bioconduction 主页

http://www.bioconductor.org/packages/release/data/annotation/html/org.Hs.eg.db.html

安装

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager") BiocManager::install("org.Hs.eg.db")

有时可能因为镜像或者网络的原因导致安装失败

我在 RStudio 使用 清华的镜像

在线文档

http://www.bioconductor.org/packages/release/data/annotation/manuals/org.Hs.eg.db/man/org.Hs.eg.db.pdf

使用

library(org.Hs.eg.db)

org.Hs.eg.db的更多相关文章

  1. org.Hs.eg.db包简介(转换NCBI、ensemble等数据库中基因ID,symbol等之间的转换)

    1)安装载入 ------------------------------------------- if("org.Hs.eg.db" %in% rownames(install ...

  2. R 语言 select函数在org.Hs.eg.db上的运用

    首先org.Hs.eg.db是一个关于人类的 一,在R中导入包library(org.Hs.eg.db) http://www.bioconductor.org/packages/release/da ...

  3. 使用clusterprofile做聚类分析

    library(clusterProfiler ) #cat test.txt gene_symbol EXOSC10ARHGEF10LVWA5B1SRRM1PTAFRCSMD2SH3GLB1GBP6 ...

  4. R: 修改镜像、bioconductor安装及go基因富集分析

    1.安装bioconductor及go分析涉及的相关包 source("http://bioconductor.org/biocLite.R") options(BioC_mirr ...

  5. GSEA - Gene set enrichment analysis 基因集富集 | ORA - Over-Representation Analysis 分析原理与应用

    RNA-seq是利器,大部分做实验的老板手下都有大量转录组数据,所以RNA-seq的分析需求应该是很大的(大部分的生信从业人员应该都差不多要沾边吧). 普通的转录组套路并不多,差异表达基因.富集分析. ...

  6. org注释包

    1.注释包 物种 OrgDB 按蚊(Anopheles) org.Ag.eg.db 拟南芥(Arabidopsis) org.At.tair.db 牛(Brovine) org.Bt.eg.db 蠕虫 ...

  7. java基础学习总结——线程(一)

    一.线程的基本概念

  8. 探索gff/gtf格式

    参考: GFF格式说明 Generic Feature Format Version 3 (GFF3) 先下载一个 gtf 文件浏览一下 1 havana gene 11869 14409 . + . ...

  9. 探索Bioconductor数据包

    参考: R的bioconductor包TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene详解 Bioconductor的数据包library(org.Hs.eg.db)简介

随机推荐

  1. VUE方法

    1.$event 变量 $event 变量用于访问原生DOM事件. <!DOCTYPE html> <html lang="zh"> <head> ...

  2. Hash函数浅谈

    Hash函数是指把一个大范围映射到一个小范围.把大范围映射到一个小范围的目的往往是为了节省空间,使得数据容易保存. 除此以外,Hash函数往往应用于查找上.所以,在考虑使用Hash函数之前,需要明白它 ...

  3. 《 .NET并发编程实战》阅读指南 - 第3章

    先发表生成URL以印在书里面.等书籍正式出版销售后会公开内容.

  4. java设计模式结构型模式

    结构型模式: – 核心作用:是从程序的结构上实现松耦合,从而可以扩大整体的类结 构,用来解决更大的问题 分类: • 适配器模式.代理模式.桥接模式. 装饰模式.组合模式.外观模式.享元模式 结构型模式 ...

  5. Haskell路线

    @ 知乎 @ <I wish i have learned haskell> ———— 包括: Ranks, forall, Monad/CPS,  monadic parser, FFI ...

  6. Mac 下安装 jdk

    1.安装jdk 我们是需要java环境的- 到oracle官网下载se: Java SE Development Kit 8 Downloads https://www.oracle.com/tech ...

  7. zsh禁用自动更新

    编辑.oh-my-zsh/oh-my-zsh.sh文件 set DISABLE_AUTO_UPDATE = false # Check for updates on initial load... i ...

  8. js内存空间

    堆数据结构 堆数据结构是一种树状结构.它的存取数据的方式与书架和书非常相似.我们只需要知道书的名字就可以直接取出书了,并不需要把上面的书取出来.JSON格式的数据中,我们存储的key-value可以是 ...

  9. swagger页面详细讲解

  10. win中Oracle简易客户端和plsql的配置

    连接数据库有2种方式:在本机安装Oracle数据库或者是安装一个oracle简易客户端 当然,简易客户端跟oracle数据库比较少了一些功能 连接方式: 1)简易连接 sqlplus scott/ti ...