如何使用Gephi工具进行可视化复杂网络图

在Gephi安装官网中也介绍了一些如何使用该工具的方法，我将根据自己的数据和可视化的图片进行介绍

第一步：整理数据格式，我的数据是.csv格式的（.xlsx，.xls等等）

数据第一行第一列必须是相同的，表示节点的标签，可以不用数字表示（如：N1,M2,B3等等任意形式表示，注意行列必须是相同的）

剩下数字表示节点之间的连接权重大小（不一定非要有连接表示为1，没有连接关系表示为0，如0.87,0.01等等都可以的）

当然除了这种节点和边在一起表示的对称矩阵外，还可以单独表示节点和边序列的形式，这里先介绍第一种

第二步：开始导入Gephi中进行可视化啦

打开gephi工具后可以看见上面的界面，可以点击新建工程，当然还可以浏览左侧进来打开的工程。

点击文件中的打开，选择数据存储的位置后，点击打开，打开后将显示下面的界面

红色框中的格式一般不需要修改（我认为软件自动识别出了你的数据格式），点击下一步

这个界面中的红色框也不需要修改，直接完成就可以了。

在这个界面中可以修改两项，第一图的类型（混合的，无向的，有向的）

这里我习惯用无向的，因为数据点和连边较多，所以这个根据自己数据选择合适的就好

第二个是可以新建工作区或者添加到当前的工作区

新建工作区会将导入的数据显示在各自的工区内

（我选择是新建工作区，将显示两个工作区）

而添加到当前存在的工作区将所有数据叠加在一起（只显示当时存在的工作区）

成功后，将在界面中心显示网络图（点击图上的节点可以拖动节点的位置）

第二步：美化网络

首先调整网络的布局，可以点击进行试验，选择合适的布局

这张图是选择布局后将上面繁密的点进行了分散操作

下一步将调整节点和边的大小、颜色（可以点击窗口中的外观，一般是直接现在上面）

点击每个图标上面都有文字说明

在红色框出现的颜色位置右键，将出现右边的调色板，根据喜好调整节点颜色，同理边的颜色调整方法也是一样的

选择好颜色后点击0k就可以了，并没有结束，切记一定要点击右下角应用才可以

还可以根据节点的度不同显示深浅不一的节点颜色

边和节点的设置是一样的，只要鼠标点击边就可以改变边的属性了，可以调整边的颜色，还可以根据边的权重打下显示深浅不一的颜色

当然旁边还有颜色组合板供选择

辅助工具：可以点击图标会有相应的文字说明，我标记了几个常用的图标，（可以任意手动修改节点和边，很好！！！）

如果颜色不满意，可以点击下面的灰色图标进行重置

下面介绍一下节点显示标签的设置

点击标签属性后可以选择显示的内容

可以点击数据资料查看节点和边显示的具体数值

可以点击复制列数据（显示标签进行使用，不过一般不需要）

这样就显示出复制的一列了

界面布局可以自己设置，下面是我的界面

这里提示一下，如果点击哪个选项不出现，则可以点击窗口再选择对应的操作名称

这个软件的好处是可以直接点击进行计算网络的一些评估指标（点击运行就OK）

下一步点击预览，在预设置中可以更精细的修改网络图（不显示曲边，节点和边的透明度，节点边的颜色和大小，边框颜色等等）

最后一步将图片输出，同时点击另存为将整个工作区进行保存，下次点击直接进行继续修改（否则将很难再生成一样的网络图）

另存为将保存两个文件

下次点击.gephi文件将进入上次的操作界面接续完善和美化

到此Gephi多有的基本操作都讲述完了，这是我自己在应用中使用的一些，如果还有什么新的发现我将继续补充

当然更希望互相学习，多多留言交流哟！

附我用一周学习的成果（开始很丑-慢慢变好）