环状DNA序列
大意:
一个DNA序列是环状的,这意味着有N个碱基的序列有N种表示方法(假设无重复)。而这N个序列有一种最小的表示,这个最小表示的意思是这个序列的字典序最小(字典序的意思是在字典中的大小 比如ABC<ACB,B<BCD,EF<G)
方法:在一个序列中从任意两个位置开始,产生的序列的大小是可以比较的。然后利用这种比较方法找出最小值
#include <iostream>
using namespace std; #define MAX 105 int lessthan(char s[],int p,int q) //一个序列从p开始和从q开始的大小
{
long len = strlen(s);
for(int i = ;i<len;i++)
{
if(s[(p+i)%len] != s[(q+i)%len])
return s[(p+i)%len]<s[(q+i)%len]; //比较大小
}
return ;
} int main()
{
int t;
cin>>t;
while(t--)
{
char s[MAX];
cin>>s;
long n = strlen (s) ;
int flag = ;
for(int i = ;i < n;i++) //相当于找出数组中最小的元素
{
if(lessthan(s,i,flag))
flag = i;
} for(int i = ;i<n;i++)
cout<<s[(flag+i)%n];
cout<<endl;
}
}
环状DNA序列的更多相关文章
- [LeetCode] Repeated DNA Sequences 求重复的DNA序列
All DNA is composed of a series of nucleotides abbreviated as A, C, G, and T, for example: "ACG ...
- 利用Python【Orange】结合DNA序列进行人种预测
http://blog.csdn.net/jj12345jj198999/article/details/8951120 coursera上 web intelligence and big data ...
- 华为OJ平台——DNA序列
题目描述: 一个DNA序列由A/C/G/T四个字母的排列组合组成.G和C的比例(定义为GC-Ratio)是序列中G和C两个字母的总的出现次数除以总的字母数目(也就是序列长度).在基因工程中,这个比例非 ...
- DNA序列对齐问题
问题描述: 该问题在算法导论中引申自求解两个DNA序列相似度的问题. 可以从很多角度定义两个DNA序列的相似度,其中有一种定义方法就是通过序列对齐的方式来定义其相似度. 给定两个DNA序列A和B,对齐 ...
- 简单DNA序列组装(非循环子图)
生物信息学原理作业第四弹:DNA序列组装(非循环子图) 原理:生物信息学(孙啸) 大致思想: 1. 这个算法理解细节理解比较困难,建议看孙啸的生物信息学相关章节. 2. 算法要求所有序列覆盖整个目标D ...
- DNA序列组装(贪婪算法)
生物信息学原理作业第四弹:DNA序列组装(贪婪算法) 原理:生物信息学(孙啸) 大致思想: 1. 找到权值最大的边: 2. 除去以最大权值边的起始顶点为起始顶点的边: 3. 除去以最大权值边为终点为终 ...
- DNA序列局部比对(Smith–Waterman algorithm)
生物信息原理作业第三弹:DNA序列局部比对,利用Smith–Waterman算法,python3.6代码实现. 实例以及原理均来自https://en.wikipedia.org/wiki/Smith ...
- 利用Needleman–Wunsch算法进行DNA序列全局比对
生物信息学原理作业第二弹:利用Needleman–Wunsch算法进行DNA序列全局比对. 具体原理:https://en.wikipedia.org/wiki/Needleman%E2%80%93W ...
- HDU 1560 DNA sequence(DNA序列)
HDU 1560 DNA sequence(DNA序列) Time Limit: 15000/5000 MS (Java/Others) Memory Limit: 32768/32768 K ...
随机推荐
- 用 localhost 访问正常,替换成 IP ,部分 CSS 或 JS 就失效了
这应该是浏览器的兼容性问题. 经测试,只要不是360浏览器的兼容模式,将 localhost 替换成 IP 无影响. 来自为知笔记(Wiz)
- cuda(1) 最大并发量
Created on 2013-8-5URL : http://blog.sina.com.cn/s/blog_a502f1a30101mi6t.html@author: zhxfl转载请说明出处 c ...
- HW4.24
public class Solution { public static void main(String[] args) { double sum = 0; for(int i = 1; i &l ...
- itunes备份文件解析入门
itunes提供给设备备份的功能,不知道怎么备份的话可以戳一下这个看一下:http://jingyan.baidu.com/article/92255446ea8f46851648f4a4.html ...
- Verilog HDL模块的结构
一个设计是由一个个模块(module)构成的.一个模块的设计如下: 1.模块内容是嵌在module 和endmodule两个语句之间.每个模块实现特定的功能,模块可进行层次的嵌套,因此可以将大型的数字 ...
- 文件上传工具swfupload[转]
转至:http://zhangqgc.iteye.com/blog/906419 文件上传工具swfupload 示例: 1.JavaScript设置SWFUpload部分(与官方例子类似): var ...
- javascript如何监听页面刷新和页面关闭事件
本文转之http://www.qqtimezone.top 在我们的日常生活中,时常遇到这么一种情况,当我们在点击一个链接.关闭页面.表单提交时等情况,会提示我们是否确认该操作等信息. 这里就给大家讲 ...
- jquery ajax 使用layer的超时提示
<!DOCTYPE html> <html> <head> <title>我是标题</title> <meta name=" ...
- struts2标签 遍历map集合
首先我们来构造几个map集合. 假设如下代码 都是在ssh配置环境下搭建好,(至少struts2开发环境搭建好) (1).java 代码 下面的student对象包含的字段为 ...
- 理解标签重置reset
/*样式表文件来自 懒人css http://lrcss.lrjz100.com *//*---------重置---------*/html{font-size: 100%;-webkit-text ...