Seurat | 单细胞分析工具
Seurat是一个老牌的单细胞分析工具了(satija的力作),我之前测试过,但是没怎么用。
最近发现这个工具又publish在了NBT上,所以很有必要看一下这篇文章。
Integrating single-cell transcriptomic data across different conditions, technologies, and species
主要目的:identifying subpopulations of cells that are present across multiple data sets
主要就是为了多样品之间的比较,甚至不同物种间的对比。
Overview of Seurat alignment workflow
We aimed to develop a diverse integration strategy that could compare scRNA-seq data sets across different conditions, technologies, or species.
Identifying shared correlation structures across data sets
Machine-learning techniques for ‘data fusion’ aim to integrate information from multiple experiments into a consistent representation.
待续~
Seurat | 单细胞分析工具的更多相关文章
- Android代码分析工具lint学习
1 lint简介 1.1 概述 lint是随Android SDK自带的一个静态代码分析工具.它用来对Android工程的源文件进行检查,找出在正确性.安全.性能.可使用性.可访问性及国际化等方面可能 ...
- 【转】gc日志分析工具
性能测试排查定位问题,分析调优过程中,会遇到要分析gc日志,人肉分析gc日志有时比较困难,相关图形化或命令行工具可以有效地帮助辅助分析. Gc日志参数 通过在tomcat启动脚本中添加相关参数生成gc ...
- Java 性能分析工具 , 第 3 部分: Java Mission Control
引言 本文为 Java 性能分析工具系列文章第三篇,这里将介绍如何使用 Java 任务控制器 Java Mission Control 深入分析 Java 应用程序的性能,为程序开发人员在使用 Jav ...
- Java 性能分析工具 , 第 2 部分:Java 内置监控工具
引言 本文为 Java 性能分析工具系列文章第二篇,第一篇:操作系统工具.在本文中将介绍如何使用 Java 内置监控工具更加深入的了解 Java 应用程序和 JVM 本身.在 JDK 中有许多内置的工 ...
- Java 性能分析工具 , 第 1 部分: 操作系统工具
引言 性能分析的前提是将应用程序内部的运行状况以及应用运行环境的状况以一种可视化的方式更加直接的展现出来,如何来达到这种可视化的展示呢?我们需要配合使用操作系统中集成的程序监控工具和 Java 中内置 ...
- 系统级性能分析工具perf的介绍与使用
测试环境:Ubuntu16.04(在VMWare虚拟机使用perf top存在无法显示问题) Kernel:3.13.0-32 系统级性能优化通常包括两个阶段:性能剖析(performance pro ...
- KRPano资源分析工具使用说明(KRPano XML/JS解密 切片图批量下载 球面图还原 加密混淆JS还原美化)
软件交流群:571171251(软件免费版本在群内提供) krpano技术交流群:551278936(软件免费版本在群内提供) 最新博客地址:blog.turenlong.com 限时下载地址:htt ...
- 使用KRPano资源分析工具强力加密KRPano项目(XML防破解,切片图保护,JS反调试)
软件交流群:571171251(软件免费版本在群内提供) krpano技术交流群:551278936(软件免费版本在群内提供) 最新博客地址:blog.turenlong.com 限时下载地址:htt ...
- 使用KRPano资源分析工具分析动态网站资源
软件交流群:571171251(软件免费版本在群内提供) krpano技术交流群:551278936(软件免费版本在群内提供) 最新博客地址:blog.turenlong.com 限时下载地址:htt ...
随机推荐
- (2编写网络)自己动手,编写神经网络程序,解决Mnist问题,并网络化部署
基于<神经网络和深度学习>这本绝好的教材提供的相关资料和代码,我们自己动手编写"随机取样的梯度下降神经网络".为了更好地说明问题,我们先从简单的开始: 1.sigmod ...
- 为静态博客生成器WDTP移植了一款美美哒主题
前言 关于这个主题的移植后公布,我已经联系了主题作者并取得同意,这个主题是一夜涕所写的Sgreen,预览图见下 关于WDTP 就是一个很方便很便携很快速的cpp编写的带gui跨平台的开源的静态博客生成 ...
- Restructure output of R summary function
Treat it as a data.frame: set.seed(1)x <- sample(30, 100, TRUE) summary(x)# Min. 1st Qu. Medi ...
- .net core mvc 错误信息显示 ModelState.AddModelError
关于ModelState.AddModelError错误信息不在前端页面显示问题.经过一位高人指定终于知道了为什么,在次写着警示自己看文档一定要仔细.再次感谢这为兄弟 https://www.cnbl ...
- [转载]undefined reference to `memcpy@GLIBC_2.14'
转自:http://blog.sina.com.cn/s/blog_6c5a47d30102wfw9.html undefined reference to `memcpy@GLIBC_2.14' ( ...
- StringBuilder的三种删除方法比较
分别用一千万次循环来比较StringBuilder的三种删除方法所用时间 未避免偶然性,再循环一百次来比较总时间 --主类 public class StringBuilderRemove { pub ...
- IIS7.5 错误代码0x8007007e HTTP 错误 500.19 - Internal Server Error
今天在win2008+IIS7.5的环境中部署WCF服务后,一直出现无法打开的页面.具体错误信息如下: HTTP 错误 500.19 - Internal Server Error 无法访问请求的页面 ...
- shell中的${},##, %% , :- ,:+, ? 的使用
假设我们定义了一个变量为:file=/dir1/dir2/dir3/my.file.txt 可以用${ }分别替换得到不同的值:${file#*/}:删掉第一个/ 及其左边的字符串:dir1/dir2 ...
- 关于页面的跳转添加参数(比如id啥的)
最近一些新手老是问我一些关于页面之间的传递跳转,怎么带参数这件事,(比如说一个列表页到详情页面数据是怎么传输的),今个没事就在这说一些! 这里拿列表页面到详情页面来阐述下哈! 首先在列表页,我们通过a ...
- _spellmod_aura_trigger
一.spell.dbc做一个空光环 二.配置_spellmod_aura_trigger表 comment 备注 aura 光环ID,有此光环时,才会触发下面技能 linkSpell1-3 链接的技能 ...