3D Slicer Reconstruct CT/MRI
3D Slicer Reconstruct CT/MRI
1. Load DCM file of your CT/MRI
2. Go to Volume Rendering, click the eye button to show volume
3. Go to Editor -> Threshold Effect -> Change Threshold (only include the head) -> Apply
4. Go to Editor - > Make Model Effect -> Apply
5. Go to Volume Rendering, click the eye button to hide volume
6. Go to Models, find the reconstructed model
Remove Redundant Points in MeshLab
1. Load model into MeshLab
2. Go to Edit -> Select Connected Components in a region.
3. Select some points on the part you want to keep, MeshLab will automatically select all the connected components.
4.Go to Filters -> Selection -> Invert Selection
5. Press Delete button on your keyboard
6. Go to File -> Export Mesh As... to save the clean model
Reference:
https://www.youtube.com/watch?v=MKLWzD0PiIc
3D Slicer Reconstruct CT/MRI的更多相关文章
- 使用3D Slicer对图像进行配准
在进行深度学习之前,我们需要图像进行一些预处理操作,其中配准是很重要的一环,以下将介绍使用软件3D Slicer来进行图像配准 3D Slicer是(1)一个软件平台,用以图像分析(包括配准和实时编辑 ...
- 3D Slicer Programmatically Set Slice Offset and Intersections 用代码修改Slicer中的切片偏移和交叉点显示
在3D Slicer中,当我们导入.mha/.mhd等格式的volume文件后,那么我们就可以在Axial, Sagittal, Coronal三个方向来观察我们的MRI或者CT的图像了.3D Sli ...
- 3D Slicer中文教程(七)—图像中值滤波
1.中值滤波概念 中值滤波是对一个滑动窗口内的诸像素灰度值排序,用其中值代替窗口中心象素的原来灰度值,它是一种非线性的图像平滑法,它对脉冲干扰级椒盐噪声的抑制效果好,在抑制随机噪声的同时能有效保护边缘 ...
- 3D Slicer中文教程(八)—导出STL文件
一.STL文件简介 STL(立体平版印刷术的缩写)是由3D Systems创建的立体平版印刷CAD软件原生的文件格式STL有“标准三角语言”和“标准镶嵌语言”等几个事后回溯.这种文件格式是由许多其他软 ...
- 3D Slicer中文教程(六)—调用matlab函数(MatlabBridge使用方法)
1.安装MatlabBridge插件 (1)在工具栏找到Extension,点击进入Extension Manager (2)找到MatlabBridge,安装 2.配置MATLAB环境 (1)在模块 ...
- 3D Slicer中文教程(五)—三维视图颜色改变
3D Slicer在分割后三维重建的图像,效果很好,但是存在一定的不足,默认的颜色并不是很合适,这时手动设置三维视图下的需要的颜色就很有必要了.如下图所示,默认的三维重建后的颜色. 这样的颜色显然不是 ...
- 3D Slicer中文教程(四)—图像分割
1.数据获取 (1)下载3D Slicer自带的样本数据 (2)选择自由的数据 (3)网上数据库等其他方式下载数据 2.分割工具 Segment Editor是一个用于分割的模块.细分(也称为轮廓)描 ...
- 3D Slicer中文教程(三)—数据加载及保存方式
1.打开数据与保存数据 (1)打开数据 ——可以将数据拖拽到3D Slicer应用窗口或者从菜单栏工具栏打开. ——多种方式加载大量数据. 有关DICOM数据,请参阅DICOM模块文档. 对于几乎所有 ...
- 3D Slicer中文教程(一)—下载及安装方法
3D Slicer是用于医学图像信息学,图像处理和三维可视化的开源软件平台. 通过国家卫生研究院和全球开发人员社区的支持,二十多年来,Slicer为医生,研究人员和公众提供了免费,强大的跨平台加工工具 ...
随机推荐
- 如何给webbrowser指定IE版本
void Button1Click(object sender, EventArgs e) { RegistryKey rk = Registry.LocalMachine; ...
- Docker Compose安装以及入门
Docker Compose 是 Docker 官方编排(Orchestration)项目之一,负责快速在集群中部署分布式应用. Compose 简介 Compose 项目是 Docker 官方的开源 ...
- C# 程序打包成安装项目
Xaml设置图标https://blog.csdn.net/u014234260/article/details/73648649 winform程序控制面板中卸载显示图标https://blog.c ...
- mybatis --- 如何相互转换逗号分隔的字符串和List
如果程序员想实现某种功能,有两条路可以走.一条就是自己实现,一条就是调用别人的实现,别人的实现就是所谓的API.而且大多数情况下,好多“别人”都 实现了这个功能.程序员有不得不在这其中选择.大部分情况 ...
- Android编码学习之Adapter
1. Apter的作用 Adapter是将数据绑定到UI界面上的桥接类.Adapter负责创建显示每个项目的子View和提供对下层数据的访问.Adapter的作用就是将要在列表内显示的数据和列表本身结 ...
- 对Faster R-CNN的理解(1)
目标检测是一种基于目标几何和统计特征的图像分割,最新的进展一般是通过R-CNN(基于区域的卷积神经网络)来实现的,其中最重要的方法之一是Faster R-CNN. 1. 总体结构 Faster R-C ...
- Ubuntu18.04下的模拟神器RetroArch
安装 直接通过apt安装 sudo add-apt-repository ppa:libretro/stable sudo apt update sudo apt install retroarch ...
- R语言中的回归诊断-- car包
如何判断我们的线性回归模型是正确的? 1.回归诊断的基本方法opar<-par(no.readOnly=TRUE) fit <- lm(weight ~ height, data = wo ...
- Mybatis 级联查询时只查出了一条数据
造成这个问题的原因是: 主表和明细表的id字段名相同造成的. 问题的关键在于resultMap中如果不定义类似主键之类的能够区分每一条结果集的字段的话,会引起后面一条数据覆盖前面一条数据的现象.
- Java8新特性interface中的static方法和default方法
static方法 java8中为接口新增了一项功能:定义一个或者更多个静态方法.用法和普通的static方法一样. 代码示例 public interface InterfaceA { /** * 静 ...