用R的igraph包来画蛋白质互作网络图 | PPI | protein protein interaction network | Cytoscape
igraph语法简单,画图快速。
Cytoscape专业,个性定制。
最终效果图:

当然也可以用Cytoscape来画。

参考:Network visualization with R
http://www.360doc.com/content/17/0305/22/19913717_634279918.shtml
用R的igraph包来画蛋白质互作网络图 | PPI | protein protein interaction network | Cytoscape的更多相关文章
- R语言igraph 包-构建网络图
igaph 是一个项目,目标是建立一条简单,易用的网络分析工具,有 R, python, C/C++ 等语言的具体实现: 项目主页: http://igraph.org/ 在R语言中,对应的就是 ig ...
- 如何利用R包qqman画曼哈顿图?
如何利用R包qqman画曼哈顿图? 2017-07-10 lili 生信人 众多周知,R语言提供了各种各样的包,方便实现我们的目的,下面给大家介绍一个可以便捷的画曼哈顿图的包:qqman instal ...
- R语言︱SNA-社会关系网络—igraph包(社群划分、画图)(三)
每每以为攀得众山小,可.每每又切实来到起点,大牛们,缓缓脚步来俺笔记葩分享一下吧,please~ --------------------------- 社群划分跟聚类差不多,参照<R语言与网站 ...
- R语言︱SNA-社会关系网络—igraph包(中心度、中心势)(二)
每每以为攀得众山小,可.每每又切实来到起点,大牛们,缓缓脚步来俺笔记葩分享一下吧,please~ --------------------------- SNA社会关系网络分析中,关键的就是通过一些指 ...
- R语言 ggplot2包
R语言 ggplot2包的学习 分析数据要做的第一件事情,就是观察它.对于每个变量,哪些值是最常见的?值域是大是小?是否有异常观测? ggplot2图形之基本语法: ggplot2的核心理念是将 ...
- R语言常用包汇总
转载于:https://blog.csdn.net/sinat_26917383/article/details/50651464?locationNum=2&fps=1 一.一些函数包大汇总 ...
- R语言-神经网络包RSNNS
code{white-space: pre;} pre:not([class]) { background-color: white; }if (window.hljs && docu ...
- R语言-Knitr包的详细使用说明
R语言-Knitr包的详细使用说明 by 扬眉剑 来自数盟[总舵] 群:321311420 1.相关资料 1:自动化报告-谢益辉 https://github.com/yihui/r-ninja/bl ...
- R语言dplyr包初探
昨天学了一下R语言dplyr包,处理数据框还是很好用的.记录一下免得我忘记了... 先写一篇入门的,以后有空再写一篇详细的用法. #dplyr learning library(dplyr) #fil ...
随机推荐
- c++ vector常见用法
//输出尾巴的元素 cout<<vec.back(); //定义vector迭代器 vector<int>::iterator ite=vec.begin(); for(ite ...
- was清除项目缓存数据
步骤 彻底清理删除后的项目缓存 删除${WAS_HOME}\AppServer\profiles\AppSrv01\config\cells\xxxxxNode01Cell/applications/ ...
- TCPCopy 使用方法
TCPCopy 使用方法 TCPCopy是一种请求复制(所有基于tcp的packets)工具,可以把在线请求导入到测试系统中去.目前此工具已经广泛应用于国内各大互联网公司. TCPCopy七大功能 1 ...
- 12.27 cf div3 解题报告
12.27 cf div3 解题报告 wxy.wxy,带上分拉,全场做了个无脑小白 比赛场地 A: T1,跟着模拟就好了 B: sort一遍之后 去除的数一定是a[1]或者a[n] 比较去除谁小就输出 ...
- 使用JAX-WS开发WebService
Axis2和CXF是目前流行的Webservice框架,这两个框架都属于重量级框架.相对而言,JAX-WS RI是一个轻量级的框架.开发WebService只需要很简单的几个步骤:写接口和实现-> ...
- [UVA-11039]Children's Game
解析 微扰法贪心经典题 代码 #include <bits/stdc++.h> using namespace std; bool cmp(const string &x, con ...
- web前端知识总结
前言: 一直想着整理一下关于前端的知识体系和资料,工作忙了些,挤挤总会有的,资料很多,就看你能不能耐下心坚持去学了,要多学多敲多想,祝你进步~ 学习之前首先要大概了解什么是HTML ,CSS , JS ...
- R 语言 Windows 环境 安装与Windows下制作R的package--Rtools
1.1 预装的软件 (所有软件都可以在 http://www.biosino.org/R/R-doc/Rm/ 和 http://www.biosino.org/R/requiredSoftWar ...
- 【Ruby】【遇到的问题】
1 Error fetching https://gems.ruby-china.org/: certificate verify failed (https://gems.ruby-china.or ...
- 前端单页面富应用(SPA)的实现
一. 什么是单页面富应用? 单页面应用:Single Page Application 概念:Web应用即使不刷新也在不同的页面间切换,解决浏览器前进.后退等机制被破坏等问题.并且页面访问会被浏览器保 ...