背景

由于业务变迁,合规要求,我们需要删除大量非本公司的数据,涉及到上百张表,几个T的数据清洗。我们的做法是先从基础数据出发,将要删除的数据id收集到一张表,然后再由上往下删除子表,多线程并发处理。

我们使用的是阿里的polardb,完全兼容mysql协议,5.7版本,RC隔离级别。删除过程一直很顺利,突然有一天报了大量:“Lock wait timeout exceeded; try restarting transaction”。从日志上看是获取锁失败了,马上想到出现死锁了,但我们使用RC,这个隔离级别下会出现不可重复读和幻读,但没有间隙锁等,并发效率比较高,在我们实际应用过程中,也很少遇到加锁失败的问题。

单从日志看我们确实先入为主了,以为是死锁问题,但sql比较简单,表数据量在千万级别,其中task_id和uid均有索引,如下:

delete from t_table_1 where task_id in (select id from t_table_2 where uid = #{uid})

拿到报错的参数,查询要删除的数据也不多,联系dba同学确认没有死锁日志,但出现大量慢sql,那为什么这条sql会是慢sql呢?

问题复现

表结构简化如下:

CREATE TABLE `t_table_1` (
`id` bigint(20) NOT NULL AUTO_INCREMENT,
`task_id` bigint(20) NOT NULL,
PRIMARY KEY (`id`),
KEY `idx_task_id` (`task_id`)
) ENGINE=InnoDB; CREATE TABLE `t_table_2` (
`id` bigint(20) NOT NULL AUTO_INCREMENT,
`uid` bigint(20) NOT NULL,
PRIMARY KEY (`id`),
KEY `idx_uid` (`uid`)
) ENGINE=InnoDB;

开始我们拿sql到数据库查询平台查库执行计划,无奈这个平台有bug,delete语句无法查看,所以我们改成select,“应该”是一样。这个“应该”加了双引号,导致我们走了一点弯路。

EXPLAIN SELECT * from t_table_1 where task_id in (select id from t_table_2 where uid = 1)

explain后可以看到是走了索引的

到这里可以总结:

1.没有死锁,这点比较肯定,因为没有日志,也符合我们的理解。

2.有慢sql,这点比较奇怪,通过explain select语句是走索引的,但数据库慢日志记录到,全表扫描,不会错。

那是select和delete的执行计划不同吗?正常来说应该是一样的,delete无非就是先查,加锁,再删。

拿到本地环境执行再次查看执行计划,发现确实不同,select的是一样的,但delete的变成全表扫描了。

首先这就符合问题现象了,虽然没有死锁,但每个delete语句都全表扫描,相当于全表加锁,后面的请求就只能等待释放锁,等到超时就出现“Lock wait timeout exceeded”。

那为什么delete会不走索引呢,接下来我们分析一下。

分析

select * from t_table_1 where task_id in (select id from t_table_2 where uid = #{uid})

回到这条简单sql,包含子查询,按照我们的理解,mysql应该是先执行子查询:select id from t_table_2 where uid = #{uid},然后再执行外部查询:select * from t_table_1 where task_id in(),但这不一定,例如我关了这个参数:

set optimizer_switch='semijoin=off';

这里我们先不用管这个参数的作用,下面会说到。

关闭后上面的sql就变成先扫描外部的t_table_1,然后再逐行去匹配子查询了,假设t_table_1的数据量非常大,那全表扫描时间就会很长,我们可以通过optimizer_trace证明一下。

optimizer_trace是mysql一个跟踪功能,可以跟踪优化器做的各种决策,包括sql改写,成本计算,索引选择详细过程,并将跟踪结果记录到INFORMATION_SCHEMA.OPTIMIZER_TRACE表中。

set session optimizer_trace="enabled=on";
set OPTIMIZER_TRACE_MAX_MEM_SIZE=10000000; -- 防止内容过多被截断
SELECT * from t_table_1 where task_id in (select id from t_table_2 where uid = 1)
SELECT * FROM INFORMATION_SCHEMA.OPTIMIZER_TRACE;

输出结果比较长,这里我只挑选主要信息

"steps": [
{
"expanded_query": "/* select#2 */ select `t_table_2`.`id` from `t_table_2` where (`t_table_2`.`uid` = 1)"
},
{
"transformation": {
"select#": 2,
"from": "IN (SELECT)",
"to": "semijoin",
"chosen": false
}
},
{
"transformation": {
"select#": 2,
"from": "IN (SELECT)",
"to": "EXISTS (CORRELATED SELECT)",
"chosen": true,
"evaluating_constant_where_conditions": [
]
}
}
] "expanded_query": "/* select#1 */ select `t_table_1`.`id` AS `id`,`t_table_1`.`task_id` AS `task_id` from `t_table_1` where <in_optimizer>(`t_table_1`.`task_id`,<exists>(/* select#2 */ select `t_table_2`.`id` from `t_table_2` where ((`t_table_2`.`uid` = 1) and (<cache>(`t_table_1`.`task_id`) = `t_table_2`.`id`)))) limit 0,1000"

sql简写一下就是

select * from t_table_1 t1 where exists (select t2.id from t_table_2 t2 where t2.uid = 1 and t1.task_id = t2.id)

