在运行如下程序时出现“Exception in thread "main" java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space”报错：

java  -jar picard.jar SortVcf \

    I=hg19.sites.vcf \

    O=hg19.sites.sorted.vcf \

 SEQUENCE_DICTIONARY=hg19.dict

　　出现这种报错说明内存不足。因此我们可以加上“-Xmx”参数

java  -Xmx60g -jar picard.jar SortVcf \

    I=hg19.sites.vcf \

    O=hg19.sites.sorted.vcf \

 SEQUENCE_DICTIONARY=hg19.dict

　　

Linux运行Java出现“Exception in thread "main" java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space”报错的更多相关文章

  1. idea中使用scala运行spark出现Exception in thread "main" java.lang.NoClassDefFoundError: scala/collection/GenTraversableOnce$class

    idea中使用scala运行spark出现: Exception in thread "main" java.lang.NoClassDefFoundError: scala/co ...

  2. Java FAQ -- "Exception in thread 'main' java.lang.UnsupportedClassVersionError:"

    OS:Ubuntu 最近重新学习Java,写了一段很小的程序,如下: public class Hello{ public static void main(String args[]){ Syste ...

  3. 【JAVA】Exception in thread "main" java.lang.NoClassDefFoundError

    java新手经常会遇到这个问题. 环境变量配置正确,eclipse下可以正常编译运行,命令行下可以使用javac生成.class文件,但是在当前目录运行的时候提示: 分析报错,可以发现系统从Pack文 ...

  4. Java 控制台执行带自定义包定义的类，出现“Exception in thread "main" java.lang.NoClassDefFoundError: ConnectSQLServer (wrong name: sine/ConnectSQLServer)”

    1.先说明一下代码实现:自定义package sine, 源代码保存路径为:E:\JSP\HibernateDemo\HibernateDemoProject\src\sine\ConnectSQLS ...

  5. Java常见异常:Exception in thread "main" java.lang.NoClassDefFoundError

    在某一路径下执行编译好的class文件出错. 异常如下: E:\liwy>java Test98 Exception in thread "main" java.lang.N ...

  6. Exception in thread "main" java.lang.NoSuchMethodError: org.testng.TestNG.configure(Lorg/testng/CommandLineArgs;)V

    TestNG运行时报以下错误: Exception in thread "main" java.lang.NoSuchMethodError: org.testng.TestNG. ...

  7. xml出现Exception in thread "main" java.lang.NullPointerException

    运行代码出现Exception in thread "main" java.lang.NullPointerException 可以看下这个链接:https://ask.csdn. ...

  8. 编译运行java程序出现Exception in thread "main" java.lang.UnsupportedClassVersionError: M : Unsupported major.minor version 51.0

    用javac编译了一个M.java文件, 然后用java M执行,可是出现了下面这个错误. Exception in thread "main" java.lang.Unsuppo ...

  9. 在dos中运行java程序，若出现Exception in thread “main" java.lang.NoClassDefFoundError

    在dos中运行java程序,若出现Exception in thread “main" java.lang.NoClassDefFoundError,可以检查一下几项: 环境变量配置: 注意 ...

随机推荐

  1. B. Equations of Mathematical Magic

    思路 打表找规律,发现结果是,2的(a二进制位为1总数)次方 代码 #include<bits/stdc++.h> using namespace std; #define ll long ...

  2. Sprint 冲刺第三阶段第3-5天

    陈汝婷:数据库的实现 具体实现用户登录在数据库中查找,用户注册的时候可以将用户的具体信息存放于SD卡中.刚学Android的数据库的数据库,还有一些问题.所以这个问题一直拖了几天才解决.问老师问同学, ...

  3. Cron任务调度CronNET

    Cron任务调度CronNET 阅读目录 1.Cron介绍和工具 2.CronNET介绍和使用 3.cron-expression-descriptor使用 4.资源 如果用知乎,可以关注专栏:.NE ...

  4. dip vs di vs ioc

    https://stackoverflow.com/questions/6766056/dip-vs-di-vs-ioc https://docs.microsoft.com/en-us/aspnet ...

  5. js排序方法

    function swap(ary, x, y) { if (x === y) return let temp = ary[x] ary[x] = ary[y] ary[y] = temp } //生 ...

  6. Linux CentOS7 安装php简要过程以及nginx

    Copy From  https://www.cnblogs.com/freeweb/p/5425554.html 修改了下: 1. 下载php源码: wget  http://cn2.php.net ...

  7. .NET中的许可证机制--License

    .NET中的许可证机制主要类:System.ComponentModel.License(为所有许可证提供 abstract 基类.向组件的特定实例授予许可证)     System.Componen ...

  8. 转《canvas实现滤镜效果》

    <code class="language-html"><html> <head> <style type="text/css& ...

  9. 软件工程_8th weeks

    第八周PSP 个人时间管理 由于本周主要在做论文实验,除了学习时间外有一些零散的时间也在思考代码的书写以及论文实验的流程,但是这些零散的时间并没有在总的表记录,所以想问一下老师,像这种平时零散思考的时 ...

  10. error eslint@5.12.0: The engine "node" is incompatible with this module.

    初始化 react项目时报错: error eslint@5.12.0: The engine "node" is incompatible with this module. E ...