xgene:疾病相关基因,耳聋,彩色,老年痴呆,帕金森
神经元的传递:一个下游神经元,它接受其上游神经元的各个突触传过来的信号,然而,每个突触对该下游神经元的激活权重是不同的。
从神经网络的本质上说,当人连续、多次遭受失败的时候,大脑内就会释放大量的抑制性的神经递质,会削弱突触连接。已知有一种叫γ-氨基丁酸 是强的神经抑制剂。
耳聋基因:xgene43
国内常规耳聋基因检测当中所测的4个耳聋相关基因。一共4个基因。它们分别是:
GJB2 :chr13 长臂。隐性遗传。在耳蜗细胞当中,由GJB2等 6种单体蛋白组成完整的Connexin蛋白,负责细胞内外的钾离子的电位平衡,并负责传递生物电信号。 当GJB2发生突变的时候,就会导致耳蜗的生物电信号的传递故障,进而导致耳聋。 突变类型多,黄种人中,最常见的是在第235位缺失一个C碱基(235delC);而在白种人当中,最常见的是在第35位缺少一个G碱基 (35delG)。
SLC26A4:别名叫:“PDS基因”,隐性遗传的。
线粒体上的第1555位点A>G突变、和第1494位点C>T突变,突变本身不会导致耳聋,但会对氨基糖苷类的药物十分敏感,只要使用少量的该类的药物,就会导致不可逆的耳聋。
GJB3:类似GJB2,其538位C>T突变,是一个致病突变。
原理:
一个完整的Connexin蛋白,会在细胞膜上形成一个供离子进出的小孔。
来自2个相邻细胞的2个完整Connexin蛋白小孔,相互对上,就形成一个通透两个细胞的离子通道。
当离子通过这个离子通道时,就会在两个细胞之间引起电流、和电压的变化。而电流、和电压的变化达到一定的强度,就会引发神经细胞的兴奋,进而达到传递信号的目的。
综合征型的耳聋,和其它的耳聋相关基因
EDN3、EDNRB、MITF、PAX3、SNAI2、和SOX10,这些基因突变,可以会导致Waardenburg综合征。显性遗传病。
EYA1、SIX1、和SIX5,这三个基因当中的一个发生突变,就会引起Branchiootorenal 综合征,显性遗传病。
COL2A1 、或者COL11A1基因突变,会导致Stickler syndrome(综合征)。显性遗传病。
MYO7A、CDH23、USH2A、CLRN1,这些基因突变,会导致Usher syndrome(马谢尔综合征)。隐性遗传疾病。
RHYH、或者PEX7基因突变导致Refsum disease,隐性遗传病。这种病的主要表现是视觉、嗅觉、和听觉丧失。
COL4A3、COL4A4、COL4A5的基因突变,可以导致Alport综合征。它的特点是:肾脏疾病、听力下降、眼部异常。

彩色视觉相关基因:xgene44
直接感知彩色光波的,是三种视蛋白。它们分别感知:短、中、长,三种波长的光波。
编码这三个视蛋白的基因,分别是:
- OPN1SW:短420nm,蓝,chr7长臂,
- OPN1MW:中530nm,绿,chr X长臂,与长波只有7个aa差别
- OPN1LW:长560nm,黄绿,chr X长臂,
老年痴呆基因:xgene45
老年痴呆症,又称阿尔茨海默症(Alzheimer's disease)是一种慢性的、神经退行性疾病。
主要的表现是:刚开始的时候,记忆力衰退;随后,语言出现问题、认知出现问题;再发展到生活不能自理,最终死亡。
目前,已知的4个与老年痴呆症紧密相关的基因,是:
- APP基因:编码Amyloid beta precursorprotein,即“β淀粉样前体蛋白”。
- PSEN1基因:与下面基因序列有60%一样。
- PSEN2基因、
- APOE基因。它编码一个299个aa的蛋白质。是一种载脂蛋白,它参与乳糜微粒和中间密度脂蛋白代谢。APOE主要有3个等位基因:APOE2、APOE3、和APOE4。差别在于第112位、和第158位的2个氨基酸残基,是半胱氨酸,还是精氨酸。(可更详细)
APP基因详解:

APP蛋白在被翻译出来之后,就被转运到细胞膜上,N端的大部分露在细胞膜外,被称为胞外域,ectodomain。
这部分会被酶给切下来,并参与神经细胞的多种功能。动物实验表明,这个胞外域肽段,对于动物的认识功能十分重要。
APP蛋白的C端,留在胞质内,它也会被γ分泌酶复合物给切下来,在随后的细胞内蛋白质降解过程当中,被降解掉。

被切掉了N端、和C端之后的,剩下的中间这一段。这个中间段的N端可以是被α分泌酶在这个位置切断的,也可以是被β分泌酶在这个位置切断的。
- 如果它的N端是被α分泌酶切断,然后它的C端是被γ分泌酶切断,那么这个中间段就是p3肽。p3肽可以溶解在水中的,不会形成β淀粉样蛋白沉淀。
