#!/usr/bin/perl
#perl search.pl --infile Targets.Lung.Carcinoma.genelist.txt --homogene Homo_sapiens.gene_info --outfile Targets.Lung.Carcinoma.geneID.txt
use warnings;
use strict;
use Getopt::Long;

my ($infile,$homogene,$outfile);
GetOptions('infile=s'=>\$infile,'homogene=s'=>\$homogene,'outfile=s'=>\$outfile,"help|h" =>\&USAGE,)or USAGE();

sub USAGE {
my $usage=<<"USAGE";
USAGE:
$0
--infile input filefiel

--homogene Homo_sapiens.gene_info

--outfile output file

USAGE
print $usage;
exit;
}

perl usage()和getopt的更多相关文章

  1. 在 Perl 中使用 Getopt::Long 模块来接收用户命令行参数

    我们在linux常常用到一个程序需要加入参数,现在了解一下 perl 中的有关控制参数的模块 Getopt::Long ,比直接使用 @ARGV 的数组强大多了.我想大家知道在 Linux 中有的参数 ...

  2. 在Perl中使用Getopt::Long模块来接收用户命令行参数

    我们在linux常常用到一个程序需要加入参数,现在了解一下perl中的有关控制参数的函数.getopt.在linux有的参数有二种形式.一种是–help,另一种是-h.也就是-和–的分别.–表示完整参 ...

  3. [Perl] Getopt 函数来接收用户参数的使用

    我们在linux常常用到一个程序需要加入参数,现在了解一下perl中的有关控制参数的函数.getopt.在linux有的参数有二种形式.一种是–help,另一种是-h.也就是-和–的分别.–表示完整参 ...

  4. 生物信息 perl 脚本实战

    索引 1.统计fasta.fa和fastq文件的长度,统计fastq的reads个数,单个reads长度,reads总长度:统计fasta文件中contig的个数,列出名称,单条的长度,以及总长度. ...

  5. 读写生信流程必备的 Perl 语法

    最早就是写Perl的,后来来到公司转Python,现在又要负责流程了,开始重拾Perl,当然是借鉴别人现有的语法,我再重新组合. 基本语法就不介绍了,参照我之前文章 Perl   模块 use str ...

  6. Perl常用语法

    本文主要为了方便阅读.编写perl脚本而记录的常用的命令.语法. 一.条件判断语法 注意,数字 0, 字符串 '0' . "" , 空 list () , 和 undef 为 fa ...

  7. Perl按行分割文件

    Perl按行分割文件 将一个文件按照行数,均等的分割成多个小文件,例如,一个550行的文件,分割为每个文件有100行,则将分割为6个小文件 运行结果 参考代码(split_file.pl) #!/us ...

  8. c语言基础之getopt()

    getopt() #include <unistd.h> int getopt(int argc, char * const argv[], const char *optstring); ...

  9. GO语言的开源库

    Indexes and search engines These sites provide indexes and search engines for Go packages: godoc.org ...

随机推荐

  1. 函数及while实例

    输入1,输出:if 输入2,输出:elif 输入其他数值,输出:else 输入非数字,输出:except def greeting3(name3, lang3=1): if lang3 == 1: r ...

  2. 1.keras实现-->自己训练卷积模型实现猫狗二分类(CNN)

    原数据集:包含 25000张猫狗图像,两个类别各有12500 新数据集:猫.狗 (照片大小不一样) 训练集:各1000个样本 验证集:各500个样本 测试集:各500个样本 1= 狗,0= 猫 # 将 ...

  3. [lr & ps] 色彩空间管理

    色彩空间 • 定义 色彩空间,Color Space,又称作色域.在色彩学中,人们建立了许多色彩模型,以一维.二维.三维甚至四维空间坐标来表示某一色彩,这种坐标系统所能定义的色彩范围即色彩空间.我们经 ...

  4. testng入门教程16数据驱动(把数据写在xml)

    testng入门教程16数据驱动(把数据写在xml) testng入门教程16数据驱动(把数据写在xml)把数据写在xml文件里面,在xml文件右键选择runas---testng执行 下面是case ...

  5. 7.4 Models -- Pushing Records into the Store

    一.概述 1. store是作为一个所有records的缓存,这些records已经被你的应用程序加载.在你的app中如果你的路由或者一个controller请求一条record,如果它在缓存中这个s ...

  6. html09

    1.Jquery的常用方法1)选择器2)操作节点以下的 obj 都是指 jQuery对象 1.操作样式 obj.css() :不加参数是获取节点的css样式 obj.css({"属性&quo ...

  7. 9/252D图的画法

    我们在介绍之前先想想2D图的一些元素 我在这里按我的思路写下一些: 坐标轴(尺度,区间..),线条(样式,颜色...),图和线的标签和注释,图像大小,图像里图片的排版(一张图像中多张图) 下面我们将分 ...

  8. mysql导入数据方法和报错解决

    mysql -u root -p databasename < db.sql 数据库导入数据时,MySQL收到下面异常:ERROR 1153 (08S01): Got a packet bigg ...

  9. 54. Spiral Matrix(剑指offer--19)

    Given a matrix of m x n elements (m rows, n columns), return all elements of the matrix in spiral or ...

  10. 《算法C语言实现》————三道题目

    1.对于N = 10,100和1000,记录你的运行环境中分别运行一下程序所花费的时间.(用python) import datetime global a a = 0 def time_1(s): ...