用R的igraph包来画蛋白质互作网络图 | PPI | protein protein interaction network | Cytoscape
igraph语法简单,画图快速。
Cytoscape专业,个性定制。
最终效果图:

当然也可以用Cytoscape来画。

参考:Network visualization with R
http://www.360doc.com/content/17/0305/22/19913717_634279918.shtml
用R的igraph包来画蛋白质互作网络图 | PPI | protein protein interaction network | Cytoscape的更多相关文章
- R语言igraph 包-构建网络图
igaph 是一个项目,目标是建立一条简单,易用的网络分析工具,有 R, python, C/C++ 等语言的具体实现: 项目主页: http://igraph.org/ 在R语言中,对应的就是 ig ...
- 如何利用R包qqman画曼哈顿图?
如何利用R包qqman画曼哈顿图? 2017-07-10 lili 生信人 众多周知,R语言提供了各种各样的包,方便实现我们的目的,下面给大家介绍一个可以便捷的画曼哈顿图的包:qqman instal ...
- R语言︱SNA-社会关系网络—igraph包(社群划分、画图)(三)
每每以为攀得众山小,可.每每又切实来到起点,大牛们,缓缓脚步来俺笔记葩分享一下吧,please~ --------------------------- 社群划分跟聚类差不多,参照<R语言与网站 ...
- R语言︱SNA-社会关系网络—igraph包(中心度、中心势)(二)
每每以为攀得众山小,可.每每又切实来到起点,大牛们,缓缓脚步来俺笔记葩分享一下吧,please~ --------------------------- SNA社会关系网络分析中,关键的就是通过一些指 ...
- R语言 ggplot2包
R语言 ggplot2包的学习 分析数据要做的第一件事情,就是观察它.对于每个变量,哪些值是最常见的?值域是大是小?是否有异常观测? ggplot2图形之基本语法: ggplot2的核心理念是将 ...
- R语言常用包汇总
转载于:https://blog.csdn.net/sinat_26917383/article/details/50651464?locationNum=2&fps=1 一.一些函数包大汇总 ...
- R语言-神经网络包RSNNS
code{white-space: pre;} pre:not([class]) { background-color: white; }if (window.hljs && docu ...
- R语言-Knitr包的详细使用说明
R语言-Knitr包的详细使用说明 by 扬眉剑 来自数盟[总舵] 群:321311420 1.相关资料 1:自动化报告-谢益辉 https://github.com/yihui/r-ninja/bl ...
- R语言dplyr包初探
昨天学了一下R语言dplyr包,处理数据框还是很好用的.记录一下免得我忘记了... 先写一篇入门的,以后有空再写一篇详细的用法. #dplyr learning library(dplyr) #fil ...
随机推荐
- 20145212 罗天晨 《网络对抗》Exp3 Advanced 恶意代码伪装技术实践
恶意代码伪装技术实践 木马化正常软件. 啊哈--原本以为很复杂--然后我看了一下蔡野同学的博客,发现原理竟然如此简单-- 对原先生成病毒的代码稍作修改: 于是--把生成的后门软件改成骗人的名字:这里改 ...
- orm查询存在价格为空问题
明明写的没错还是查不到 打印一下sql语句: 解决办法: 把数字变成字符串格式 所以涉及金融计算,涉及小数啊,要求特别精确的,我们用字符串存储.
- javaweb三大框架和MVC设计模式
javaweb三大框架和MVC设计模式 转载,原文请见https://blog.csdn.net/sunpeng19960715/article/details/50890705 一.MVC设计模式 ...
- topcoder srm 420 div1
problem1 link 暴力即可.因为即便所有数字的和是50,50所有的不同的划分数只有204226中.所以最长的循环也就这么大. problem2 link 令$f[i][j]$表示有$i$个红 ...
- Python3基础 list [] 创建整数列表
Python : 3.7.0 OS : Ubuntu 18.04.1 LTS IDE : PyCharm 2018.2.4 Conda ...
- Android系统更新防互刷功能实现与分析【转】
本文转载自:https://blog.csdn.net/huangyabin001/article/details/44465145 版权声明:本文为博主原创文章,未经博主允许不得转载. htt ...
- php的__autoload和php的__call
首先, __call是php语言自身就具有的一种语言features...,不是thinkphp的语言特征. 关于__call参考: http://love-love-l.blog.163.com/b ...
- 【做题】BZOJ2342 双倍回文——马拉车&并查集
题意:有一个长度为\(n\)的字符串,求它最长的子串\(s\)满足\(s\)是长度为4的倍数的回文串,且它的前半部分和后半部分都是回文串. \(n \leq 5 \times 10^5\) 首先,显然 ...
- c# 进阶之 WebAPI
REST是设计风格而不是标准. webapi有自己的路由. webservice和wcf的协议都是soap协议,数据的序列化和反序列化都是soap的格式.而webapi是Json的数据传递 webap ...
- hotmail 发送邮件 的服务器地址如下
hotmail的服务器地址如下: pop服务器地址:pop-mail.outlook.com smtp服务器地址:smtp-mail.outlook.com imap服务器地址:imap-mail.o ...