- 如果这个中间段的N端是被β分泌酶所切断,然后C端再被γ分泌酶切一下,那么,这样形成的中间段就是β淀粉样多肽,这会比被α分泌酶所切断的位置,多出16个aa残基。 因为这多出的16个氨基酸残基,让β淀粉样多肽在水中的溶解度变得较差。
- 多个β淀粉样多肽很容易相互聚集起来,形成beta淀粉多肽的寡聚物、和β淀粉样蛋白沉淀。
psen1 2 详解

PSEN1和PSEN2,这两个基因所翻译出来的蛋白,都是γ分泌酶复合物的组成部分。
分泌酶复合物 在切割APP蛋白的时候 所产生的β淀粉蛋白多肽,可以40个氨基酸残基的,也可以是42个氨基酸残基的。
而42个氨基酸残基的β淀粉蛋白多肽的溶解度更低。更容易发生聚合、沉淀,形成斑块。所以42个残基的多肽的毒性更大。
PSEN1、或者PSEN2基因的突变,都会导致γ分泌酶复合物在切割APP蛋白的时候,产生更多的42个氨基酸残基的多肽。
这就是这两种基因的突变,会导致早老性痴呆的原因。
β 淀粉样蛋白 的致病机理
正常情况下,溶解状态的β淀粉样多肽、β淀粉样多肽的寡聚物、和β淀粉样蛋白沉淀,这三种形式之间,是可以相互转化的。
在人大脑中,正常情况下β淀粉样多肽的清除速度是每小时清除8%,当产生多肽的速度大于清除的速度,就会导致β淀粉样多肽,聚集成寡聚物,或者聚集成β淀粉样蛋白沉淀。
清除β淀粉样多肽的酶包括:脑啡肽酶(neprilysin)、胰岛素降解酶(insulin degrading enzyme)等。
现在已经发现的,β淀粉样多肽导致老年痴呆症的几种致病机理如下:
- Beta淀粉样多肽聚集成的纤维,这种纤维能够引发神经元细胞的凋亡
- Beta淀粉样多肽聚合成的纤维,会堵在神经元的突触间隙之间,直接影响神经元信号的传递
- 溶解的β淀粉多肽,会影响tau蛋白的(被)切割、和磷酸化
而tau蛋白的(被)切割和磷酸化,是神经元死亡 并形成神经元纤维缠结的重要原因。
关于老年痴呆症,目前的科学研究,还只了解了一部分的发病机理。
帕金森疾病
主要临床表现为:静止性震颤、运动迟缓、肌张力高、走路姿势、和站立姿势都出现异常。
同时患者还可能伴有:抑郁、便秘、睡眼障碍、和痴呆等症状。病情会逐步加重。病人从发病到死亡,可能会经历10~20年的时间。
在所有的神经退行性疾病当中,老年痴呆症的发病率排第1,帕金森病的发病率排第2。
已经发现的与帕金森病相关的基因有30多个。重点谈其中的5个:
- SNCA、
- LRRK2、
- MAPT、
- PARK2、
- PINK1:
1,SNCA基因突变:一般是认为SNCA基因的点突变,会导致α-突触核蛋白更加容易聚集成Lewy小体;或SNCA基因拷贝数异常增加,会直接增加α-突触核蛋白的数量,过多的α-突触核蛋白,就聚集成Lewy小体。。。而Lewy小体阻碍了多巴胺的代谢,和神经元的正常功能,导致神经元的死亡。
2,现在一般认为,LRRK2基因所表达的蛋白的功能,主是是参与细胞骨架的组装,以及参与蛋白与蛋白之间的相互作用。显性遗传。。
3,MAPT基因,就是“微管相关蛋白tau”,编码TAU蛋白。TAU蛋白,是组成微管的一个重要组成部分。已经发现了40多种MAPT基因的突变,与帕金森病的发病相关。
4,PARK2基因,又名Parkin基因。它编码一个泛素连接酶。
泛素连接酶,会把细胞内的蛋白质连接上泛素,让蛋白质进入泛素降解途径,把蛋白质给降解掉。
当PARK2(Parkin)基因发生突变,就不能把该降解的蛋白质连上泛素,这样,多余的蛋白质就不能被降解,而会堆积在细胞内。
5,PINK1基因有“维持线粒体功能”的作用。隐性遗传的。
在正常情况下,PINK1的蛋白可以被蛋白酶切断,并进入线粒体的内膜,发挥正常作用,而线粒体的内膜也可以保持正常的极化。
而当PINK1的蛋白有突变的时候,它不能被蛋白酶切断,也就不能进入线粒体的内膜,这样线粒体的内膜就会去极化,最终导致神经元细胞的死亡。
现在已经在PINK1上,发现了70多种突变,会导致帕金森病。
一般认为,它们是通过参与以下这4个生物通路,导致帕金森病的:
1,突触的神经信号传递
2,细胞内的物质运输
3,溶酶体的自噬作用
4,线粒体的代谢
xgene:疾病相关基因,耳聋,彩色,老年痴呆,帕金森的更多相关文章
- 【GWAS文献】基于GWAS与群体进化分析挖掘大豆相关基因
Resequencing 302 wild and cultivated accessions identifies genes related to domestication and improv ...