可以看到in可以改成semijoin或exists,最终优化器选择了exists,因为我们关闭了semijoin开关。

按照这条sql逻辑查询,将会遍历t_table_1表的每一行,然后代入子查询看是否匹配,当t_table_1表的行数很多时,耗时将会很长。

通过explain观察执行计划可以看到t_table_1进行了全表扫描。

备注:想查看优化器改下后生成的sql,也可以通过show extended + show warnings:

explain extended SELECT * from t_table_1 where task_id in (select id from t_table_2 where uid = 1);
show warnings;

接着我们打开上面的参数开关,再次optimizer_trace跟踪一下

set optimizer_switch='semijoin=on';

得到如下:

"steps": [
{
"expanded_query": "/* select#2 */ select `t_table_2`.`id` from `t_table_2` where (`t_table_2`.`uid` = 1)"
},
{
"transformation": {
"select#": 2,
"from": "IN (SELECT)",
"to": "semijoin",
"chosen": true
}
}
] "expanded_query": "/* select#1 */ select `t_table_1`.`id` AS `id`,`t_table_1`.`task_id` AS `task_id` from `t_table_1` semi join (`t_table_2`) where (1 and (`t_table_2`.`uid` = 1) and (`t_table_1`.`task_id` = `t_table_2`.`id`)) limit 0,1000"

sql简写一下就是

select * from t_table_1 semi join t_table_2 where (`t_table_2`.`uid` = 1 and `t_table_1`.`task_id` = `t_table_2`.`id`)"

可以看到优化器这次选择将in转换成semijoin了,观察执行计划可以看到走了索引。

那如果换成delete呢?同样保持开关打开,跟踪如下:

"steps": [
{
"expanded_query": "/* select#2 */ select `t_table_2`.`id` from `t_table_2` where (`t_table_2`.`uid` = 1)"
},
{
"transformation": {
"select#": 2,
"from": "IN (SELECT)",
"to": "semijoin",
"chosen": false
}
},
{
"transformation": {
"select#": 2,
"from": "IN (SELECT)",
"to": "EXISTS (CORRELATED SELECT)",
"chosen": true,
"evaluating_constant_where_conditions": [
]
}
}
]

可以看到和关闭semijoin一样,对于delete优化器也是选择了exists,我们表是千万级别,全表扫描加锁,其它操作语句自然都会超时获取不到锁而失败。

semijoin

semijoin翻译过来是半连接,是mysql针对in/exists子查询进行优化的一种技术,参见文档

可以使用SHOW VARIABLES LIKE 'optimizer_switch';查看semijoin是否开启。

上面使用IN-TO-EXISTS改写后,外层表变成驱动表,效率很差,那如果使用inner join呢,使用条件过滤后,用小表驱动大表,但join查询结果是会重复的,和子查询语义不一定相同。如:

SELECT class.class_num, class.class_name
FROM class
INNER JOIN roster
WHERE class.class_num = roster.class_num;

这样会查询出多条相同class_num的记录,如果子查询,那么查询出来的class_num是不一样的,也就是去重。当然也可以加上distinct,但这样效率比较低。

SELECT class_num, class_name
FROM class
WHERE class_num IN
(SELECT class_num FROM roster);

semijoin有以下几种策略,以下是官方的解释:

Duplicate Weedout: Run the semijoin as if it was a join and remove duplicate records using a temporary table.

FirstMatch: When scanning the inner tables for row combinations and there are multiple instances of a given value group, choose one rather than returning them all. This "shortcuts" scanning and eliminates production of unnecessary rows.

LooseScan: Scan a subquery table using an index that enables a single value to be chosen from each subquery's value group.

Materialize the subquery into an indexed temporary table that is used to perform a join, where the index is used to remove duplicates. The index might also be used later for lookups when joining the temporary table with the outer tables; if not, the table is scanned. For more information about materialization, see Section 8.2.2.2, “Optimizing Subqueries with Materialization”.

以Duplicate Weedout为例,mysql会先将roster的记录以class_num为主键添加到一张临时表,达到去重的目的。接着扫描临时表,每行去匹配外层表,满足条件则放到结果集,最终返回。

具体使用哪种策略是优化器根据具体情况分析得出的,可以从explain的extra字段看到。

那么为什么delete没有使用semijoin优化呢?

这其实是mysql的一个bug,bug地址,描述场景和我们的一样。

文中还提到这个问题在mysql 8.0.21被修复,地址

大致就是解释了一下之前版本没有支持的原因,提到主要是因为单表没有可以JOIN的对象,没法进行一系列的优化,所以单表的UPDATE/DELETE是无法用semijoin优化的。

这个优化还有一些限制,例如不能使用order by和limit,我们还是应该尽量避免使用子查询。

在我们的场景通过将子查询改写为join即可走索引,现在也明白为什么老司机们都说尽量用join代替了子查询了吧。

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