igraph语法简单,画图快速。

Cytoscape专业,个性定制。

最终效果图:

当然也可以用Cytoscape来画。

参考:Network visualization with R

Cytoscape

http://www.360doc.com/content/17/0305/22/19913717_634279918.shtml

用R的igraph包来画蛋白质互作网络图 | PPI | protein protein interaction network | Cytoscape的更多相关文章

  1. R语言igraph 包-构建网络图

    igaph 是一个项目,目标是建立一条简单,易用的网络分析工具,有 R, python, C/C++ 等语言的具体实现: 项目主页: http://igraph.org/ 在R语言中,对应的就是 ig ...

  2. 如何利用R包qqman画曼哈顿图?

    如何利用R包qqman画曼哈顿图? 2017-07-10 lili 生信人 众多周知,R语言提供了各种各样的包,方便实现我们的目的,下面给大家介绍一个可以便捷的画曼哈顿图的包:qqman instal ...

  3. R语言︱SNA-社会关系网络—igraph包(社群划分、画图)(三)

    每每以为攀得众山小,可.每每又切实来到起点,大牛们,缓缓脚步来俺笔记葩分享一下吧,please~ --------------------------- 社群划分跟聚类差不多,参照<R语言与网站 ...

  4. R语言︱SNA-社会关系网络—igraph包(中心度、中心势)(二)

    每每以为攀得众山小,可.每每又切实来到起点,大牛们,缓缓脚步来俺笔记葩分享一下吧,please~ --------------------------- SNA社会关系网络分析中,关键的就是通过一些指 ...

  5. R语言 ggplot2包

    R语言  ggplot2包的学习   分析数据要做的第一件事情,就是观察它.对于每个变量,哪些值是最常见的?值域是大是小?是否有异常观测? ggplot2图形之基本语法: ggplot2的核心理念是将 ...

  6. R语言常用包汇总

    转载于:https://blog.csdn.net/sinat_26917383/article/details/50651464?locationNum=2&fps=1 一.一些函数包大汇总 ...

  7. R语言-神经网络包RSNNS

    code{white-space: pre;} pre:not([class]) { background-color: white; }if (window.hljs && docu ...

  8. R语言-Knitr包的详细使用说明

    R语言-Knitr包的详细使用说明 by 扬眉剑 来自数盟[总舵] 群:321311420 1.相关资料 1:自动化报告-谢益辉 https://github.com/yihui/r-ninja/bl ...

  9. R语言dplyr包初探

    昨天学了一下R语言dplyr包,处理数据框还是很好用的.记录一下免得我忘记了... 先写一篇入门的,以后有空再写一篇详细的用法. #dplyr learning library(dplyr) #fil ...

随机推荐

  1. 安装旧版本的Firefox

    在Ubuntu上安装就版本的Firefox,此处以version 46为例子: 1.删除已存在的Firefox, On CentOS/RHEL # yum remove firefox On Ubun ...

  2. Git冲突与解决方法【转】

    本文转载自:https://www.cnblogs.com/gavincoder/p/9071959.html Git冲突与解决方法 1.git冲突的场景 情景一:多个分支代码合并到一个分支时: 情景 ...

  3. C#开发者工具网

    使用key值[123456]对[50cms]进行对称加密-在线DES对称加密/解密- 开发者工具网  http://tool.sufeinet.com/Encrypt/DesEncrypt.aspx? ...

  4. Windows使用(类)Unix环境那些事

    之前的博文中有不少涉及到win下使用unix环境的一些东西,但都是为了做别的事情,还是写一个专门讲这个主题的文章吧. 主角:Cygwin.mingw-W64.MSYS2. 注:mingw已经停止更新很 ...

  5. oracle 之 定时任务,存储过程和游标等语法案例

    --定时任务 declare job20 number; begin sys.dbms_job.submit(job20,'test1;',sysdate,'sysdate+1'); end; --存 ...

  6. P1829 [国家集训队]Crash的数字表格 / JZPTAB

    推式子太快乐啦!虽然我好蠢而且dummy和maomao好巨(划掉) 思路 莫比乌斯反演的题目 首先这题有\(O(\sqrt n)\)的做法但是我没写咕咕咕 然后就是爆推一波式子 \[ \sum_{i= ...

  7. WebPack填坑笔记

    loader使用时不需要用require引入,在使用plugins(插件)才需要使用require引入 压缩js代码会导致热更新失效 所以开发环境先不要进行压缩 给css加前缀的 postcss-lo ...

  8. 使用PlaceHolder,测试碰见的问题

    org.springframework.beans.factory.BeanCreationException: Error creating bean with name 'sqlSessionFa ...

  9. Dalvik VM 和JVM的比较

    避免出现版权问题android重写JVM 两者在编译后的文件格式区别: JVM: .java->.class->.jar DALVIK VM:.java->.class->.d ...

  10. Nginx教程---01.Nginx入门

    create by 三七二十一 LZ参考视频(年代久远,但万变不离其宗): 链接:https://pan.baidu.com/s/1O_MmN0c3ckM6vbk08n8Qkg 密码:z9zr 01_ ...