如果一点基础没有最好先拿起一本教材开始学,《机器学习实战》还不错,P93,书上有python源码和练习数据,非常适合新手。

k均值聚类

名词:簇;相似度算法

伪代码

创建K个点作为起始质心
当任意一个点的簇分配结果发生变化时:
对数据集中的每个点:
对每个质心:
计算质心到数据点之间的距离
将数据点分配到距离其最近的簇
对每一个簇,计算簇中所有点的均值并将均值作为质心

目前的例子里聚类的对象都是数值点,这个在计算均值时比较容易理解,如果换到对人进行聚类(非数值),那怎么计算均值呢?

 

二分k均值聚类

 


数值型数据的聚类比较简单,尤其是坐标型的数据,那如何对非数值型数据进行聚类呢?

用Python实现文档聚类

 

在生物信息中的应用

 

 

待续~

K-均值聚类及其在生物信息中的应用的更多相关文章

  1. 【转】算法杂货铺——k均值聚类(K-means)

    k均值聚类(K-means) 4.1.摘要 在前面的文章中,介绍了三种常见的分类算法.分类作为一种监督学习方法,要求必须事先明确知道各个类别的信息,并且断言所有待分类项都有一个类别与之对应.但是很多时 ...

  2. 5-Spark高级数据分析-第五章 基于K均值聚类的网络流量异常检测

    据我们所知,有‘已知的已知’,有些事,我们知道我们知道:我们也知道,有 ‘已知的未知’,也就是说,有些事,我们现在知道我们不知道.但是,同样存在‘不知的不知’——有些事,我们不知道我们不知道. 上一章 ...

  3. 机器学习实战5:k-means聚类:二分k均值聚类+地理位置聚簇实例

    k-均值聚类是非监督学习的一种,输入必须指定聚簇中心个数k.k均值是基于相似度的聚类,为没有标签的一簇实例分为一类. 一 经典的k-均值聚类 思路: 1 随机创建k个质心(k必须指定,二维的很容易确定 ...

  4. 机器学习理论与实战(十)K均值聚类和二分K均值聚类

    接下来就要说下无监督机器学习方法,所谓无监督机器学习前面也说过,就是没有标签的情况,对样本数据进行聚类分析.关联性分析等.主要包括K均值聚类(K-means clustering)和关联分析,这两大类 ...

  5. 第十篇:K均值聚类(KMeans)

    前言 本文讲解如何使用R语言进行 KMeans 均值聚类分析,并以一个关于人口出生率死亡率的实例演示具体分析步骤. 聚类分析总体流程 1. 载入并了解数据集:2. 调用聚类函数进行聚类:3. 查看聚类 ...

  6. K均值聚类的失效性分析

    K均值聚类是一种应用广泛的聚类技术,特别是它不依赖于任何对数据所做的假设,比如说,给定一个数据集合及对应的类数目,就可以运用K均值方法,通过最小化均方误差,来进行聚类分析. 因此,K均值实际上是一个最 ...

  7. K均值聚类

    聚类(cluster)与分类的不同之处在于, 分类算法训练过程中样本所属的分类是已知的属监督学习. 而聚类算法不需要带有分类的训练数据,而是根据样本特征的相似性将其分为几类,又称为无监督分类. K均值 ...

  8. ML: 聚类算法-K均值聚类

    基于划分方法聚类算法R包: K-均值聚类(K-means)                   stats::kmeans().fpc::kmeansruns() K-中心点聚类(K-Medoids) ...

  9. 探索sklearn | K均值聚类

    1 K均值聚类 K均值聚类是一种非监督机器学习算法,只需要输入样本的特征 ,而无需标记. K均值聚类首先需要随机初始化K个聚类中心,然后遍历每一个样本,将样本归类到最近的一个聚类中,一个聚类中样本特征 ...

随机推荐

  1. IIS上部署MVC网站,打开后ExtensionlessUrlHandler-Integrated-4.0解决方法

    IIS上部署MVC网站,打开后ExtensionlessUrlHandler-Integrated-4.0解决方法 IIS上部署MVC网站,打开后500错误:处理程序“ExtensionlessUrl ...

  2. Android的消息处理机制Looper,Handler,Message

    android的消息处理有三个核心类:Looper,Handler和Message.其实还有一个Message Queue(消息队列),但是MQ被封装到Looper里面了,我们不会直接与MQ打交道,因 ...

  3. iOS开发debug跟release版本屏蔽NSLog方法

    1.在***-Prefix.pch里面添加 #ifndef __OPTIMIZE__ # define NSLog(...) NSLog(__VA_ARGS__) #else # define NSL ...

  4. 窗口移动--基类(BaseForm)

    #region 窗口移动 private bool _isLeftButtonDown = false; public const int HTCAPTION = 0x0002; protected ...

  5. 【leetcode❤python】13. Roman to Integer

    #-*- coding: UTF-8 -*-#从前向后遍历罗马数字,#如果某个数比前一个数小,则加上该数.反之,减去前一个数的两倍然后加上该数###-----技术规则-----#----------- ...

  6. CodeForces 567C Geometric Progression

    Geometric Progression Time Limit:1000MS     Memory Limit:262144KB     64bit IO Format:%I64d & %I ...

  7. CPU的一些参数和排名

    排名的信息来源: http://itianti.sinaapp.com/index.php/cpu 一些参数的信息来源: http://ark.intel.com/ 个人关注一些的一些CPU排名: I ...

  8. 迪米特法则(LoD),即最少知识原则

    解释: 如果两个类不必彼此直接通信,那么这两个类就不应当发生直接的相互作用.如果其中一个类需要调用另一个类的某一个方法的话,可以通过第三者转发这个调用. 重点: 在类的结构上,每个类都应当尽量降低成员 ...

  9. Codeforces Round #237 (Div. 2) B题模拟题

    链接:http://codeforces.com/contest/404/problem/B B. Marathon time limit per test 1 second memory limit ...

  10. python_way day16 DOM

    Python_way day16 1.Dom  (找到html中的标签) 一.DOM 1.查找元素 直接查找 document.getElementById 根据ID获取一个标签 --->这里是 ...