这个名字呢?commen sence指的是那些大家都应该知道的事情,但往往大家又会会略这些东西,或者对这些东西一知半解,今天我总结下自己在mysql中遇到的一些commen sense类 ...

  6. Android中如何像 360 一样优雅的杀死后台Service而不启动

    http://my.oschina.net/mopidick/blog/277813 目录[-] 一.已知的 kill 后台应用程序的方法 方法: kill -9 pid 二.终极方法,杀死后台ser ...

  7. Ubuntu下忘记MySQL密码重设方法

    今天在做Python的实验,要用到MySQL数据库,但是密码是啥捏~~~果断重新设置密码啦啦啦 http://www.cnblogs.com/yuxc/archive/2012/07/25/26075 ...

  8. Tomcat 的三种(bio,nio.apr) 高级 Connector 运行模式及apr配置

    转: http://www.oschina.net/question/54100_16195omcat的运行模式有3种.修改他们的运行模式.3种模式的运行是否成功,可以看他的启动控制台,或者启动日志. ...

  9. C#中使用代码动态改变配置文件信息

    static void Main(string[] args) { XmlDocument xDoc = new XmlDocument(); xDoc.Load("../../App.co ...

  10. IBatis一对多嵌套查询

    1)类 public class AppData { // public int ModuleId { get; set; } public int DataId { get; set; } publ ...