Genome Aggregation Database (gnomAD)

这是一个关于什么的数据库?broad institute开发的,整合了目前几乎所有的公共的WES和WGS测序数据,并对数据做了一些总结,可供其他开发者使用。

怎么使用gnomAD?

  • 查感兴趣的基因
  • 查感兴趣的variant

参考人群等位基因频率数据库

基因变异耐受性

可以不做这方面的工作,但是该领域一些最基本的概念必须了解,这样才有问问题和合作的可能性。

参考:

遗传资源数据库专题-gnomAD

gnomAD 数据库简介

gnomAD v2.1 更新后的最大人群测序数据库 到底增强了什么

Genome Aggregation Database (gnomAD) 简介 | 参考人群等位基因频率数据库的更多相关文章

  1. 关于 minor allele frequency(次等位基因频率)的理解

    引用自NCBI的概念(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/docs/rs_attributes.html#gmaf) Global minor alle ...

  2. plink, vcftool计算等位基因频率(allele frequency,vcf)

    计算等位基因频率有两种方式,第一种用vcftool计算: /path/to/vcftools --vcf file.vcf --freq --chr 1 --out filefreq 很简单的一个命令 ...

  3. Kettle 4.2源码分析第四讲--KettleJob机制与Database插件简介(含讲解PPT)

    1.  Job机制 一个job项代表ETL控制流中的一项逻辑任务.Job项将会顺序执行,每个job项会产生一个结果,能作为别的分支上job项的条件. 图 1 job项示例 1.1. Job类图简介 图 ...

  4. 【数据库-Azure SQL Database】JDBC 如何连接 SQL Azure 数据库

    使用 JAVA 代码连接 Azure SQL Database 时产生了 SSL 错误,对于此问题大多数用户都是因为不知如何编写 JDBC 连接字符串而产生的,以下为相关示例代码,供您参考:   pa ...

  5. MariaDB数据库 ----数据库简介,用户管理,数据库创建,数据类型、数据增删改(实例演示)

    数据库简介 数据库--即电子文件柜,用户可以对文件中的数据进行增,删,改,查等操作. 数据库分类 关系型数据库 关系型数据库管理系统(Relational Database Management Sy ...

  6. mybatis3.0-[topic10-14] -全局配置文件_plugins插件简介/ typeHandlers_类型处理器简介 /enviroments_运行环境 /多数据库支持/mappers_sql映射注册

    mybatis3.0-全局配置文件_   下面为中文官网解释 全局配置文件的标签需要按如下定义的顺序: <!ELEMENT configuration (properties?, setting ...

  7. Objective-C ,ios,iphone开发基础:ios数据库(The SQLite Database),使用终端进行简单的数据库操作

    SQLite  是一个轻量级的免费关系数据库.SQLite最初的设计目标是用于嵌入式系统,它占用资源非常少,在嵌入式设备中,只需要几百K的内存就够了,可以在(http://www.sqlite.org ...

  8. [置顶] Objective-C ,ios,iphone开发基础:ios数据库(The SQLite Database),使用终端进行简单的数据库操作

    SQLite  是一个轻量级的免费关系数据库.SQLite最初的设计目标是用于嵌入式系统,它占用资源非常少,在嵌入式设备中,只需要几百K的内存就够了,可以在(http://www.sqlite.org ...

  9. EF CodeFirst简介、默认约定、数据库初始化策略

    CodeFirst 工作流程 创建或修改领域类-->使用数据注解或者Fluent API来配置领域类-->使用自动数据库迁移技术或者基于代码的数据库迁移技术来创建数据库. CodeFirs ...

随机推荐

  1. 解决mysql跟php不在同一台机器上,编译安装php服务报错问题:configure: error: Cannot find MySQL header files under /application/mysql.

    在编译安装php服务时报错: configure: error: Cannot find MySQL header files under /application/mysql. Note that ...

  2. tomcat运行一段时间出“org.apache.coyote.http11.Http11Processor.service Error parsing HTTP request header”

    试了好多种方法,貌似还是没有解决问题,不过也学到了点东西,记录下备忘吧. 异常详情: 1.首先看到最多的就是说在server.xml中的Connector中添加maxHttpHeaderSize=&q ...

  3. SOAP知识点

    SOAP简介: SOAP 是基于 XML 的简易协议,可使应用程序在 HTTP 之上进行信息交换. 或者更简单地说:SOAP 是用于访问网络服务的协议. 1.什么是 SOAP? SOAP 指简易对象访 ...

  4. ISCC之web1

    由题意知,爆破可行. 简单说一下抓包过程,第一个抓到的POST包直接放掉,右键扫描站点,扫出来第二个POST包,第二个POST包cookie,验证码,密码均为空,于是我开始尝试去利用, 经过几次rep ...

  5. 如何设置CentOS 7获取动态IP和静态IP

    自动获取动态IP地址 1.输入“ip addr”并按回车键确定,发现无法获取IP(CentOS 7默认没有ifconfig命令),记录下网卡名称(本例中为ens33). 2.输入“cd /etc/sy ...

  6. djangCrm

    ---恢复内容开始--- 一> 在数据库进行循环取多对多 def get_classlist(self): l=[] for cls in self.class_list.all(): l.ap ...

  7. Python开发笔记之-字符串函数

    1.首字母大写 >>> s = 'yuanzhumuban' >>> s.capitalize() 'yuanzhumuban'  2.replace,替换 > ...

  8. Oracle 序号函数

    Oracle提供的序号函数:以emp表为例:1: rownum 最简单的序号 但是在order by之前就确定值.select rownum,t.* from emp t order by ename ...

  9. CentOS7 部署 ElasticSearch7.0.1 集群

    环境 主机名 IP 操作系统 ES 版本 test1 192.168.1.2 CentOS7.5 7.0.1 test2 192.168.1.3 CentOS7.5 7.0.1 test3 192.1 ...

  10. Python爬取网页信息

    Python爬取网页信息的步骤 以爬取英文名字网站(https://nameberry.com/)中每个名字的评论内容,包括英文名,用户名,评论的时间和评论的内容为例. 1.确认网址 在浏览器中输入初 ...