3D Slicer Reconstruct CT/MRI

1. Load DCM file of your CT/MRI

2. Go to Volume Rendering, click the eye button to show volume

3. Go to Editor -> Threshold Effect -> Change Threshold (only include the head) -> Apply

4. Go to Editor - > Make Model Effect -> Apply

5. Go to Volume Rendering, click the eye button to hide volume

6. Go to Models, find the reconstructed model

Remove Redundant Points in MeshLab

1. Load model into MeshLab

2. Go to Edit -> Select Connected Components in a region.

3. Select some points on the part you want to keep, MeshLab will automatically select all the connected components.

4.Go to Filters -> Selection -> Invert Selection

5. Press Delete button on your keyboard

6. Go to File -> Export Mesh As... to save the clean model

Reference:

https://www.youtube.com/watch?v=MKLWzD0PiIc

3D Slicer Reconstruct CT/MRI的更多相关文章

  1. 使用3D Slicer对图像进行配准

    在进行深度学习之前,我们需要图像进行一些预处理操作,其中配准是很重要的一环,以下将介绍使用软件3D Slicer来进行图像配准 3D Slicer是(1)一个软件平台,用以图像分析(包括配准和实时编辑 ...

  2. 3D Slicer Programmatically Set Slice Offset and Intersections 用代码修改Slicer中的切片偏移和交叉点显示

    在3D Slicer中,当我们导入.mha/.mhd等格式的volume文件后,那么我们就可以在Axial, Sagittal, Coronal三个方向来观察我们的MRI或者CT的图像了.3D Sli ...

  3. 3D Slicer中文教程(七)—图像中值滤波

    1.中值滤波概念 中值滤波是对一个滑动窗口内的诸像素灰度值排序,用其中值代替窗口中心象素的原来灰度值,它是一种非线性的图像平滑法,它对脉冲干扰级椒盐噪声的抑制效果好,在抑制随机噪声的同时能有效保护边缘 ...

  4. 3D Slicer中文教程(八)—导出STL文件

    一.STL文件简介 STL(立体平版印刷术的缩写)是由3D Systems创建的立体平版印刷CAD软件原生的文件格式STL有“标准三角语言”和“标准镶嵌语言”等几个事后回溯.这种文件格式是由许多其他软 ...

  5. 3D Slicer中文教程(六)—调用matlab函数(MatlabBridge使用方法)

    1.安装MatlabBridge插件 (1)在工具栏找到Extension,点击进入Extension Manager (2)找到MatlabBridge,安装 2.配置MATLAB环境 (1)在模块 ...

  6. 3D Slicer中文教程(五)—三维视图颜色改变

    3D Slicer在分割后三维重建的图像,效果很好,但是存在一定的不足,默认的颜色并不是很合适,这时手动设置三维视图下的需要的颜色就很有必要了.如下图所示,默认的三维重建后的颜色. 这样的颜色显然不是 ...

  7. 3D Slicer中文教程(四)—图像分割

    1.数据获取 (1)下载3D Slicer自带的样本数据 (2)选择自由的数据 (3)网上数据库等其他方式下载数据 2.分割工具 Segment Editor是一个用于分割的模块.细分(也称为轮廓)描 ...

  8. 3D Slicer中文教程(三)—数据加载及保存方式

    1.打开数据与保存数据 (1)打开数据 ——可以将数据拖拽到3D Slicer应用窗口或者从菜单栏工具栏打开. ——多种方式加载大量数据. 有关DICOM数据,请参阅DICOM模块文档. 对于几乎所有 ...

  9. 3D Slicer中文教程(一)—下载及安装方法

    3D Slicer是用于医学图像信息学,图像处理和三维可视化的开源软件平台. 通过国家卫生研究院和全球开发人员社区的支持,二十多年来,Slicer为医生,研究人员和公众提供了免费,强大的跨平台加工工具 ...

随机推荐

  1. jquery自带的进度条功能如何使用?

    弹出进度条:先做弹出的功能modal,再做进度条显示.在弹出的界面上增加进度条功能 $.ajax({ xhr: function() { var xhr = new window.XMLHttpReq ...

  2. 版本控制:tortoise svn的 revert to this revision和 revert changes from this revision有什么区别?

    问题: The link: http://tortoisesvn.net/docs/nightly/TortoiseSVN_en/tsvn-howto-rollback.html describes ...

  3. Android 使用easeui 3.0 集成环信即时通讯 我踩过的坑

    0.关于注冊账号就不用说了. 1.创建应用.获取appkey 0.创建应用 1.填写信息 2.获取appkey 2.集成 0.首先新建一个project 1.这里主要介绍使用easeui来集成环信的即 ...

  4. MyBatis架构与源码分析<资料收集>

    1.架构与源码分析 :https://www.cnblogs.com/luoxn28/p/6417892.html .https://www.cnblogs.com/wangdaijun/p/5296 ...

  5. javascript 回调函数定义 模板

    函数定义: function callfun(in_param,callback) { console.log(in_param); var out_param='bbbbb'; return (ty ...

  6. 【问题与解决】Mac OS通过 npm 安装 React Native 报错(checkPermissions Missing write access to /usr/local/lib/node_modules)

    报错情况: 当Mac OS通过 npm 安装 React Native 报错,警告文字为:checkPermissions Missing write access to /usr/local/lib ...

  7. android自己定义控件之飞入飞出控件

    近期呢,本人辞职了.在找工作期间.不幸碰到了这个求职淡季,另外还是大学生毕业求职的高峰期,简历发了无数份却都石沉大海.宝宝心里那是一个苦啊! 翻着过去的代码,本人偶然找到了一个有意思的控件.那时本人还 ...

  8. 百度富文本编辑器整合fastdfs文件服务器上传

    技术:springboot+maven+ueditor   概述 百度富文本整合fastdfs文件服务器上传 详细 代码下载:http://www.demodashi.com/demo/15008.h ...

  9. 微信小程序--canvas画布实现图片的编辑

    技术:微信小程序   概述 上传图片,编辑图片大小,添加文字,改变文字颜色等 详细 代码下载:http://www.demodashi.com/demo/14789.html 概述 微信小程序--ca ...

  10. iOS 线上版本图片资源格式的问题导致的闪退

    链接:https://www.jianshu.com/p/6492779cb89e來源:简书 导致这种问题的原因是:在 Xcode 8 中,当你资源文件中[含有16位图]或者[图片显示模式γ值为'P3 ...