seqtk 一款快速处理fasta/fastq 文件的小程序
seqtk 的 GitHub 官网
https://github.com/lh3/seqtk
安装
git clone https://github.com/lh3/seqtk.git
cd seqtk
make The only library dependency is zlib.

seqtk 一款快速处理fasta/fastq 文件的小程序的更多相关文章
- 利用kseq.h parse fasta/fastq 文件
在分析中经常需要统计fasta/fastq文件的序列数和碱基数, 但是没有找到一些专门做这件事的小工具,可能是这个功能太简单了: 之前用自己写的perl的脚本统计这些信息, 当fastq文件非常大时, ...
- JWebFileTrans(JDownload): 一款可以从网络上下载文件的小程序(二)
一 前言 本文是上一篇博客JWebFileTrans:一款可以从网络上下载文件的小程序(一)的续集.此篇博客主要在上一篇的基础上加入了断点续传的功能,用户在下载中途停止下载后,下次可以读取断点文件, ...
- JWebFileTrans(JDownload): 一款可以从网络上下载文件的小程序(三),多线程断点下载
一 前言 本篇博客是<JWebFileTrans(JDownload):一款可以从网络上下载文件的小程序>系列博客的第三篇,本篇博客的内容主要是在前两篇的基础上增加多线程的功能.简言之,本 ...
- JDownload: 一款可以从网络上下载文件的小程序第四篇(整体架构描述)
一 前言 时间过得真快,距离本系列博客第一篇的发布已经过去9个月了,本文是该系列的第四篇博客,将对JDownload做一个整体的描述与介绍.恩,先让笔者把记忆拉回到2017年年初,那会笔者在看Unix ...
- fastx tookit 操作fasta/fastq 文件 (1)
准备测试文件 test.fq, 包含4条fastq 文件,碱基编码格式为phred64; @FC12044_91407_8_200_406_24 NTTAGCTCCCACCTTAAGATGTTTA + ...
- 将fasta fastq文件线性化处理
将fasta文件线性化处理 awk '/^>/ {printf("%s%s\t",(N>0?"\n":""),$0);N++;n ...
- JWebFileTrans: 一款可以从网络上下载文件的小程序(一)
一 摘要 JWebFileTrans是一款基于socket的网络文件传输小程序,目前支持从HTTP站点下载文件,后续会增加ftp站点下载.断点续传.多线程下载等功能.其代码已开源到github上面,下 ...
- 两天快速开发一个自己的微信小程序
p.p1 { margin: 0.0px 0.0px 0.0px 0.0px; font: 12.0px "Songti SC" } p.p2 { margin: 0.0px 0. ...
- 快速开发一个自己的微信小程序
一.写在前面 1.为什么要学小程序开发? 对于前端开发而言,微信小程序因为其简单快速.开发成本低.用户流量巨大等特点,也就成了前端开发工程师必会的一个技能. 2.先看看小程序效果 (1)欢迎页 (2) ...
随机推荐
- Restart container within pod
https://stackoverflow.com/questions/46123457/restart-container-within-pod 命令 kubectl exec -it [POD_N ...
- RocketMQ原理及源码解析
RocketMQ原理深入: 一.定义: RocketMQ是一款分布式.队列模型的消息中间件,有以下部分组成: 1.NameServer: 一个几乎无状态的节点,可集群部署,节点之间无任何信息同步 2. ...
- NIO与网络编程系统化学习
1.背景 数据在网络中传输,必然回遇到读写问题.... 2.比较NIO与IO 3.案例演示 3.1.缓冲区演示 package com.wfd360.nio; import org.junit.Tes ...
- jsp 获取后端配置文件.properties的某个配置内容
如后端有个叫做config.properties的配置文件: sys.img=st_sp jsp中引用的方式是: <%@ page language="java" impor ...
- MySQL倒序索引测试2
测试环境 MySQL Community Server 8.0.17 准备测试数据 DROP TABLE TB001; CREATE TABLE TB001(ID INT PRIMARY KEY AU ...
- 【Spring Cloud】Spring Cloud之Spring Cloud Sleuth,分布式服务跟踪(1)
一.Spring Cloud Sleuth组件的作用 为微服务架构增加分布式服务跟踪的能力,对于每个请求,进行全链路调用的跟踪,可以帮助我们快速发现错误根源以及监控分析每条请求链路上的性能瓶颈等. 二 ...
- 卓越Code团队SCRUM呕心沥血实践总结
卓越Code团队SCRUM呕心沥血实践总结 序言 所属课程 https://edu.cnblogs.com/campus/xnsy/2019autumnsystemanalysisanddesign ...
- ‘cmake' 不是内部或外部命令 也不是可运行的程序 或批处理文
在 Win7下的命令行模式下,输入cmake相关命令,出现如下错误: ’cmake' 不是内部或外部命令 也不是可运行的程序 或批处理文件 解决方法: 在环境变量中添加cmake的文件路径. 计算机( ...
- java.lang.IllegalArgumentException: An invalid character [34] was present in the Cookie value
java.lang.IllegalArgumentException: An invalid character [34] was present in the Cookie value at org ...
- 第3章 常用linux命令 3.5 文件压缩命令
实验六 文件及目录的压缩解压缩相关命令的使用 [实验目的] 1.掌握linux压缩文件实质 2.掌握linux中压缩及解压缩指令的用法 [实验环境] 1. 标准配置PC一台 2. linux操作系统: ...