用R的igraph包来画蛋白质互作网络图 | PPI | protein protein interaction network | Cytoscape
igraph语法简单,画图快速。
Cytoscape专业,个性定制。
最终效果图:

当然也可以用Cytoscape来画。

参考:Network visualization with R
http://www.360doc.com/content/17/0305/22/19913717_634279918.shtml
用R的igraph包来画蛋白质互作网络图 | PPI | protein protein interaction network | Cytoscape的更多相关文章
- R语言igraph 包-构建网络图
igaph 是一个项目,目标是建立一条简单,易用的网络分析工具,有 R, python, C/C++ 等语言的具体实现: 项目主页: http://igraph.org/ 在R语言中,对应的就是 ig ...
- 如何利用R包qqman画曼哈顿图?
如何利用R包qqman画曼哈顿图? 2017-07-10 lili 生信人 众多周知,R语言提供了各种各样的包,方便实现我们的目的,下面给大家介绍一个可以便捷的画曼哈顿图的包:qqman instal ...
- R语言︱SNA-社会关系网络—igraph包(社群划分、画图)(三)
每每以为攀得众山小,可.每每又切实来到起点,大牛们,缓缓脚步来俺笔记葩分享一下吧,please~ --------------------------- 社群划分跟聚类差不多,参照<R语言与网站 ...
- R语言︱SNA-社会关系网络—igraph包(中心度、中心势)(二)
每每以为攀得众山小,可.每每又切实来到起点,大牛们,缓缓脚步来俺笔记葩分享一下吧,please~ --------------------------- SNA社会关系网络分析中,关键的就是通过一些指 ...
- R语言 ggplot2包
R语言 ggplot2包的学习 分析数据要做的第一件事情,就是观察它.对于每个变量,哪些值是最常见的?值域是大是小?是否有异常观测? ggplot2图形之基本语法: ggplot2的核心理念是将 ...
- R语言常用包汇总
转载于:https://blog.csdn.net/sinat_26917383/article/details/50651464?locationNum=2&fps=1 一.一些函数包大汇总 ...
- R语言-神经网络包RSNNS
code{white-space: pre;} pre:not([class]) { background-color: white; }if (window.hljs && docu ...
- R语言-Knitr包的详细使用说明
R语言-Knitr包的详细使用说明 by 扬眉剑 来自数盟[总舵] 群:321311420 1.相关资料 1:自动化报告-谢益辉 https://github.com/yihui/r-ninja/bl ...
- R语言dplyr包初探
昨天学了一下R语言dplyr包,处理数据框还是很好用的.记录一下免得我忘记了... 先写一篇入门的,以后有空再写一篇详细的用法. #dplyr learning library(dplyr) #fil ...
随机推荐
- CentOS 7 install slurm cluster
//slurm install //CentOS 7 system //192.168.159.141 node01 //192.168.159.142 node02 systemctl stop f ...
- DOM元素加载之前执行的jQuery代码
<script type="text/javascript"> (function() { alert("DOM还没加载哦!"); })(jQuer ...
- Spring 学习——Resources接口
Resources 针对资源文件的统一接口 Resources UrlResource:URL对应的资源,只需要一个url即可构建 ClassPathResource:获取类路径下的资源文件 File ...
- HDU 1848 Fibonacci again and again【博弈SG】
Problem Description 任何一个大学生对菲波那契数列(Fibonacci numbers)应该都不会陌生,它是这样定义的: F(1)=1; F(2)=2; F(n)=F(n-1)+F( ...
- LVM基本应用,扩展及缩减实现
一.基本概念 如上图所示:底层PV(物理卷可能是硬盘设备,分区或RAID等),一个或多个PV组织成一个VG(卷组),卷组是不能直接格式化使用的,所以在VG之上,还需要创建LV进行格式化使用.VG在逻辑 ...
- FileAttributes Enum
https://docs.microsoft.com/en-us/dotnet/api/system.io.fileattributes?view=netframework-4.7.2 读取FileA ...
- 【第四十章】Spring Boot 自定义拦截器
1.首先编写拦截器代码 package com.sarnath.interceptor; import javax.servlet.http.HttpServletRequest; import ja ...
- 文件IO(2)
Lseek: *************************************************************************** 实验一: ...
- Kubernetes之Controllers二
Deployments A Deployment controller provides declarative updates for Pods and ReplicaSets. You des ...
- center os
CentOS.Ubuntu.Debian三个linux比较异同 Center OS 7 安装 $$ center os 安装mysql5.6 Linux学习之Center os网络配置 Cent Os ...