bioconduction 主页

http://www.bioconductor.org/packages/release/data/annotation/html/org.Hs.eg.db.html

安装

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager") BiocManager::install("org.Hs.eg.db")

有时可能因为镜像或者网络的原因导致安装失败

我在 RStudio 使用 清华的镜像

在线文档

http://www.bioconductor.org/packages/release/data/annotation/manuals/org.Hs.eg.db/man/org.Hs.eg.db.pdf

使用

library(org.Hs.eg.db)

org.Hs.eg.db的更多相关文章

  1. org.Hs.eg.db包简介(转换NCBI、ensemble等数据库中基因ID,symbol等之间的转换)

    1)安装载入 ------------------------------------------- if("org.Hs.eg.db" %in% rownames(install ...

  2. R 语言 select函数在org.Hs.eg.db上的运用

    首先org.Hs.eg.db是一个关于人类的 一,在R中导入包library(org.Hs.eg.db) http://www.bioconductor.org/packages/release/da ...

  3. 使用clusterprofile做聚类分析

    library(clusterProfiler ) #cat test.txt gene_symbol EXOSC10ARHGEF10LVWA5B1SRRM1PTAFRCSMD2SH3GLB1GBP6 ...

  4. R: 修改镜像、bioconductor安装及go基因富集分析

    1.安装bioconductor及go分析涉及的相关包 source("http://bioconductor.org/biocLite.R") options(BioC_mirr ...

  5. GSEA - Gene set enrichment analysis 基因集富集 | ORA - Over-Representation Analysis 分析原理与应用

    RNA-seq是利器,大部分做实验的老板手下都有大量转录组数据,所以RNA-seq的分析需求应该是很大的(大部分的生信从业人员应该都差不多要沾边吧). 普通的转录组套路并不多,差异表达基因.富集分析. ...

  6. org注释包

    1.注释包 物种 OrgDB 按蚊(Anopheles) org.Ag.eg.db 拟南芥(Arabidopsis) org.At.tair.db 牛(Brovine) org.Bt.eg.db 蠕虫 ...

  7. java基础学习总结——线程(一)

    一.线程的基本概念

  8. 探索gff/gtf格式

    参考: GFF格式说明 Generic Feature Format Version 3 (GFF3) 先下载一个 gtf 文件浏览一下 1 havana gene 11869 14409 . + . ...

  9. 探索Bioconductor数据包

    参考: R的bioconductor包TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene详解 Bioconductor的数据包library(org.Hs.eg.db)简介

随机推荐

  1. spring的15个经典面试题

    总结Spring框架的15个经典面试题. 什么是Spring框架? Spring是一种轻量级框架,旨在提高开发人员的开发效率以及系统的可维护性. 我们一般说的Spring框架就是Spring Fram ...

  2. jsplumb 初识

    Jsplumb官网:https://jsplumbtoolkit.com GitHub:https://github.com/sporritt/jsplumb/    有很多官网示例 基础教程:htt ...

  3. Peewee之playhouse中的数据库连接池

    参见 http://note.youdao.com/noteshare?id=104255d91b5a00d716a713ae36e911fd 目前在学习Python库的源码,这是第二篇,比较简单的功 ...

  4. 2019-11-29-VisualStudio-好用插件集合

    原文:2019-11-29-VisualStudio-好用插件集合 title author date CreateTime categories VisualStudio 好用插件集合 lindex ...

  5. 虚拟机Ubuntu18.04 root下 连接 windows 中 winScp

    先查看自己虚拟机中是否有 ssh服务 如果没有的话先安装 apt-get install openssh-server 安装完之后 先手动开启一下服务 /etc/init.d/ssh restart ...

  6. 基于串口的SD_card系统

    概述 基于串口的SD_card系统1, 扫描文件:2, 新建文件:3, 删除文件:4, 写入文件:5, 读取文件. 整个文件系统的串口通信方式都是ASC通信方式. 文件系统分为简单实用方式和专业使用方 ...

  7. 单词大学CET六四级英语

    2012年大学英语六级词汇 baseball n.棒球:棒球运动 basement n.地下室:地窖:底层 basin n.内海:盆地,流域 battery n.炮兵连:兵器群 battle vi.战 ...

  8. ASP.NET Core+MongoDB(一)

    项目类库:.Net Standar 2.0web:ASP.NET CORE 2.2 版本 先上图,看我们的解决方案结构: 分别对上面的工程进行说明:1.KYSharpCore:为公共的基础类,最底层 ...

  9. css层叠规则(层叠样式表)

    CSS层叠规则: 1.找出所有相关的规则,这些规则都包含与一个给定元素匹配的选择器. 2.按权重(!important)和来源对应用到给定元素的所有声明进行排序. 3.按特殊性对应用到给定元素的所有声 ...

  10. maven 镜像仓库 setting.xml修改 & 手动导入的包如何加到maven里面

    如果不知道maven安装路径IDEA中打File->Settings   再点Build->Maven右边看maven安装路径,打开这个路径,再打开conf/settings.xml文件 ...