Genome Aggregation Database (gnomAD)

这是一个关于什么的数据库？broad institute开发的，整合了目前几乎所有的公共的WES和WGS测序数据，并对数据做了一些总结，可供其他开发者使用。

怎么使用gnomAD？

  • 查感兴趣的基因
  • 查感兴趣的variant

参考人群等位基因频率数据库

基因变异耐受性

可以不做这方面的工作，但是该领域一些最基本的概念必须了解，这样才有问问题和合作的可能性。

参考：

遗传资源数据库专题-gnomAD

gnomAD 数据库简介

gnomAD v2.1 更新后的最大人群测序数据库 到底增强了什么

Genome Aggregation Database (gnomAD) 简介 | 参考人群等位基因频率数据库的更多相关文章

  1. 关于 minor allele frequency（次等位基因频率）的理解

    引用自NCBI的概念(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/docs/rs_attributes.html#gmaf) Global minor alle ...

  2. plink, vcftool计算等位基因频率（allele frequency，vcf）

    计算等位基因频率有两种方式,第一种用vcftool计算: /path/to/vcftools --vcf file.vcf --freq --chr 1 --out filefreq 很简单的一个命令 ...

  3. Kettle 4.2源码分析第四讲--KettleJob机制与Database插件简介（含讲解PPT）

    1.  Job机制 一个job项代表ETL控制流中的一项逻辑任务.Job项将会顺序执行,每个job项会产生一个结果,能作为别的分支上job项的条件. 图 1 job项示例 1.1. Job类图简介 图 ...

  4. 【数据库-Azure SQL Database】JDBC 如何连接 SQL Azure 数据库

    使用 JAVA 代码连接 Azure SQL Database 时产生了 SSL 错误,对于此问题大多数用户都是因为不知如何编写 JDBC 连接字符串而产生的,以下为相关示例代码,供您参考:   pa ...

  5. MariaDB数据库 ----数据库简介，用户管理，数据库创建，数据类型、数据增删改(实例演示)

    数据库简介 数据库--即电子文件柜,用户可以对文件中的数据进行增,删,改,查等操作. 数据库分类 关系型数据库 关系型数据库管理系统(Relational Database Management Sy ...

  6. mybatis3.0-[topic10-14] -全局配置文件_plugins插件简介/ typeHandlers_类型处理器简介 /enviroments_运行环境 /多数据库支持/mappers_sql映射注册

    mybatis3.0-全局配置文件_   下面为中文官网解释 全局配置文件的标签需要按如下定义的顺序: <!ELEMENT configuration (properties?, setting ...

  7. Objective-C ,ios,iphone开发基础:ios数据库（The SQLite Database）,使用终端进行简单的数据库操作

    SQLite  是一个轻量级的免费关系数据库.SQLite最初的设计目标是用于嵌入式系统,它占用资源非常少,在嵌入式设备中,只需要几百K的内存就够了,可以在(http://www.sqlite.org ...

  8. [置顶] Objective-C ,ios,iphone开发基础:ios数据库（The SQLite Database）,使用终端进行简单的数据库操作

    SQLite  是一个轻量级的免费关系数据库.SQLite最初的设计目标是用于嵌入式系统,它占用资源非常少,在嵌入式设备中,只需要几百K的内存就够了,可以在(http://www.sqlite.org ...

  9. EF CodeFirst简介、默认约定、数据库初始化策略

    CodeFirst 工作流程 创建或修改领域类-->使用数据注解或者Fluent API来配置领域类-->使用自动数据库迁移技术或者基于代码的数据库迁移技术来创建数据库. CodeFirs ...

随机推荐

  1. Python学习日记(四) 集合和元祖

    元祖的特性:是一个只读列表.可以循环.可以切片,修改数据遵循'儿子'不能改但'孙子'可能可以改. iterable:可迭代对象(元祖.列表.字串.集合) 元祖宣告方式: tu = (1,2,3,['a ...

  2. api markdown 编排模版

    #### 简要描述: - 查询城市编码 #### 接口版本: |版本号|制定人|制定日期|修订日期||:---- |:------ |:-------- |------- ||1.0 |XXX|201 ...

  3. visual studio 应用场景

  4. tomcat的根路径设置

    今天使用postman进行springmvc的测试发现提示404错误,检查原因发现是tomcat的配置问题.这里的发布的war包的访问地址 Application Context设置为了根路径”/” ...

  5. zabbix Server 4.0 报警（Action）篇

    zabbix Server 4.0 报警(Action)篇 作者:尹正杰 版权声明:原创作品,谢绝转载!否则将追究法律责任. 一.查看zabbix默认的Actions 1>.点击默认的Actio ...

  6. C实现除法

    C实现除法 来源 Leetcode上的一个题,做完后感觉很有意义,因而记录. 实际上自己也查阅了不少的实现除法的方式,最后还是感觉这个方法是最好的,没有别的原因,就是快. 需要注意的一些点 正整数之间 ...

  7. 大数据之路week07--day05 （一个基于Hadoop的数据仓库建模工具之一 HIve）

    什么是Hive? 我来一个短而精悍的总结(面试常问) 1:hive是基于hadoop的数据仓库建模工具之一(后面还有TEZ,Spark). 2:hive可以使用类sql方言,对存储在hdfs上的数据进 ...

  8. Two Year's Harvest

    转眼间来到这里已经两年,在懵懵懂懂中渐渐在成长,一步一步走过脚下的路.这两年你说长,时间也是不短,但说长吧,时间又匆匆在指间匆匆流走.还记得大一时老师为我们讲专业课,那时候还不知道TGB,只是在五月的 ...

  9. tcp的三次握手和四次挥手转自https://www.jianshu.com/p/d3725391af59

    三次握手(three-way handshaking) 1.背景:TCP位于传输层,作用是提供可靠的字节流服务,为了准确无误地将数据送达目的地,TCP协议采纳三次握手策略. 2.原理: 1)发送端首先 ...

  10. 1-html基本结构与编写规范

    <!DOCTYPE html> <html> <!-- #前端开发系统化学习教程, #包括html.css.pc端及移动端布局技巧.javascript. #jquery ...