- Oncomine: 一个肿瘤相关基因研究的数据库--转载
如果你获得了一个肿瘤差异表达基因,想研究其是否可作为某种肿瘤的潜在标志物和靶点,又怕做实验会得到阴性结果,浪费时间和金钱,这时候你就应该想到Oncomine数据库了(www.oncomine.org) ...
- xgene:肿瘤相关基因 KRAS,,BRAF,,通路PI3K-AKT
KRAS基因 一个是KRAS1,位于chr6 短臂上,是一个“假基因”,它不能被转录成RNA,故没有功能的 另一个是KRAS2,位于chr12 短臂上..是“真基因”,是能够转录.并且翻译成蛋白的,是 ...
- xgene:肿瘤相关基因 EGFR,,Her2,,TP53,,ALK
EGFR: “Epidermal growth factor receptor”,表皮生长因子受体.别名:ErbB1,或 HER1 EGFR是ErbB基因家族的成员之一.ErbB基因家族包括了:EGF ...
- 寻找与疾病相关的SNP位点——R语言从SNPedia批量提取搜索数据
是单核苷酸多态性,人的基因是相似的,有些位点上存在差异,这种某个位点的核苷酸差异就做单核苷酸多态性,它影响着生物的性状,影响着对某些疾病的易感性.SNPedia是一个SNP调査百科,它引用各种已经发布 ...
- HumanNet v2:用于疾病研究的人类基因网络 X科研网
HumanNet v2:用于疾病研究的人类基因网络人类基因网络已被证明在疾病研究的许多方面都很有用,已经开发了许多基于网络的策略来产生关于基因 - 疾病 - 药物关联的假设.预测和组织与特定疾病最相关 ...
- HapMap
HapMap五周年回顾 2011-01-12 | 作者: [关闭] 作者简介:曾长青,中国科学院北京基因组所研究员,博士生导师.CUSBEA奖学金.百人计划.杰出青年基金.首批新世纪百千万人才工程国家 ...
- (转)HapMap简介
1.人类基因组的HapMap和国际HapMap计划 (1)何谓HapMap HapMap是Haplotype Map 的简称,Haplo意为单一,在基因组中专指来自父母的一对染色体中的一条.Haplo ...
- SNPs & MAF
SNPs,全称是single nucleotide polymorphisms,SNPs等位基因频率的容易估计.采用混和样本估算等位基因的频率是种高效快速的策略.该策略的原理是:首先选择参考样本制作标 ...
随机推荐
- windows与VMware ubuntu虚拟机实现文件共享
本文基本摘自:无限挑战者的博客 本人用的系统是win10系统,应该区别不大,实现的是win10系统和VMWare虚拟机Ubantu系统之间的文件共享.到网上找了很多的方法各种各样的方式,由于对Linu ...
- 前端基础-CSS属性操作
前端基础-CSS属性操作 css text 文本颜色:color 颜色属性被用来设置文字的颜色. 颜色是通过CSS最经常的指定: 十六进制值 - 如: #FF0000 一个RGB值 - 如: RGB( ...
- 剑指offer——不能被继承的类
方法一:通过将类的构造函数和析构函数声明成private来防止子类继承.声明静态的方法来构造和析构类的对象. 但是用起来不是很方便.只能得到在堆上的实例,而不能得到在栈上的实例. 方法二:构造辅助类C ...
- java深入探究06
Tomcat中获取资源文件: ServletContext().getRealPath(/WEB-INF/classes/db.properties);//获取资源文件的在服务器中的绝对路径 Serv ...
- Codeforces Round #250 (Div. 2) A, B, C
A. The Child and Homework time limit per test 1 second memory limit per test 256 megabytes input sta ...
- c#子线程执行完怎么通知主线程
定义一个委托实现回调函数 public delegate void CallBackDelegate(string message); 程序开始的时候 //把回调的方法给委托变量 CallBackDe ...
- java支付宝开发-00-资源帖
一.一些重要的官方文档 1.沙箱登录 2.沙箱环境使用说明 3.如何使用沙箱环境 4.当面付产品介绍 5.扫码支付接入指引 6.当面付快速接入 7.当面付接入必读 8.当面付进阶功能 9.当面付异步通 ...
- linux命令学习笔记(35):ln 命令
ln是linux中又一个非常重要命令,它的功能是为某一个文件在另外一个位置建立一个同步的链接.当我们需要在 不同的目录,用到相同的文件时,我们不需要在每一个需要的目录下都放一个必须相同的文件,我们只要 ...
- Android中高效的显示图片之一 ——加载大图
在网上看了不少文章,发现还是官方文档介绍最详细,把重要的东西简单摘要出来.详细可看官方文档地址 ( http://www.bangchui.org/read.php?tid=9 ) . 在应用中显示图 ...
- 如何实现1080P延迟低于500ms的实时超清直播传输技术
再来当一次技术搬运工,内容来自高可用框架,学霸君工程师袁荣喜的如何实现1080P延迟低于500ms的实时超清直播传输技术. 导语:视频直播是很多技术团队及架构师关注的问题,在实时性方面,大部分直播是准 ...