1

安装fastx toolkit的时候,步骤按https://blog.csdn.net/LotusWang0723/article/details/78723409

其中可能会出现如下报错

text_line_reader.cpp: In member function ‘bool TextLineReader::next_line()’:
text_line_reader.cpp:47:9: error: cannot convert ‘std::istream {aka std::basic_istream<char>}’ to ‘bool’ in return
return input_stream ;
^~~~~~~~~~~~
make[3]: *** [text_line_reader.lo] Error 1
make[2]: *** [all-recursive] Error 1
make[1]: *** [all-recursive] Error 1
make: *** [all] Error 2

可以找出问题文件,这样解决:

更多信息:

https://reviews.freebsd.org/D14892?id=40873

https://stackoverflow.com/questions/38659115/make-fails-with-error-cannot-convert-stdistream-aka-stdbasic-istreamchar

2.

这一步发生问题

Alternatively, you may set the environment variables GTEXTUTILS_CFLAGS
and GTEXTUTILS_LIBS to avoid the need to call pkg-config.
See the pkg-config man page for more details.

然后输入命令解决

sudo apt-get install pkg-config && sudo pkg-config

3.

在安装fastx toolkit 时make的时候报错

fasta_formatter.cpp: In function ‘void parse_command_line(int, char**)’:
fasta_formatter.cpp:105:9: error: this statement may fall through [-Werror=implicit-fallthrough=]
usage();
~~~~~^~
fasta_formatter.cpp:107:3: note: here
case 'i':
^~~~
cc1plus: all warnings being treated as errors
make[3]: *** [Makefile:425: fasta_formatter.o] Error 1
make[3]: Leaving directory '/tmp/SBo/fastx_toolkit-0.0.14/src/fasta_formatter'

Linux 使用记1 fastx toolkit安装问题的更多相关文章

  1. Linux环境搭建-在虚拟机中安装Centos7.0

    最近在空闲时间学习Linux环境中各种服务的安装与配置,都属于入门级别的,这里把所有的学习过程记录下来,和大家一起分享. 我的电脑系统是win7,所以我需要在win7上安装一个虚拟机-VMware,然 ...

  2. 记一次WordPress 安装的过程

    安装WordPress你我他大家都会,记得10年的时候,哥已经玩转WordPress.dedecms.sns,那为何现在要记一次WordPress安装过程呢? 因为现在不会了! 之前安装都是在Wind ...

  3. LINUX+Vmware+SVN的配置和安装

    LINUX+Vmware+SVN的配置和安装 验证SVN安装了没有 svnserve --version 查看CentOS自带JDK是否已安装. ◆输入:yum list installed |gre ...

  4. Linux (Ubuntu12.04) 下开发工具安装和使用

    Linux (Ubuntu12.04) 下开发工具安装和使用 这里讲述的是关于在ubuntu12.04下面安装和使用各种IDE 开发环境和初步使用的知识.说一下背景:很多的开发基本都是在linux操作 ...

  5. Linux下通过源码编译安装程序

    本文简单的记录了下,在linux下如何通过源码安装程序,以及相关的知识.(大神勿喷^_^) 一.程序的组成部分 Linux下程序大都是由以下几部分组成: 二进制文件:也就是可以运行的程序文件 库文件: ...

  6. windows下制作linux U盘启动盘或者安装优盘(转)

    windows下制作linux U盘启动盘或者安装优盘(转) Linux发行版排行榜:http://iso.linuxquestions.org/ [方案一]:UltraISO(不推荐,在Window ...

  7. Linux下非root用户如何安装软件

    Linux下非root用户如何安装软件 从windows转移到Linux的用户最开始总会有各种不适,因为这种不适最终放弃linux的不在少数.对于这类人只能说可惜,还没有领略到linux的美好就过早放 ...

  8. linux多种安装包格式的安装方法

    linux多种安装包格式的安装方法 一.rpm包安装方式步骤:1.找到相应的软件包,比如soft.version.rpm,下载到本机某个目录: 2.打开一个终端,su -成root用户: 3.cd s ...

  9. linux下Gnome桌面环境的安装

    在实际工作中,无论是生产环境还是公司内部环境.很多时候装的linux系统都是最小化安装的.即没有桌面环境, 那么如果有时我们又需要一个桌面环境.该怎么安装呢?其实不难,现笔者将安装方法分享如下. 测试 ...

随机推荐

  1. html 自定义上传图片样式,并回显

    <div id="photoUpLoad"> <input type="file" id="photo" name=&qu ...

  2. js动态添加元素绑定事件问题

    //开始是直接普通写的绑定click事件 其中li a i 中的i是动态添加的 结果是触发不了..$("li a i").click(function () { $(this).m ...

  3. pm2管理node

    一般直接npm start起的退出命令行就没了,node后台管理工具pm2目前比较流行. npm install -g pm2 pm2 list pm2 start bin/www --name de ...

  4. Spring--基础介绍一:IOC和DI

    前面学习了Struts2和Hibernate. Struts2主要是用来控制业务层面逻辑和显示,告诉你什么时候走哪个action,跑去运行哪个class的什么方法,后面调到哪个jsp. Struts2 ...

  5. Hibernate基础一

    前面已经学习了Struts2的基础知识,可以自己搭建一个简单的Struts2项目!现在开始Hibernate!从基础开始! 1.web内容回顾 JavaEE三层结构(后面要看下,三层架构是怎么区分的? ...

  6. Linux 防火墙iptables开放端口

    Iptabels是与Linux内核集成的包过滤防火墙系统,几乎所有的linux发行版本都会包含Iptables的功能.如果 Linux 系统连接到因特网或 LAN.服务器或连接 LAN 和因特网的代理 ...

  7. linux-kernel-4.4 移植 (2)解决上部遗留DMA-PL330的问题

    查看drivers/tty/serial/samsung.c文件发现,当传输数据量小于ourport->min_dma_size时,不使用DMA,大于等于min_mda_size时才是使用DMA ...

  8. 过滤器(Filter)与拦截器(Interceptor )区别

    目录 过滤器(Filter) 拦截器(Interceptor) 拦截器(Interceptor)和过滤器(Filter)的区别 拦截器(Interceptor)和过滤器(Filter)的执行顺序 拦截 ...

  9. Unity3D-RayMarch-几何图元1-添加基本着色模型

    效果图: 使用phong着色模型,将环境光.物体的漫反射光.镜面光三种光效加合而得到上图的效果 raymarch 的shader代码: // Upgrade NOTE: replaced '_Obje ...

  10. 探索未知种族之osg类生物---渲染遍历之器官协作

    好了,现在我们经过三节的介绍我们已经大体上明确了单线程模型(SingleThreaded)下 OSG 渲染遍历的工作流程.事实上无论是场景的筛选render还是绘制cull工作,最后都要归结到场景视图 ...