1) 若直接以20种氨基酸统计k_word: (以ZD98数据集为例)

k Dimension
2 400
3 6490
4 22265

　　维数太大不适用构造特征向量

考虑氨基酸约化后特征提取

约化方案：

Classification Abbreviation Abbreviation
Strongly hydrophilic or polar L R, D, E, N, Q, K, H
Strongly hydrophobic B L, I, V, A, M, F
Weakly hydrophilic or weakly hydrophobic W S, T, Y, W
Proline P P
Glycine G G
Cysteine C C

约化后的特征

k dimension
2 36
3 211
4 1071
5 3732
6 8698
7 14620

特征提取k_word的更多相关文章

  1. 医学CT图像特征提取算法(matlab实现)

    本科毕设做的是医学CT图像特征提取方法研究,主要是肺部CT图像的特征提取.由于医学图像基本为灰度图像,因此我将特征主要分为三类:纹理特征,形态特征以及代数特征,每种特征都有对应的算法进行特征提取. 如 ...

  2. 图像特征提取之LBP特征

    LBP(Local Binary Pattern,局部二值模式)是一种用来描述图像局部纹理特征的算子:它具有旋转不变性和灰度不变性等显著的优点.它是首先由T. Ojala, M.Pietik?inen ...

  3. Surf特征提取分析

    Surf特征提取分析 Surf Hessian SIFT 读"H.Bay, T. Tuytelaars, L. V. Gool, SURF:Speed Up Robust Features[ ...

  4. SIFT特征提取分析

    SIFT特征提取分析 sift 关键点,关键点检测 读'D. G. Lowe. Distinctive Image Features from Scale-Invariant Keypoints[J] ...

  5. SIFT特征提取分析（转载）

    转载自: http://blog.csdn.net/abcjennifer/article/details/7639681 SIFT(Scale-invariant feature transform ...

  6. Python_sklearn机器学习库学习笔记（一）_Feature Extraction and Preprocessing(特征提取与预处理）

    # Extracting features from categorical variables #Extracting features from categorical variables 独热编 ...

  7. SIFT 特征提取算法总结

    原文链接:http://www.cnblogs.com/cfantaisie/archive/2011/06/14/2080917.html   主要步骤 1).尺度空间的生成: 2).检测尺度空间极 ...

  8. [转]SIFT特征提取分析

    SIFT(Scale-invariant feature transform)是一种检测局部特征的算法,该算法通过求一幅图中的特征点(interest points,or corner points) ...

  9. 图像特征提取：Sobel边缘检测

    前言 点和线是做图像分析时两个最重要的特征,而线条往往反映了物体的轮廓,对图像中边缘线的检测是图像分割与特征提取的基础.文章主要讨论两个实际工程中常用的边缘检测算法:Sobel边缘检测和Canny边缘 ...

随机推荐

  1. 软件调试——CPU异常列表

    CPU异常主要分为三类:错误类异常,陷阱类异常和终止类异常 1 错误类异常 Fault CPU遇到该类异常后,会先将CS和EIP(当前发生错误的指令,而不是下一条指令)压栈,然后跳到异常处理函数中,执 ...

  2. 【Linux】学习说明

    概述Linux是一套免费使用和自由传播的类Unix操作系统,是一个基于POSIX和UNIX的多用户.多任务.支持多线程和多CPU的操作系统.多用户是指操作系统可以创建多个用户,用户可以并行的使用操作系 ...

  3. Android 6.0权限适配

    targetSdkVersion 23以上,必须适配新的权限模式 安卓6.0及之后,权限分为三类  1.不涉及隐私的正常权限,如innernet2.危险权限 3.特殊权限 system_alert_w ...

  4. Msql:Incorrect double value: ''for column 'id' at row 1解决

    Incorrect double value: ''for column 'id' at row 1解决   最近在写个查询 插入语句的时候 我是这么写的 1 insert into test val ...

  5. 在线c++编译器（gcc）

    这几年c++标准委员会活跃起来,C++11.14标准相续推出.对于想尝鲜又怕麻烦(visual studio 更新慢,对标准的支持力度也不够.对于使用gcc的,替换系统的gcc版本或者安装个mingw ...

  6. js面向对象之创建对象

    工厂模式 function createPerson(name,age,job){ var o = new Object(); o.name = name; o.age = age; o.job = ...

  7. post请求接口

    /// <summary> /// post 调用接口 /// </summary> /// <param name="xmlRequest"> ...

  8. golang中string以及slice之间的一些问题

    好记性不如烂笔头o_O slice切片不会开辟新的空间 a := []int{0,1,2,3} b := make([]int, 8) b = a[:] b[2] = 9 fmt.Println(a) ...

  9. HTML DOM Event对象

    我们通常把HTML DOM Event对象叫做Event事件 事件驱动模型 事件源:(触发事件的元素)事件源对象是指event对象 其封装了与事件相关的详细信息. 当事件发生时,只能在事件函数内部访问 ...

  10. ngx.lua中遇到的小问题2

    用lua+drizzle在数据库中插入数据失败(不能访问数据库) 后面发现原来是nginx配置文件中的drizzle模块部分最后多了一行  content_by_lua 'ngx.say(" ...