CESM部署安装环境和使用

平台信息

Description:    CentOS Linux release 7.6.1810 (Core) 

安装CESM

安装前提：（小提示：耗时较长，需要耐心）阅读原文

• CentOS 7（检查：sudo lsb_release -a）
• csh、sh（检查：which csh/sh）
• Perl（ 检查：perl -v）CentOS 7安装Perl环境
• svn 1.4.2+（检查：svn --version）
• PGI（Fortran、C编辑器，检查：pgcc --version）如何部署?
• MPICH（并行程序，可选）
• NetCDF（一系列软件库），如何部署?
• ESMF（Earth System Modeling Framework，可选）
• PnetCDF（Parallel NetCDF，建议使用1.3.1）User Guide Ubuntu根据安装说明执行make的时候，总是会报错，在指针的位置添加->format就可以了。而CentOS不会出现这种情况，所以实际科学计算还是推荐使用CentOS，可以省下不少时间。
  • tar（必选）
  • MPI C编译器（必选）
  • GNU m4（必选，压缩包中已包含）README
  • MPI C++编译器（可选）
  • MPI Fortran 77编译器（可选）
  • MPI Fortran 90编译器（可选）
• Trilinos（某些配置需要）
• LAPACHm（Linear Algebra PACKage，某些配置需要）
• CMake（检查：cmake --version）

正式安装：

1. 复制源代码和inputdata到Linux中。 提取码: w04m
2. 解包：tar jxf xxx.tar.bz2
3. 阅读cesmX_Y_Z/scripts/README

将CESM移植到本地机：

参考用户指南修改文件中所有的USERDEFINED_required_build

1. cd到cesm中的scripts中
2. 创建算例：./create_newcase -case mycase2 -res f19_g16 -compset B1850CN -mach yellowstone -confopts _D_P16，Ubuntu报错Unescaped left brace in regex is illegal here in regex;，CentOS 完全OK。
3. 切换到算例中：cd mycase2
4. 修改配置文件(可选)：vim env_mach_pes.xml
5. 安装算例：./cesm_setup
   • /glade/apps/opt/lmod/lmod/init/csh: No such file or directory
   • The follow lua module(s) are missing: posix（相似问题同样解决）

参考文献：

1. CESM网站
2. CESM 1.2 User‘s Guide
3. 地学中心模式团队成果被美国国家大气中心NCAR采用
4. 地球系统模式CESM的性能建模