都可以，但各有千秋。
放在head中：统一管理，方便维护；但浏览器会首先加载js文件，如果js文件过大，会造成页面在加载js的时候“无反应”时间过长，影响用户体验。
放在body中（或放在body后）：浏览器会首先加载js文件之前的元素，并显示到界面上，这样给用户的体验较好，但是不方便维护。
建议：页面初始化需要用到的JS或者比较小的JS文件，放在head中。比较特殊的用于页面指定位置的JS文件放在body中对应位置。较大的，影响用户体验的js文件放在body后。

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