Genome Aggregation Database (gnomAD)

这是一个关于什么的数据库?broad institute开发的,整合了目前几乎所有的公共的WES和WGS测序数据,并对数据做了一些总结,可供其他开发者使用。

怎么使用gnomAD?

  • 查感兴趣的基因
  • 查感兴趣的variant

参考人群等位基因频率数据库

基因变异耐受性

可以不做这方面的工作,但是该领域一些最基本的概念必须了解,这样才有问问题和合作的可能性。

参考:

遗传资源数据库专题-gnomAD

gnomAD 数据库简介

gnomAD v2.1 更新后的最大人群测序数据库 到底增强了什么

Genome Aggregation Database (gnomAD) 简介 | 参考人群等位基因频率数据库的更多相关文章

  1. 关于 minor allele frequency(次等位基因频率)的理解

    引用自NCBI的概念(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/docs/rs_attributes.html#gmaf) Global minor alle ...

  2. plink, vcftool计算等位基因频率(allele frequency,vcf)

    计算等位基因频率有两种方式,第一种用vcftool计算: /path/to/vcftools --vcf file.vcf --freq --chr 1 --out filefreq 很简单的一个命令 ...

  3. Kettle 4.2源码分析第四讲--KettleJob机制与Database插件简介(含讲解PPT)

    1.  Job机制 一个job项代表ETL控制流中的一项逻辑任务.Job项将会顺序执行,每个job项会产生一个结果,能作为别的分支上job项的条件. 图 1 job项示例 1.1. Job类图简介 图 ...

  4. 【数据库-Azure SQL Database】JDBC 如何连接 SQL Azure 数据库

    使用 JAVA 代码连接 Azure SQL Database 时产生了 SSL 错误,对于此问题大多数用户都是因为不知如何编写 JDBC 连接字符串而产生的,以下为相关示例代码,供您参考:   pa ...

  5. MariaDB数据库 ----数据库简介,用户管理,数据库创建,数据类型、数据增删改(实例演示)

    数据库简介 数据库--即电子文件柜,用户可以对文件中的数据进行增,删,改,查等操作. 数据库分类 关系型数据库 关系型数据库管理系统(Relational Database Management Sy ...

  6. mybatis3.0-[topic10-14] -全局配置文件_plugins插件简介/ typeHandlers_类型处理器简介 /enviroments_运行环境 /多数据库支持/mappers_sql映射注册

    mybatis3.0-全局配置文件_   下面为中文官网解释 全局配置文件的标签需要按如下定义的顺序: <!ELEMENT configuration (properties?, setting ...

  7. Objective-C ,ios,iphone开发基础:ios数据库(The SQLite Database),使用终端进行简单的数据库操作

    SQLite  是一个轻量级的免费关系数据库.SQLite最初的设计目标是用于嵌入式系统,它占用资源非常少,在嵌入式设备中,只需要几百K的内存就够了,可以在(http://www.sqlite.org ...

  8. [置顶] Objective-C ,ios,iphone开发基础:ios数据库(The SQLite Database),使用终端进行简单的数据库操作

    SQLite  是一个轻量级的免费关系数据库.SQLite最初的设计目标是用于嵌入式系统,它占用资源非常少,在嵌入式设备中,只需要几百K的内存就够了,可以在(http://www.sqlite.org ...

  9. EF CodeFirst简介、默认约定、数据库初始化策略

    CodeFirst 工作流程 创建或修改领域类-->使用数据注解或者Fluent API来配置领域类-->使用自动数据库迁移技术或者基于代码的数据库迁移技术来创建数据库. CodeFirs ...

随机推荐

  1. LFS7.10——准备Host系统

    转载请标明出处:https://www.cnblogs.com/kelamoyujuzhen/articles/9161515.html 实验环境: Host:Windows10 + WMWare W ...

  2. Centos7修改默认启动内核

    #使用cat /boot/grub2/grub.cfg |grep menuentry  查看系统可用内核 root@Cs7-:/root> cat /boot/grub2/grub.cfg | ...

  3. Spring WebSocket中403错误解决

    最近测试了一下spring的websocket,遇到了一个比较恶心的问题,在这记录一下. 问题源自之前开发的一个h5项目,这个项目在80端口下一直放着,就顺便在里面随便加了几行代码测试websocke ...

  4. 配置比较完善的日志 logger 的使用

    1.配置文件 log_conf.conf ################################################ ###########propagate 是否继承父类的lo ...

  5. 如何解决redis的并发竞争问题?

    这个也是线上非常常见的一个问题,就是多客户端同时并发写一个key,可能本来应该先到的数据后到了,导致数据版本错了.或者是多客户端同时获取一个key,修改值之后再写回去,只要顺序错了,数据就错了. 而且 ...

  6. 在输出debug日志前加上logger.isDebugEnabled()判断的原因

    场景: String token = md5.substring(0, 10) + base64Two + md5.substring(10); if (logger.isDebugEnabled() ...

  7. vue和react原理性知识点

    Vue组件如何通信? computed和watch有什么区别? Vue是如何实现双向绑定的? Proxy与Object.defineProperty的优劣对比? 你是如何理解Vue的响应式系统的? 既 ...

  8. attention speech recognition

    Attention:是一种权重向量或矩阵,其往往用在Encoder-Decoder架构中,其权重越大,表示的context对输出越重要.计算方式有很多变种,但是核心都是通过神经网络学习而得到对应的权重 ...

  9. HTML锚点控制,跳转页面后定位到相应位置

    想在点击更多的页面 跳转后  用户能看到的是新闻  不用再用scollbar拖下来到新闻页面  这时候就需要在链接上 做下处理 <a href="/article/list/page/ ...

  10. ajax跨域-CORS

    CORS:跨域资源共享,是一种跨域访问的W3C标准,它允许浏览器可以跨源服务器进行请求,可以让ajax实现跨域访问.出现跨域问题的原因是浏览器同源策略导致的,协议+域名+端口三者一致被认为是同源.网站 ...