igraph语法简单,画图快速。

Cytoscape专业,个性定制。

最终效果图:

当然也可以用Cytoscape来画。

参考:Network visualization with R

Cytoscape

http://www.360doc.com/content/17/0305/22/19913717_634279918.shtml

用R的igraph包来画蛋白质互作网络图 | PPI | protein protein interaction network | Cytoscape的更多相关文章

  1. R语言igraph 包-构建网络图

    igaph 是一个项目,目标是建立一条简单,易用的网络分析工具,有 R, python, C/C++ 等语言的具体实现: 项目主页: http://igraph.org/ 在R语言中,对应的就是 ig ...

  2. 如何利用R包qqman画曼哈顿图?

    如何利用R包qqman画曼哈顿图? 2017-07-10 lili 生信人 众多周知,R语言提供了各种各样的包,方便实现我们的目的,下面给大家介绍一个可以便捷的画曼哈顿图的包:qqman instal ...

  3. R语言︱SNA-社会关系网络—igraph包(社群划分、画图)(三)

    每每以为攀得众山小,可.每每又切实来到起点,大牛们,缓缓脚步来俺笔记葩分享一下吧,please~ --------------------------- 社群划分跟聚类差不多,参照<R语言与网站 ...

  4. R语言︱SNA-社会关系网络—igraph包(中心度、中心势)(二)

    每每以为攀得众山小,可.每每又切实来到起点,大牛们,缓缓脚步来俺笔记葩分享一下吧,please~ --------------------------- SNA社会关系网络分析中,关键的就是通过一些指 ...

  5. R语言 ggplot2包

    R语言  ggplot2包的学习   分析数据要做的第一件事情,就是观察它.对于每个变量,哪些值是最常见的?值域是大是小?是否有异常观测? ggplot2图形之基本语法: ggplot2的核心理念是将 ...

  6. R语言常用包汇总

    转载于:https://blog.csdn.net/sinat_26917383/article/details/50651464?locationNum=2&fps=1 一.一些函数包大汇总 ...

  7. R语言-神经网络包RSNNS

    code{white-space: pre;} pre:not([class]) { background-color: white; }if (window.hljs && docu ...

  8. R语言-Knitr包的详细使用说明

    R语言-Knitr包的详细使用说明 by 扬眉剑 来自数盟[总舵] 群:321311420 1.相关资料 1:自动化报告-谢益辉 https://github.com/yihui/r-ninja/bl ...

  9. R语言dplyr包初探

    昨天学了一下R语言dplyr包,处理数据框还是很好用的.记录一下免得我忘记了... 先写一篇入门的,以后有空再写一篇详细的用法. #dplyr learning library(dplyr) #fil ...

随机推荐

  1. 集合框架-Map集合

    * Map集合和Collection集合的区别? * Map集合存储元素是成对出现的,Map集合的键是唯一的,值是可重复的.可以把这个理解为:夫妻对 * Collection集合存储元素是单独出现的, ...

  2. shell 变量相关的命令

    变量="变量" readonly 变量名="变量"  表示设置该变量为只读变量 ,这个变量不能别改变 echo $变量名 set  显示本地所有的变量 unse ...

  3. 【Python028--引入文件】

    一.打开文件 1.open()函数 打开模式 执行操作 ‘r’ 以只读方式打开文件(默认) ‘w’ 以写入的方式打开文件,会覆盖已存在的文件 ‘x’     如果文件已经存在,使用此模式打开将引发异常 ...

  4. 【转】RHEL(RedHat Enterprise Linux)5/6 ISO镜像下载

    本文贴出了RHEL(RedHat Enterprise Linux)发行版本中常用的服务器版本的ISO镜像文件,供大家下载学习使用,贴出的版本有RedHat Enterprise Linux(RHEL ...

  5. ODAC(V9.5.15) 学习笔记(十四)TCRBatchMove

    名称 类型 说明 AbortOnKeyViol Boolean 在处理数据时,如果发生主键冲突或主键校验失败时,是否中断 AbortOnProblem Boolean 发生问题时是否中断 Change ...

  6. Linux电源管理(五)thermal【转】

    本文转载自:https://blog.csdn.net/zhouhuacai/article/details/78172267 版权声明:本文为博主原创文章,未经博主允许不得转载.    https: ...

  7. Windows 安装Java与配置环境变量

    window系统安装java 下载JDK 首先我们需要下载java开发工具包JDK,下载地址:http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloa ...

  8. aria2的下载配置

    aria2的命令行命令是: aria2c 一种方式: aria2c "http://host/file.zip" 如同wget 第二种方式: rpc server方式:

  9. win32汇编(ASM)学习资源

    网站 AoGo汇编小站(MASMPlus作者) Win32Asm教程在线版 Win32Asm教程博客园文件备份版 Masm32补充教程系列 Win32 ASM Tutorial Resource Ki ...

  10. leetcode 04 Median of Two Sorted Arrays

    n1 为 num1的 len n2 为 num2的 len 故中间的数应该是 k = (n1 + n2 + 1) / 2 二分 num1中位置 m1 , 故 num2的位置为m2 必须保证 nums1 ...