本文总结自一篇综述:

Computational approaches for interpreting scRNA-seq data

单细胞分析分为两个层次:

  • cell level
  • gene level

Tools for the visualization and clustering of cells.


Tools for the ordering of cells & bifurcation/branch identification


Tools for gene-level analysis

scRNA-seq单细胞测序数据分析工具汇总的更多相关文章

  1. 基于单细胞测序数据构建细胞状态转换轨迹(cell trajectory)方法总结

    细胞状态转换轨迹构建示意图(Trapnell et al. Nature Biotechnology, 2014) 在各种生物系统中,细胞都会展现出一系列的不同状态(如基因表达的动态变化等),这些状态 ...

  2. 单细胞测序技术(single cell sequencing)

    单细胞测序技术(single cell sequencing) 2018-03-02 11:02   来源: 一呼百诺  点击次数:6587关键词:   前言 单细胞生物学最近几年是非常热门的研究方向 ...

  3. 微生物组学数据分析工具综述 | 16S+宏基因组+宏病毒组+宏转录组--转载

    转载:https://mp.weixin.qq.com/s/xsL9GuLs7b3nRF8VeRtinQ 建立在高通量测序基础上的微生物群落研究,当前主要有三大类:基于16S/18S/ITS等扩增子做 ...

  4. 这个数据分析工具秒杀Excel,可视化分析神器!

    ​入门Excel容易,想要精通就很难了,大部分人通过学习能掌握60%的基础操作,但是一些复杂数据可视化分析就需要用到各种技巧,操作理解难度加深 Excel作为一直是使用最广泛的数据表格工具,在数据量日 ...

  5. Excel入门简单,想要进阶实属不易?推荐这个数据分析工具

    大数据时代,数据分析在我们的日常生活和工作中应用越来越广泛,不管是公司的行政.人事.销售.运营还是专业的数据分析师,都经常需要通过数据来发现业务问题,因此数据分析正逐渐成为职场通用能力. 说到数据分析 ...

  6. [转载] 一共81个,开源大数据处理工具汇总(下),包括日志收集系统/集群管理/RPC等

    原文: http://www.36dsj.com/archives/25042 接上一部分:一共81个,开源大数据处理工具汇总(上),第二部分主要收集整理的内容主要有日志收集系统.消息系统.分布式服务 ...

  7. 从零开始学数据分析,什么程度可以找到工作?( 内附20G、5000分钟数据分析工具教程大合集 )

    从零开始学数据分析,什么程度可以找到工作?( 内附20G.5000分钟数据分析工具教程大合集 )   我现在在Coursera上面学data science 中的R programming,过去很少接 ...

  8. App运营者必须知道的30款数据分析工具

    如今的移动应用早已不再是某种结构单一.功能简单的工具了.当我们的移动应用变得越来越庞杂,我们便会需要借用分析工具,来跟踪和分析App内的每一个部分.幸运的是,目前市面上有许多数据分析工具可供App开发 ...

  9. 备忘--简单比较SPSS、RapidMiner、KNIME以及Kettle四款数据分析工具

    SPSS.RapidMiner.KNIME以及Kettle四款工具都可以用来进行数据分析,只是彼此有各自的侧重点和有劣势.它们都可以逐步的定义数据分析过程,也同样都可以对数据进行ETL处理.笔者从自己 ...

随机推荐

  1. Linux基础命令---chmod

    chmod 改变文件或者目录的权限,可以用数字或者字母来标识权限.在数字模式下:0,代表没有权限:1,代表可执行:2,代表可读:4,代表可写:多个权限可以相加.在字符模式下:x,代表执行:r,代表读: ...

  2. centos 安装 jdk8和comcat8

    1.去官网下载Linux版本的jdk8 2.进入ags,把tar.gz的压缩包拷贝到用户下指定目录java,然后解压 mkdir /home/ags/java tar -zxv -f jdk-8u11 ...

  3. MySQL笔记(二)数据库对象的创建和管理

    学校用 sqlserver ,记录数据移植到 mysql 过程中的一些问题(对应数据类型,主键外键等). 索引: 查看数据的物理路径 查看表相关的信息(SHOW CREATE TABLE.DESC) ...

  4. SQL学习之SQL注入学习总结

    所谓SQL注入,就是通过把SQL命令插入到Web表单提交或输入域名或页面请求的查询字符串,最终达到欺骗服务器执行恶意的SQL命令. 测试数据库 我们本文就以如下数据库作为测试数据库,完成我们的注入分析 ...

  5. 20145319 《网络渗透》web基础

    20145319 <网络渗透>web基础 实验要求 掌握网页编程的基本知识 html语法 javascript php 前端,后台,数据库之间如何建立连接 掌握数据库的使用 mysql的启 ...

  6. MFC制作OCX

    1.新建工程 注意选择显示时注册,免得后面又去手动注册 2.工程解释,一般ocx是看类视图而不是解决方案 ①.xxxApp:类似整个工程的入口,有xxxApp.h和xxxApp.cpp,工程的初始化, ...

  7. 设置控件如ImageButton可见与否

    继承view的控件有三种ui属性: 1.setVisibility(View.Gone); 不可见,不占有空间 2.setVisibility(View.VISIBLE); 可见 3.setVisib ...

  8. Python3.5 MySQL 数据库连接

    Python3.5  MySQL 数据库连接 在本文中介绍 Python3 使用PyMySQL连接数据库,并实现简单的增删改查 为什么使用PyMySQL? PyMySQL是在Pyhton3.x版本中用 ...

  9. Cent OS 常用配置命令

    1.ifconfig   #查看网络接口状态 2.ifconfig –a  #查看主机所有接口的情况 3.ifconfig eth0 192.168.1.106 netmask 255.255.255 ...

  10. 同一主机配置:vsftpd+pam+mysql

    两种情况: 1.vsftpd和MySQL不在同一台主机上 vsftpd服务器和MySQL服务器不在同一台主机上时,vsftpd服务器需要安装pam_mysql. 在指定用户认证时,vsftpd需要链接 ...