3D Slicer Reconstruct CT/MRI

1. Load DCM file of your CT/MRI

2. Go to Volume Rendering, click the eye button to show volume

3. Go to Editor -> Threshold Effect -> Change Threshold (only include the head) -> Apply

4. Go to Editor - > Make Model Effect -> Apply

5. Go to Volume Rendering, click the eye button to hide volume

6. Go to Models, find the reconstructed model

Remove Redundant Points in MeshLab

1. Load model into MeshLab

2. Go to Edit -> Select Connected Components in a region.

3. Select some points on the part you want to keep, MeshLab will automatically select all the connected components.

4.Go to Filters -> Selection -> Invert Selection

5. Press Delete button on your keyboard

6. Go to File -> Export Mesh As... to save the clean model

Reference:

https://www.youtube.com/watch?v=MKLWzD0PiIc

3D Slicer Reconstruct CT/MRI的更多相关文章

  1. 使用3D Slicer对图像进行配准

    在进行深度学习之前,我们需要图像进行一些预处理操作,其中配准是很重要的一环,以下将介绍使用软件3D Slicer来进行图像配准 3D Slicer是(1)一个软件平台,用以图像分析(包括配准和实时编辑 ...

  2. 3D Slicer Programmatically Set Slice Offset and Intersections 用代码修改Slicer中的切片偏移和交叉点显示

    在3D Slicer中,当我们导入.mha/.mhd等格式的volume文件后,那么我们就可以在Axial, Sagittal, Coronal三个方向来观察我们的MRI或者CT的图像了.3D Sli ...

  3. 3D Slicer中文教程（七）—图像中值滤波

    1.中值滤波概念 中值滤波是对一个滑动窗口内的诸像素灰度值排序,用其中值代替窗口中心象素的原来灰度值,它是一种非线性的图像平滑法,它对脉冲干扰级椒盐噪声的抑制效果好,在抑制随机噪声的同时能有效保护边缘 ...

  4. 3D Slicer中文教程（八）—导出STL文件

    一.STL文件简介 STL(立体平版印刷术的缩写)是由3D Systems创建的立体平版印刷CAD软件原生的文件格式STL有“标准三角语言”和“标准镶嵌语言”等几个事后回溯.这种文件格式是由许多其他软 ...

  5. 3D Slicer中文教程（六）—调用matlab函数（MatlabBridge使用方法）

    1.安装MatlabBridge插件 (1)在工具栏找到Extension,点击进入Extension Manager (2)找到MatlabBridge,安装 2.配置MATLAB环境 (1)在模块 ...

  6. 3D Slicer中文教程（五）—三维视图颜色改变

    3D Slicer在分割后三维重建的图像,效果很好,但是存在一定的不足,默认的颜色并不是很合适,这时手动设置三维视图下的需要的颜色就很有必要了.如下图所示,默认的三维重建后的颜色. 这样的颜色显然不是 ...

  7. 3D Slicer中文教程（四）—图像分割

    1.数据获取 (1)下载3D Slicer自带的样本数据 (2)选择自由的数据 (3)网上数据库等其他方式下载数据 2.分割工具 Segment Editor是一个用于分割的模块.细分(也称为轮廓)描 ...

  8. 3D Slicer中文教程（三）—数据加载及保存方式

    1.打开数据与保存数据 (1)打开数据 ——可以将数据拖拽到3D Slicer应用窗口或者从菜单栏工具栏打开. ——多种方式加载大量数据. 有关DICOM数据,请参阅DICOM模块文档. 对于几乎所有 ...

  9. 3D Slicer中文教程（一）—下载及安装方法

    3D Slicer是用于医学图像信息学,图像处理和三维可视化的开源软件平台. 通过国家卫生研究院和全球开发人员社区的支持,二十多年来,Slicer为医生,研究人员和公众提供了免费,强大的跨平台加工工具 ...

随机推荐

  1. Windows远程桌面(mstsc)不能复制粘贴的解决办法

    原来通过mstsc远程连接Windows能够直接在本地和服务器之间复制.粘贴一些文字和文件,最近突然无法直接复制粘贴了,只能通过远程映射的本地磁盘方式交换文件,太为繁琐. 已经确认远程桌面连接选项“本 ...

  2. x264阅读记录-3

      14. x264_macroblock_encode函数-1 这个函数主要根据已经选定的模式来对宏块残差进行编码. )如果是P_SKIP模式,那么调用x264_macroblock_encode_ ...

  3. QPS从0到4000请求每秒，谈达达后台架构演化之路（转载）

    https://blog.csdn.net/czbing308722240/article/details/52350219 QPS从0到4000请求每秒,谈达达后台架构演化之路   达达是全国领先的 ...

  4. ubuntu 16.04 源代码安装libusb

    libusb是一个跨平台的usb通讯库:https://libusb.info/ 在ubuntu16上安装 1. 首先安装 libudev-dev sudo apt-get install libud ...

  5. Xcode9.2打包图片显示异常解决方案

    链接:https://www.jianshu.com/p/ca0bbb403143來源:简书 在使用Xcode9.2适配iPhone X的过程中遇到了部分图片显示异常(不显示或花掉)的问题.主要分两种 ...

  6. vue实现部分页面导入底部 vue配置公用头部、底部，可控制显示隐藏

    vue实现部分页面导入底部 vue配置公用头部.底部,可控制显示隐藏 在app.vue文件里引入公共的header 和 footer header 和 footer 默认显示,例如某个页面不需要显示h ...

  7. CentOS 7.4nginx配置SSL

    一.在/etc/nginx/conf.d目录下创建虚拟主机配置文件 server { listen 80; server_name www.xx.com xx.com; return 301 http ...

  8. SNF软件开发机器人-子系统-功能-启用大按钮样式如何配置

    启用大按钮 当启用大按钮被选中后,页面的按钮图表将以按钮配置中的大按钮样式显示. 1.效果展示: 2.使用说明: 打开显示页面,点击开发者选项的简单配置按钮.在功能表信息中选择启用大按钮复选框后保存.

  9. 魔术方法__get()、__set()和__call（）的用法

    刚开始学习魔术方法时对__get().__set() 和__call()的用法和作用不是太了解,也有一些误解... 现在分享一下个人的理解,大家共勉一下: __get().__set() 和__cal ...

  10. blender show normals

    https://blenderartists.org/forum/showthread.php?193096-Blender-2-5-how-to-show-normals-in-viewport