本文总结自一篇综述：

Computational approaches for interpreting scRNA-seq data

单细胞分析分为两个层次：

  • cell level
  • gene level

Tools for the visualization and clustering of cells.


Tools for the ordering of cells & bifurcation/branch identification


Tools for gene-level analysis

scRNA-seq单细胞测序数据分析工具汇总的更多相关文章

  1. 基于单细胞测序数据构建细胞状态转换轨迹(cell trajectory)方法总结

    细胞状态转换轨迹构建示意图(Trapnell et al. Nature Biotechnology, 2014) 在各种生物系统中,细胞都会展现出一系列的不同状态(如基因表达的动态变化等),这些状态 ...

  2. 单细胞测序技术(single cell sequencing)

    单细胞测序技术(single cell sequencing) 2018-03-02 11:02   来源: 一呼百诺  点击次数:6587关键词:   前言 单细胞生物学最近几年是非常热门的研究方向 ...

  3. 微生物组学数据分析工具综述 | 16S+宏基因组＋宏病毒组＋宏转录组--转载

    转载:https://mp.weixin.qq.com/s/xsL9GuLs7b3nRF8VeRtinQ 建立在高通量测序基础上的微生物群落研究,当前主要有三大类:基于16S/18S/ITS等扩增子做 ...

  4. 这个数据分析工具秒杀Excel，可视化分析神器！

    ​入门Excel容易,想要精通就很难了,大部分人通过学习能掌握60%的基础操作,但是一些复杂数据可视化分析就需要用到各种技巧,操作理解难度加深 Excel作为一直是使用最广泛的数据表格工具,在数据量日 ...

  5. Excel入门简单，想要进阶实属不易？推荐这个数据分析工具

    大数据时代,数据分析在我们的日常生活和工作中应用越来越广泛,不管是公司的行政.人事.销售.运营还是专业的数据分析师,都经常需要通过数据来发现业务问题,因此数据分析正逐渐成为职场通用能力. 说到数据分析 ...

  6. [转载] 一共81个，开源大数据处理工具汇总（下），包括日志收集系统/集群管理/RPC等

    原文: http://www.36dsj.com/archives/25042 接上一部分:一共81个,开源大数据处理工具汇总(上),第二部分主要收集整理的内容主要有日志收集系统.消息系统.分布式服务 ...

  7. 从零开始学数据分析，什么程度可以找到工作？（ 内附20G、5000分钟数据分析工具教程大合集 ）

    从零开始学数据分析,什么程度可以找到工作?( 内附20G.5000分钟数据分析工具教程大合集 )   我现在在Coursera上面学data science 中的R programming,过去很少接 ...

  8. App运营者必须知道的30款数据分析工具

    如今的移动应用早已不再是某种结构单一.功能简单的工具了.当我们的移动应用变得越来越庞杂,我们便会需要借用分析工具,来跟踪和分析App内的每一个部分.幸运的是,目前市面上有许多数据分析工具可供App开发 ...

  9. 备忘--简单比较SPSS、RapidMiner、KNIME以及Kettle四款数据分析工具

    SPSS.RapidMiner.KNIME以及Kettle四款工具都可以用来进行数据分析,只是彼此有各自的侧重点和有劣势.它们都可以逐步的定义数据分析过程,也同样都可以对数据进行ETL处理.笔者从自己 ...

随机推荐

  1. Detour的简单使用

    Detours的安装:下载部分:1.直接在百度搜"detour",进对应的网站下载.2.或以下链接https://www.microsoft.com/en-us/research/ ...

  2. eclipse启动 报错，错误信息为 return exit code=13

    打不开的报错如下图: 解决方法:手工配置Eclipse使用的JDK,在Eclipse的安装目录中找到eclipse.ini文件,增加正确的JDK安装目录,如图 在plugins/ 下一行,增加 -vm ...

  3. java android 环境变量配置备忘录

    java android 环境变量配置备忘录,全新重装系统要用到,备忘下来; JAVA_HOME D:\Java\jdk1.6.0_07 CLASSPATH  .;%JAVA_HOME%\lib\dt ...

  4. （四）github之Git的初始设置

    设置姓名与邮箱地址 这里的姓名和邮箱地址会用在git的提交日志之中,在github上公开git仓库时会随着提交日志一起公开. 有两种方式, 第一种,在git bash下设置 第二种, 通过直接编辑.g ...

  5. Python3: Windows系统上同时安装Python2和Python3

    Python3: Windows系统上同时安装Python2和Python3 为什么要同时安装Python2和Python3环境呢? 因为一些库只支持Python2或者Python3; 在同一台电脑上 ...

  6. Linux 系统版本信息

    1.# uname -a   (Linux查看版本当前操作系统内核信息) 2.# cat /proc/version (Linux查看当前操作系统版本信息) 3.# cat /etc/issue  或 ...

  7. Linux 中的 grep 命令

    一,grep命令有什么用 个人觉得grep命令就是一个对文本或输出进行匹配并控制输出的一个工具,看一下下面的参数,部分翻译了,有不对的地方,还请指正: grep --help 匹配模式选择: -E,  ...

  8. php 设置模式 单元素模式(单例模式或单件模式)

    单元素模式: 某些应用程序资源是独占的,因为有且只有一个此类型的资源.应用程序每次包含且仅包含一个对象,那么这个对象就是一个单元素.指的是在应用程序的范围内只对指定的类创建一个实例.通常该模式中包含一 ...

  9. linux内核分析 第一周

    计算机是如何工作的 冯·诺依曼理论的要点是: 数字计算机的数制采用二进制:计算机应该按照程序顺序执行. 冯·诺依曼体系结构 根据冯·诺依曼体系结构构成的计算机,必须具有如下功能:把需要的程序和数据送至 ...

  10. HTTP If-Modified-Since引发的浏览器缓存汇总

    在看Spring中HttpServlet的Service方法时,对于GET请求,代码逻辑如下: if (method.equals(METHOD_GET)) { long lastModified = ...