vennDiagram包中的主函数绘图时,好像不直接支持PDF格式文件:

dat = list(a = group_out[[1]][,1],b = group_out[[2]][,1])
names(dat) <- group_names[1:2] venn.plot <- venn.diagram(
dat,
filename = "proteinGroup_venn.tiff", #pdf error
imagetype = "tiff", #pdf error
lwd = 3,
col = "transparent",
fill = c("cornflowerblue", "darkorchid1"),
alpha = 0.6,
label.col = "black",
cex = 1.5,
fontfamily = "serif",
fontface = "bold",
cat.col = c("cornflowerblue", "darkorchid1"),
cat.cex = 2,
cat.fontfamily = "serif",
cat.fontface = "bold",
margin = 0.05,
cat.dist = c(0.03, 0.03),
cat.pos = c(-20, 20)
)

直接使用pdf保存矢量图时不行,只能用tiff等其他矢量图格式。但在函数外结合grid.draw可以保存:

venn.plot <- venn.diagram(
dat,
filename = NULL, #设为空
lwd = 3,
col = "transparent",
fill = c("cornflowerblue", "darkorchid1"),
alpha = 0.6,
label.col = "black",
cex = 1.5,
fontfamily = "serif",
fontface = "bold",
cat.col = c("cornflowerblue", "darkorchid1"),
cat.cex = 2,
cat.fontfamily = "serif",
cat.fontface = "bold",
margin = 0.05,
cat.dist = c(0.03, 0.03),
cat.pos = c(-20, 20)
) pdf(file="proteinGroup_venn.pdf")
grid.draw(venn.plot)
dev.off()

如果不行,先安装加载library(grDevices)包。图如下:

Ref:https://stackoverflow.com/questions/14243609/problems-with-venndiagram

[R] venn.diagram保存pdf格式文件?的更多相关文章

  1. 导出文本、表格、图像到PDF格式文件中(学习整理)

    1.测试例子: 需要导入的外部jar包: 相关API http://www.coderanch.com/how-to/javadoc/itext-2.1.7/com/lowagie/text/pack ...

  2. winform利用itextsharp.dll实现图片文件转换PDF格式文件

    1.利用itextsharp.dll实现单个图片文件转换为PDF格式文件, 可以使用以下类: void ConvertJPG2PDF(string jpgfile, string pdf) { var ...

  3. JSP页面导出PDF格式文件

    JSP页面导出PDF格式文件基本在前端页面可以全部完成 <script src="https://cdnjs.cloudflare.com/ajax/libs/html2canvas/ ...

  4. confluence导出PDF格式文件不显示中文解决

    由于confluence导出PDF格式文件需要应用字体文件,下载字体文件在confluence管理员界面安装即可. 我这里使用从simhei.ttf楷体,可以从windowns主机里下载(c:/win ...

  5. R|批量循环处理同一格式文件-csv,txt,excel

    本文首发于“生信补给站”微信公众号,https://mp.weixin.qq.com/s/8IfMrSr9xc8_1Y2_9Ne6hg 在一个文件夹下有很多字段一致,格式统一的数据文件(csv,txt ...

  6. 前端实现docx、pdf格式文件在线预览

    theme: vuepress highlight: atelier-heath-light 介绍 在业务中,如果遇到文档管理类的功能,会出现需要在线预览的业务需求,本文主要是通过第三方库来实现文档预 ...

  7. Matlab保存uint16格式文件的相关注意事项

    在matlab中,我们常使用imshow()函数来显示图像,而此时的图像矩阵可能经过了某种运算.在matlab中,为了保证精度,经过了运算的图像矩阵I其数据类型会从unit8型变成double型.如果 ...

  8. 页面打开pdf格式文件的方法

    <embed width=500 height=300 fullscreen=yes src="1.pdf" />

  9. Arch Linux PDF格式文件无法显示中文

    From: http://blog.sina.com.cn/s/blog_5e54bc6801012gfg.html $ sudo pacman -S poppler-data

随机推荐

  1. mysql的一些配置操作

    mysql的一些配置操作 一.背景 二.mysql配置 三.慢查询日志 1.命令行临时生效 2.配置文件修改永久生效 3.慢查询日志解释 4.mysqldumpdlow查看慢查询日志 四.查看索引为何 ...

  2. 2021.6.29考试总结[NOIP模拟10]

    T1 入阵曲 二位前缀和暴力n4可以拿60. 观察到维护前缀和时模k意义下余数一样的前缀和相减后一定被k整除,前缀和维护模数,n2枚举行数,n枚举列, 开一个桶记录模数出现个数,每枚举到该模数就加上它 ...

  3. 算法:汉诺塔问题(Tower of Brahma puzzle)

    一.算法背景 最早发明这个问题的人是法国数学家爱德华·卢卡斯.传说越南河内某间寺院有三根银棒(A, B, C),上串 64 个金盘. 寺院里的僧侣依照一个古老的预言,以上述规则移动这些盘子:预言说当这 ...

  4. 同人逼死官方系列!从 DDC 嗅探器到 sddc_sdk_lib 的数据解析

    从 DDC 嗅探器到 sddc_sdk_lib 的数据解析 之前的 DDC 协议介绍 主要讲了设备加入.退出以及维持设备状态,而 SDK框架 sddc_sdk_lib 解析 主要讲了 SDK 库的结构 ...

  5. candy leetcode C++

    There are N children standing in a line. Each child is assigned a rating value. You are giving candi ...

  6. 一步一步学ROP之linux_x64篇(蒸米spark)

    目录 一步一步学ROP之linux_x64篇(蒸米spark) 0x00 序 0x01 Memory Leak & DynELF - 在不获取目标libc.so的情况下进行ROP攻击 0x02 ...

  7. 百亿级小文件存储,JuiceFS 在自动驾驶行业的最佳实践

    自动驾驶是最近几年的热门领域,专注于自动驾驶技术的创业公司.新造车企业.传统车厂都在这个领域投入了大量的资源,推动着 L4.L5 级别自动驾驶体验能尽早进入我们的日常生活. 自动驾驶技术实现的核心环节 ...

  8. Piakchu之RCE漏洞

    一.Ping(远程系统命令执行) 首先正常输入一个ip,查看页面的返回值.发现有乱码,但是能看出执行了ping命令. 查看源代码,可以看到只是对操作系统进行了判断,而对输入内容是否为ip地址并没有判断 ...

  9. 开发属于自己的包,并上传到npm上

    1.DIY开发包 1.1符合标准的包结构 一个规范的包,它的组成结构,必须符合以下3点要求: 包必须以单独的目录而存在 包的顶级目录下,必须包含package.json这个包管理文件 package. ...

  10. C++ 变量声明 定义 作用域 链接性总结

    变量定义 变量的定义用于为变量分配存储空间,还可以为变量指定初始值.在一个程序中,变量有且仅有一个定义. 变量声明 用于向程序表明变量的类型和名字.程序中变量可以声明多次,但只能定义一次. 变量的类型 ...