Genome Aggregation Database (gnomAD)

这是一个关于什么的数据库?broad institute开发的,整合了目前几乎所有的公共的WES和WGS测序数据,并对数据做了一些总结,可供其他开发者使用。

怎么使用gnomAD?

  • 查感兴趣的基因
  • 查感兴趣的variant

参考人群等位基因频率数据库

基因变异耐受性

可以不做这方面的工作,但是该领域一些最基本的概念必须了解,这样才有问问题和合作的可能性。

参考:

遗传资源数据库专题-gnomAD

gnomAD 数据库简介

gnomAD v2.1 更新后的最大人群测序数据库 到底增强了什么

Genome Aggregation Database (gnomAD) 简介 | 参考人群等位基因频率数据库的更多相关文章

  1. 关于 minor allele frequency(次等位基因频率)的理解

    引用自NCBI的概念(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/docs/rs_attributes.html#gmaf) Global minor alle ...

  2. plink, vcftool计算等位基因频率(allele frequency,vcf)

    计算等位基因频率有两种方式,第一种用vcftool计算: /path/to/vcftools --vcf file.vcf --freq --chr 1 --out filefreq 很简单的一个命令 ...

  3. Kettle 4.2源码分析第四讲--KettleJob机制与Database插件简介(含讲解PPT)

    1.  Job机制 一个job项代表ETL控制流中的一项逻辑任务.Job项将会顺序执行,每个job项会产生一个结果,能作为别的分支上job项的条件. 图 1 job项示例 1.1. Job类图简介 图 ...

  4. 【数据库-Azure SQL Database】JDBC 如何连接 SQL Azure 数据库

    使用 JAVA 代码连接 Azure SQL Database 时产生了 SSL 错误,对于此问题大多数用户都是因为不知如何编写 JDBC 连接字符串而产生的,以下为相关示例代码,供您参考:   pa ...

  5. MariaDB数据库 ----数据库简介,用户管理,数据库创建,数据类型、数据增删改(实例演示)

    数据库简介 数据库--即电子文件柜,用户可以对文件中的数据进行增,删,改,查等操作. 数据库分类 关系型数据库 关系型数据库管理系统(Relational Database Management Sy ...

  6. mybatis3.0-[topic10-14] -全局配置文件_plugins插件简介/ typeHandlers_类型处理器简介 /enviroments_运行环境 /多数据库支持/mappers_sql映射注册

    mybatis3.0-全局配置文件_   下面为中文官网解释 全局配置文件的标签需要按如下定义的顺序: <!ELEMENT configuration (properties?, setting ...

  7. Objective-C ,ios,iphone开发基础:ios数据库(The SQLite Database),使用终端进行简单的数据库操作

    SQLite  是一个轻量级的免费关系数据库.SQLite最初的设计目标是用于嵌入式系统,它占用资源非常少,在嵌入式设备中,只需要几百K的内存就够了,可以在(http://www.sqlite.org ...

  8. [置顶] Objective-C ,ios,iphone开发基础:ios数据库(The SQLite Database),使用终端进行简单的数据库操作

    SQLite  是一个轻量级的免费关系数据库.SQLite最初的设计目标是用于嵌入式系统,它占用资源非常少,在嵌入式设备中,只需要几百K的内存就够了,可以在(http://www.sqlite.org ...

  9. EF CodeFirst简介、默认约定、数据库初始化策略

    CodeFirst 工作流程 创建或修改领域类-->使用数据注解或者Fluent API来配置领域类-->使用自动数据库迁移技术或者基于代码的数据库迁移技术来创建数据库. CodeFirs ...

随机推荐

  1. Kubernetes- Dashboard 部署

    获取dashboard 的yaml文件 wget wget https://raw.githubusercontent.com/kubernetes/dashboard/v1.10.1/src/dep ...

  2. Linux学习笔记之一

    基本命令 关机/重启 [root@allen ~]# [当前登录用户@主机名 当前所在目录]# 当前用户身份 #号表示管理员root $表示普通用户登录 如何关机 如何重启 系统硬件信息查看 关机命令 ...

  3. SQL server分页的四种方法

    SQL server分页的四种方法 1.三重循环: 2.利用max(主键); 3.利用row_number关键字: 4.offset/fetch next关键字 方法一:三重循环思路  先取前20页, ...

  4. git 常见的命令和错误

  5. scp 服务器之间远程复制

    从本地服务器复制到远程服务器: (1) 复制文件: 命令格式: scp local_file remote_username@remote_ip:remote_folder 或者 scp local_ ...

  6. CCS设置第一个li的元素与其他li样式不同

    <div class="ly-content-list"> <ul> <li> <div class="title"& ...

  7. P1311 选择客栈[模拟]

    题目描述 丽江河边有nn家很有特色的客栈,客栈按照其位置顺序从 11到nn编号.每家客栈都按照某一种色调进行装饰(总共 kk 种,用整数 00 ~k-1k−1 表示),且每家客栈都设有一家咖啡店,每家 ...

  8. DT二次开发之-资讯列表中调用 TAG 关键词

    资讯列表加文章关键词:(列表或搜索主字段加上 ,tag) {if $t[tag]} <p class="key"> 关键词: {php $tag = str_repla ...

  9. python获取当前文件夹下所有文件名【转】

    os 模块下有两个函数: os.walk() os.listdir() 1 # -*- coding: utf-8 -*- 2 3 import os 4 5 def file_name(file_d ...

  10. Yum 安装memcached 与缓存清空

    1.安装 root@pts/0 # yum -y install memcached 2.启动服务         root@pts/0 # /etc/init.d/memcached start 3 ...