用R的igraph包来画蛋白质互作网络图 | PPI | protein protein interaction network | Cytoscape
igraph语法简单,画图快速。
Cytoscape专业,个性定制。
最终效果图:
当然也可以用Cytoscape来画。
参考:Network visualization with R
http://www.360doc.com/content/17/0305/22/19913717_634279918.shtml
用R的igraph包来画蛋白质互作网络图 | PPI | protein protein interaction network | Cytoscape的更多相关文章
- R语言igraph 包-构建网络图
igaph 是一个项目,目标是建立一条简单,易用的网络分析工具,有 R, python, C/C++ 等语言的具体实现: 项目主页: http://igraph.org/ 在R语言中,对应的就是 ig ...
- 如何利用R包qqman画曼哈顿图?
如何利用R包qqman画曼哈顿图? 2017-07-10 lili 生信人 众多周知,R语言提供了各种各样的包,方便实现我们的目的,下面给大家介绍一个可以便捷的画曼哈顿图的包:qqman instal ...
- R语言︱SNA-社会关系网络—igraph包(社群划分、画图)(三)
每每以为攀得众山小,可.每每又切实来到起点,大牛们,缓缓脚步来俺笔记葩分享一下吧,please~ --------------------------- 社群划分跟聚类差不多,参照<R语言与网站 ...
- R语言︱SNA-社会关系网络—igraph包(中心度、中心势)(二)
每每以为攀得众山小,可.每每又切实来到起点,大牛们,缓缓脚步来俺笔记葩分享一下吧,please~ --------------------------- SNA社会关系网络分析中,关键的就是通过一些指 ...
- R语言 ggplot2包
R语言 ggplot2包的学习 分析数据要做的第一件事情,就是观察它.对于每个变量,哪些值是最常见的?值域是大是小?是否有异常观测? ggplot2图形之基本语法: ggplot2的核心理念是将 ...
- R语言常用包汇总
转载于:https://blog.csdn.net/sinat_26917383/article/details/50651464?locationNum=2&fps=1 一.一些函数包大汇总 ...
- R语言-神经网络包RSNNS
code{white-space: pre;} pre:not([class]) { background-color: white; }if (window.hljs && docu ...
- R语言-Knitr包的详细使用说明
R语言-Knitr包的详细使用说明 by 扬眉剑 来自数盟[总舵] 群:321311420 1.相关资料 1:自动化报告-谢益辉 https://github.com/yihui/r-ninja/bl ...
- R语言dplyr包初探
昨天学了一下R语言dplyr包,处理数据框还是很好用的.记录一下免得我忘记了... 先写一篇入门的,以后有空再写一篇详细的用法. #dplyr learning library(dplyr) #fil ...
随机推荐
- VSCode 预览 .md 文件
VSCode安装md插件 选择Extensions, 输入Markdown Theme Kit,下面会出现相应插件,点击install(截图中因为我已经安装,所以是设置) 或者安装插件Markdown ...
- eMMC之分区管理、总线协议和工作模式【转】
本文转载自:https://blog.csdn.net/u013686019/article/details/66472291 一.eMMC 简介 eMMC 是 embedded MultiMedia ...
- TV Show Game 【2-SAT】
问题 K: TV Show Game 时间限制: 1 Sec 内存限制: 512 MB Special Judge 提交: 51 解决: 10 [提交] [状态] [命题人:admin] 题目描 ...
- UVALive 7512 November 11th 题解
思路:心态大崩,最多不讲了,最少应该是三个一组,比如......应该是.S..S.,这样占的最多 代码: #include<set> #include<map> #includ ...
- 一个查表置换的CM
说实话,今天被自己蠢哭了 因为看多了一个字符,以为是输入字符变形后的base64编码,也怪自己没大致看过base64汇编形式,把base64跟完了用py实现完算法才意思到是base64,这是题外话 本 ...
- ES6中新增的数组知识
JSON数组格式转换 JSON的数组格式就是为了前端快速的把JSON转换成数组的一种格式,我们先来看一下JSON的数组格式怎么写. let json = { '0': 'xzblogs', ...
- echarts获取数据的一些难点1
像上面获取数据后,如果再根据下方按钮查询不同获取的价格,虽然曲线价格能按照不同的来展示, 但是问题有: 查询到的company字段虽然在获取的data中能测试出,但是在上方填入这些companys后, ...
- [JavaScript] - 判断时间是否是当天
https://www.codewars.com/kata/is-the-date-today/train/javascript function isToday(date) { return new ...
- PowerDesigner使用方法入门学习
[转载:https://www.cnblogs.com/biehongli/p/6025954.html] 1:入门级使用PowerDesigner软件创建数据库(直接上图怎么创建,其他的概念知识可自 ...
- JqGrid 自定义子表格 及 自定义Json 格式数据不展示
项目第一次使用JqGrid ,发现功能强大,但由于对他不熟悉,也没有少走弯路,记录一下. 1.引用 <link href="~/Scripts/JqGrid/jqgrid/css/ui ...