Genome Aggregation Database (gnomAD)

这是一个关于什么的数据库?broad institute开发的,整合了目前几乎所有的公共的WES和WGS测序数据,并对数据做了一些总结,可供其他开发者使用。

怎么使用gnomAD?

  • 查感兴趣的基因
  • 查感兴趣的variant

参考人群等位基因频率数据库

基因变异耐受性

可以不做这方面的工作,但是该领域一些最基本的概念必须了解,这样才有问问题和合作的可能性。

参考:

遗传资源数据库专题-gnomAD

gnomAD 数据库简介

gnomAD v2.1 更新后的最大人群测序数据库 到底增强了什么

Genome Aggregation Database (gnomAD) 简介 | 参考人群等位基因频率数据库的更多相关文章

  1. 关于 minor allele frequency(次等位基因频率)的理解

    引用自NCBI的概念(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/docs/rs_attributes.html#gmaf) Global minor alle ...

  2. plink, vcftool计算等位基因频率(allele frequency,vcf)

    计算等位基因频率有两种方式,第一种用vcftool计算: /path/to/vcftools --vcf file.vcf --freq --chr 1 --out filefreq 很简单的一个命令 ...

  3. Kettle 4.2源码分析第四讲--KettleJob机制与Database插件简介(含讲解PPT)

    1.  Job机制 一个job项代表ETL控制流中的一项逻辑任务.Job项将会顺序执行,每个job项会产生一个结果,能作为别的分支上job项的条件. 图 1 job项示例 1.1. Job类图简介 图 ...

  4. 【数据库-Azure SQL Database】JDBC 如何连接 SQL Azure 数据库

    使用 JAVA 代码连接 Azure SQL Database 时产生了 SSL 错误,对于此问题大多数用户都是因为不知如何编写 JDBC 连接字符串而产生的,以下为相关示例代码,供您参考:   pa ...

  5. MariaDB数据库 ----数据库简介,用户管理,数据库创建,数据类型、数据增删改(实例演示)

    数据库简介 数据库--即电子文件柜,用户可以对文件中的数据进行增,删,改,查等操作. 数据库分类 关系型数据库 关系型数据库管理系统(Relational Database Management Sy ...

  6. mybatis3.0-[topic10-14] -全局配置文件_plugins插件简介/ typeHandlers_类型处理器简介 /enviroments_运行环境 /多数据库支持/mappers_sql映射注册

    mybatis3.0-全局配置文件_   下面为中文官网解释 全局配置文件的标签需要按如下定义的顺序: <!ELEMENT configuration (properties?, setting ...

  7. Objective-C ,ios,iphone开发基础:ios数据库(The SQLite Database),使用终端进行简单的数据库操作

    SQLite  是一个轻量级的免费关系数据库.SQLite最初的设计目标是用于嵌入式系统,它占用资源非常少,在嵌入式设备中,只需要几百K的内存就够了,可以在(http://www.sqlite.org ...

  8. [置顶] Objective-C ,ios,iphone开发基础:ios数据库(The SQLite Database),使用终端进行简单的数据库操作

    SQLite  是一个轻量级的免费关系数据库.SQLite最初的设计目标是用于嵌入式系统,它占用资源非常少,在嵌入式设备中,只需要几百K的内存就够了,可以在(http://www.sqlite.org ...

  9. EF CodeFirst简介、默认约定、数据库初始化策略

    CodeFirst 工作流程 创建或修改领域类-->使用数据注解或者Fluent API来配置领域类-->使用自动数据库迁移技术或者基于代码的数据库迁移技术来创建数据库. CodeFirs ...

随机推荐

  1. Scrapy 框架的使用

    Scrapy 框架的介绍 Scrapy 是一个基于Twisted的异步处理框架,是纯Python实现的爬虫框架,其架构清晰模块之间的耦合成都低,可扩展性极强,可以灵活完成各种需求.我们只需要定制开发几 ...

  2. 「8-27

    没有别的目的, 是最近发现一个小软件, 用起来感觉很不错, 所以想分享给大家. 首先这是一个 macOS 软件, 它的功能也很简单, 就是在菜单栏显示日期时间, 点按它可以显示日历, 没错, 简单到是 ...

  3. 在Activity/Fragment以外使用Toast【转】

    在 Activity 使用 Toast 这种是最基本的使用,Toast的第一个参数就是Context,一般在Activity中我们直接用this代替,代表调用者的实例为Activity. public ...

  4. HTML&CSS基础-CSS的语法

    HTML&CSS基础-CSS的语法 作者:尹正杰 版权声明:原创作品,谢绝转载!否则将追究法律责任. 一.dome.html源代码 <!DOCTYPE html> <html ...

  5. JavaSE字符串日期与时间拼接小列子与JSON小列子

    1.在对象中有个字段为Timestamp类型,需要将数据库的开始日期字段和开始时间字段拼接成一个字段开始字段 private static Timestamp getDateTime(String d ...

  6. Spring boot集成Websocket,前端监听心跳实现

    第一:引入jar 由于项目是springboot的项目所以我这边简单的应用了springboot自带的socket jar <dependency> <groupId>org. ...

  7. HDU-4190-Number Sequence-容斥原理+多重集和的r组合

    HDU-4190-Number Sequence-容斥原理+多重集和的r组合 [Problem Description] 给你\(n\)个数\(b_i\),问有多少个长度为\(n\)序列\(a_i\) ...

  8. cookies localStorage和sessionStorage的区别

    sessionStorage用于本地存储一个会话(session)中的数据,这些数据只有在同一个会话中的页面才能访问并且当会话结束后数据也随之销毁.因此sessionStorage不是一种持久化的本地 ...

  9. 多线程实现的方式二实现Rannable

    package thread; class Thread2 implements Runnable{ private String name; public Thread2(String name) ...

  10. 题解 UVa10943

    题目大意 多组数据,每组数据给定两个整数 \(n,k\),求出用 \(k\) 个不超过 \(n\) 的数相加得到 \(n\) 的方案数(不同顺序不算同种). 分析 计数水题.令 \(f_{i,j}\) ...