bioconduction 主页

http://www.bioconductor.org/packages/release/data/annotation/html/org.Hs.eg.db.html

安装

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager") BiocManager::install("org.Hs.eg.db")

有时可能因为镜像或者网络的原因导致安装失败

我在 RStudio 使用 清华的镜像

在线文档

http://www.bioconductor.org/packages/release/data/annotation/manuals/org.Hs.eg.db/man/org.Hs.eg.db.pdf

使用

library(org.Hs.eg.db)

org.Hs.eg.db的更多相关文章

  1. org.Hs.eg.db包简介(转换NCBI、ensemble等数据库中基因ID,symbol等之间的转换)

    1)安装载入 ------------------------------------------- if("org.Hs.eg.db" %in% rownames(install ...

  2. R 语言 select函数在org.Hs.eg.db上的运用

    首先org.Hs.eg.db是一个关于人类的 一,在R中导入包library(org.Hs.eg.db) http://www.bioconductor.org/packages/release/da ...

  3. 使用clusterprofile做聚类分析

    library(clusterProfiler ) #cat test.txt gene_symbol EXOSC10ARHGEF10LVWA5B1SRRM1PTAFRCSMD2SH3GLB1GBP6 ...

  4. R: 修改镜像、bioconductor安装及go基因富集分析

    1.安装bioconductor及go分析涉及的相关包 source("http://bioconductor.org/biocLite.R") options(BioC_mirr ...

  5. GSEA - Gene set enrichment analysis 基因集富集 | ORA - Over-Representation Analysis 分析原理与应用

    RNA-seq是利器,大部分做实验的老板手下都有大量转录组数据,所以RNA-seq的分析需求应该是很大的(大部分的生信从业人员应该都差不多要沾边吧). 普通的转录组套路并不多,差异表达基因.富集分析. ...

  6. org注释包

    1.注释包 物种 OrgDB 按蚊(Anopheles) org.Ag.eg.db 拟南芥(Arabidopsis) org.At.tair.db 牛(Brovine) org.Bt.eg.db 蠕虫 ...

  7. java基础学习总结——线程(一)

    一.线程的基本概念

  8. 探索gff/gtf格式

    参考: GFF格式说明 Generic Feature Format Version 3 (GFF3) 先下载一个 gtf 文件浏览一下 1 havana gene 11869 14409 . + . ...

  9. 探索Bioconductor数据包

    参考: R的bioconductor包TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene详解 Bioconductor的数据包library(org.Hs.eg.db)简介

随机推荐

  1. 管道的原子性 linux写操作原子性

    从本质上说,管道也是一种文件,但他又和一般的文件有所不同,管道可以克服使用文件进行通信的两个问题 限制管道的大小.实际上,管道是一个固定大小的缓冲区.在Linux中该换冲区的大小为一页,4k 使得他的 ...

  2. log4j2记录日志到数据库(完美支持mysql使用DruidDataSource)

    引用 log4j-core-2.12.1.jar log4j-web-2.12.1.jar 1:配置数据源 2:调用类 3:写入

  3. 【08】Jenkins:关于发布

    写在前面的话 Jenkins 对于我们用户而言,可能中间会有不同的需求,比如自动构建,接口测试,代码质量检测.但其实我们的最终目的还是打包上线.当然,各个公司的项目开发语言会不一样,但是总体而言发布方 ...

  4. 初识Markdown

    目录 一.基础语法 二.语法规则 1.标题 2.列表 3.文字格式 4.链接 5.图片 6.引用 7.水平分隔线 8.代码块 9.表格 10.文档目录 11.转义定义 写在前面 Markdown(简称 ...

  5. 通用高效字符串匹配--Sunday算法

    字符串匹配(查找)算法是一类重要的字符串算法(String Algorithm).有两个字符串, 长度为m的haystack(查找串)和长度为n的needle(模式串), 它们构造自同一个有限的字母表 ...

  6. 阿里云 centos 无法执行moodle cron

    在阿里云服务器安装moodle时,在执行cron计划任务时,报错sendmail: fatal: parameter inet_interfaces: no local interface found ...

  7. Oracle 11.2.0.4单实例打补丁

    Oracle 11.2.0.4单实例打PSU,OJVM PSU补丁快速参考 写在前面: ·         1.Oracel打每个补丁的操作有时存在差异,所以不管多熟悉,都应该在打任何补丁之前阅读新补 ...

  8. 简要分析一下java中线程的生命周期

    面试题:您了解线程吗?简单叙述一下线程的生命周期? 答:之前学过一些有关于线程方面的知识,并且在编写代码的过程中还是要经常考虑线程,所以,我对线程还是了解一点的. 首先,创建一个线程,线程进入初始状态 ...

  9. 【前端_React】npm常用命令

    安装模块(包): //全局安装 $ npm install 模块名 -g //本地安装 $ npm install 模块名 //一次性安装多个 $ npm install 模块1 模块2 模块n -- ...

  10. 《linux就该这么学》课堂笔记14 Apache、SELinux、虚拟主机

    1.目前能够提供Web网络服务的程序有IIS(Windows系统中默认的Web服务程序,是一款图形化的网站管理工具).Nginx和Apache(RHEL 7系统中默认的Web服务程序)等. Apach ...