配置window下python3环境
功能介绍 整理生信小知识库,一些技巧一些知识。
昨天
以下配置环境基于window操作系统,安装python3版本为例,推荐基础版配置。
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METHOD 1 (基础版)
官网下载对应电脑版本的python3:https://www.python.org/downloads/windows/
下载程序文件完成后双击执行,注意:勾选Add Python 3.X to PATH。然后点击 Install Now,后续一直点击确认即可。(如果未勾选Add Python to PATH,安装完成后需要手动添加目录到环境变量中,参考后续步骤3.a)
确认完成
键盘win+R调出运行框,输入cmd,回车。(或依次点击开始-Windows 系统-命令提示符)。键入python后回车,出现如下提示即表示安装完成,键入exit()回车可退出
(optional)没有勾选自动添加python3到环境变量,可手动添加
找到python3安装目录,记不得当初安装的目录,可在C盘搜索关键词python3,本次安装的是3.8版本,选择正确的目录后,右键选择打开文件夹位置,选择地址栏并复制
右键我的电脑打开属性-高级系统设置-环境变量,选系统变量中Path一栏点击编辑
点击新建,将第i步复制的路径粘贴进去;再次点击新建,粘贴路径再手动添加\Script\,如下图。后续一直确认即可,同样可以用步骤三的方法确认是否成功。
安装模块。打开命令提示符,键入pip install 模块名,等待安装完成即可。
修改并运行脚本。
如果未安装其他编辑器,可选择python3安装自带的IDLE工具打开脚本进行编辑;运行脚本只需将脚本文件拷贝放置到正确目录,双击即可运行。(对于仅需要运行python脚本的用户,到此即可)
通过sublime文本编辑器修改并运行脚本
Sublime Text 是一个文本编辑器(收费软件,可以无限期试用,只是偶尔会有激活提示弹窗,关闭即可),下载链接:https://www.sublimetext.com/,下载后双击安装即可。
配置sublime的python3环境。打开软件,选择Tools-Build System-New Build System,写入如下内容,注意:修改图中红色框python的路径为步骤3.a.i所粘贴的路径,并将斜杠(/)改成双反斜杠(\\)
{"encoding": "utf-8","working_dir": "$file_path","shell_cmd": "C:\\Users\\aiyac\\Anaconda3\\python.exe -u \"$file\"","file_regex": "^[ ]*File \"(...*?)\", line ([0-9]*)","selector": "source.python","env": {"PYTHONIOENCODING": "utf8"},}键盘ctrl+S另存为,重命名为python38.sublime-build
设置默认执行python3的版本,如下步骤勾选。
设置python脚本默认打开方式为sublime。选择一个python脚本文件(没有的话新建一个txt文件,重命名将后缀修改成.py即可),右键选择打开方式-选择其他应用,找到sublime,勾选始终使用此应用打开.py,点击确定。
运行脚本。双击打开python脚本后,键盘Ctrl+B(或在工具栏选择Tools-Build)即可运行脚本。
METHOD 2 (anaconda版)
anaconda是一个开源的Python发行版本,其包含了conda、Python等180多个科学包及其依赖项,因为包含了大量的科学包,Anaconda 的下载文件比较大。无需单独安装python。
下载相应版本anaconda:https://www.anaconda.com/distribution/#download-section
双击安装,一直选择默认即可,安装成功后在电脑开始会有anaconda文件夹,其中Anaconda Prompt类似windows下的命令提示符
同样可以使用sublime编辑,找到anaconda版本下的python路径,参考METHOD 1 步骤5中的配置即可。
使用jupyter lab编辑脚本和文档。点击上一步的Prompt,输入jupyter lab回车,将调用默认浏览器打开编辑器。
jupyter lab是一个交互式的开发环境,使用jupyter lab可以:
可以开启终端,用于交互式运行代码,完全支持丰富的输出
完美支持 Markdown,Python,R,Julia,LaTeX等任何文本文件
增强notebook功能
超多插件支持
对于非python开发人员,是没有必要配置jupyter的,配置好sublime编辑器即可。
今天就这样,peace & love
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