R(六): RODBC 访问SqlServer

在我的实际工作中，数据来源一方面是关系型数据库MS SqlServer, 别一方面是HBase。本节主要介绍通过RODBC访问MS SqlServer 安装配置，参见资料（https://msdn.microsoft.com/en-us/library/hh568454(v=sql.110).aspx），请注意：下载的msodbc 的版本与 unixODBC的版本之间有强制的对应关系，参见：（https://msdn.microsoft.com/en-us/library/hh568449(v=sql.110).aspx），本文选择安装的是 msodbcsql-11.0.2270.0 ，按官方介绍，对应的unixodbc 版本为：unixODBC-2.3.0

目录：

• unixODBC安装
• Msodbcsql安装
• ODBC配置
• RODBC安装
• RODBC调用示例

说明：

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• unixODBC提供了Linux对ODBC的支持，但它只是一个ODBC的管理器，要连接实际的数据库还需要提供这种数据库的ODBC驱动
• msodbcsql是Linux下用于连接sqlServer的免费ODBC驱动 (注意： 必须先装unixODBC,再安装sqlserverodbc)
• RODBC是R脚本连接ODBC的软件包

unixODBC安装：

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• 软件安装包下载（unixODBC-2.3.0.tar.gz），下载地址：https://sourceforge.net/projects/unixodbc/files/unixODBC/2.3.0/
• 命令：yum remove unixODBC   （如果机器上已经安装其它版本的unixODBC,安装前需要先将其删除)
• 命令：tar xvzf unixODBC-2.3.0.tar.gz   （将下载到本地的软件包上传至linux主机并解压）
• 命令：cd unixODBC-2.3.0   (切换至解压后的目录）
• 命令：CPPFLAGS="-DSIZEOF_LONG_INT=8"
• 命令：export CPPFLAGS
• 命令：./configure --prefix=/usr --libdir=/usr/lib64 --sysconfdir=/etc --enable-gui=no --enable-drivers=no --enable-iconv --with-iconv-char-enc=UTF8 --with-iconv-ucode-enc=UTF16LE
• 命令：make  (编译安装)
• 命令：make install

Msodbcsql安装：

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• 软件安装包下载（msodbcsql-11.0.2270.0.tar.gz），下载地址：https://www.microsoft.com/en-us/download/details.aspx?id=36437
• 命令：tar xvzf msodbcsql-11.0.2270.0.tar.gz  （安装包上传到linux 主机后解压）
• 命令：cd msodbcsql-11.0.2270.0     (切换至解压后主目录）
• 命令：./install.sh verify       (验证当前环境是否满足软件安装要求）
• 命令：./install.sh install   （上一步ok的前提下，执行安装）
• 命令：odbcinst -q -d -n "ODBC Driver 11 for SQL Server"    （测试安装是否成功，如下则ok）

  Description=Microsoft ODBC Driver 11 for SQL Server
  Driver=/opt/microsoft/msodbcsql/lib64/libmsodbcsql-11.0.so.2270.0
  Threading=1
  UsageCount=1

ODBC配置：

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• 安装成功后，在 /etc 目录下能找着 odbcinst.ini  和 odbc.ini 文件
• odbcinst.ini 表示本机已经安装了哪些类型的驱动，正确安装后内容如下

  [ODBC Driver 11 for SQL Server]
  Description=Microsoft ODBC Driver 11 for SQL Server
  Driver=/opt/microsoft/msodbcsql/lib64/libmsodbcsql-11.0.so.2270.0
  Threading=1
  UsageCount=1

• 命令：vim /etc/odbc.ini    (配置MS sqlserver 连接信息）,在打开的文件中输入如下内容

  [testsql]
  Driver=ODBC Driver 11 for SQL Server
  Server= 数据库服务器名或IP
  Database=数据库名

• 注意：Driver 赋值必须与 odbcinst 文件中 安全一致

• 命令：isql testsql sa XXXX    (testsql: 设置的odbc连接名，后面以空格输入用户名和密码，成功连接则OK，如图）
• 
• 命令： quit   (退出）

RODBC安装：

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• 命令：R    （进入R命令行）
• 执行：install.packages("RODBC")     (安装RODBC）
• 安装完成后，在R命令行下执行如下脚本，结果如下则OK

  library(RODBC)
  pile <- odbcConnect("testsql",uid = "sa",pwd = "yourPassword")
  data <- sqlQuery(pile,"select top 5 code,name from codeItems")
  close(pile)
  data

• 结果如下，则ok
• 

ODBC的访问接口

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• odbcConnect  可以打开一个连接，返回一个用于随后数据库访问的控制（handle）。 打印一个连接会给出ODBC连接的一些细节，而调用 odbcGetInfo 会给出客户端和服务器的一些细节信息。
• 在一个连接中的表的细节信息可以通过函数 sqlTables 获得。
• 函数 sqlSave 会把 R 数据框复制到一个数据库的表中，
• 函数 sqlFetch 会把一个数据库中的表拷贝到 一个 R 的数据框中
• 通过sqlQuery进行查询，返回的结果是 R 的数据框。
• sqlCopy把一个 查询传给数据库，返回结果在数据库中以表的方式保存。 一种比较好的控制方式是首先调用 odbcQuery， 然后 用 sqlGetResults 取得结果。后者可用于一个循环中 每次获得有限行，就如函数 sqlFetchMore 的功能。
• 连接可以通过调用函数 close 来关闭。

sqlSave函数

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• sqlSave(channel, dat, tablename = NULL, append = FALSE,
          rownames = TRUE, colnames = FALSE, verbose = FALSE,
          safer = TRUE, addPK = FALSE, typeInfo, varTypes,
          fast = TRUE, test = FALSE, nastring = NULL)
  
  sqlUpdate(channel, dat, tablename = NULL, index = NULL,
            verbose = FALSE, test = FALSE, nastring = NULL,
            fast = TRUE)

• append：代表是否追加，默认不追加，如果一张已经有数据的表，就可以用append追加新的数据，需要同样的column，一般开个这个就行。

• rownames：可以是逻辑值，也可以是字符型。
• colnames：列名；
• verbose：默认为FALSE，是否发送语句到R界面，如果TRUE，那么每条上传数据就会出现在命令栏目致之中。
• addPK：是否将rownames指定为主键。