2. Transcribing DNA into RNA
Problem
An RNA string is a string formed from the alphabet containing 'A', 'C', 'G', and 'U'.
Given a DNA string tt corresponding to a coding strand, its transcribed RNA string uu is formed by replacing all occurrences of 'T' in tt with 'U' in uu.
Given: A DNA string tt having length at most 1000 nt.
Return: The transcribed RNA string of tt.
Sample Dataset
GATGGAACTTGACTACGTAAATT
Sample Output
GAUGGAACUUGACUACGUAAAUU
# -*- coding: utf-8 -*-
"""
Created on Thu Dec 08 20:33:16 2016
@author: hyl
"""
### 2. Transcribing DNA into RNA ###
import re
d = {'A':0,'T':0,'G':0,'C':0}
f= open('C:\\Users\\hyl\\Desktop\\rosalind_rna.txt')
#print f.readlines()
dna = ''
for line in f.readlines():
#line = line.rstrip()
dna += line
rnaseq = re.sub("T","U",dna,count =0)
print rnaseq
2. Transcribing DNA into RNA的更多相关文章
- 02 Transcribing DNA into RNA
Problem An RNA string is a string formed from the alphabet containing 'A', 'C', 'G', and 'U'. Given ...
- 1.Counting DNA Nucleotides
Problem A string is simply an ordered collection of symbols selected from some alphabet and formed i ...
- DNA sequence open reading frames (ORFs) | DNA序列的开放阅读框ORF预测
常见的ORF预测工具 Open Reading Frame Finder- NCBI ORF Finder - SMS OrfPredictor - YSU 基本概念 开放阅读框(英语:Open r ...
- 单细胞RNA测序技术之入门指南
单细胞RNA测序技术之入门指南 [字体: 大 中 小 ] 时间:2018年09月12日 来源:生物通 编辑推荐: 在这个飞速发展的测序时代,DNA和RNA测序已经逐渐成为“实验室中的家常菜”.若要 ...
- 解读生命密码的基本手段 ——DNA测序技术的前世今生
解读生命密码的基本手段 ——DNA测序技术的前世今生 任鲁风 于军 (中国科学院基因组科学及信息重点实验室,北京基因组研究所) DNA(脱氧核糖核酸)和RNA(核糖核酸)是生命体的两种最基本组成物质 ...
- RNA sequence单分子直测技术
生命组学 按照功能分类遗传物质,可能的分类有系统流.操作流.平衡流等等.下面是使用该理论解释DNA与RNA的关系: DNA和RNA有很大不同,DNA存储遗传信息,作为生命活动的最内核物质,如同操作系统 ...
- SAGE|DNA微阵列|RNA-seq|lncRNA|scripture|tophat|cufflinks|NONCODE|MA|LOWESS|qualitile归一化|permutation test|SAM|FDR|The Bonferroni|Tukey's|BH|FWER|Holm's step-down|q-value|
生物信息学-基因表达分析 为了丰富中心法则,研究人员使用不断更新的技术研究lncRNA的方方面面,其中技术主要是生物学上的微阵列芯片技术和表达数据分析方法,方方面面是指lncRNA的位置特征. Bac ...
- 样本、文库、重复、lane、run - 二代测序原理及名词解释
参考: 独占鳌头的Illumina仪器(二代测序篇) HiSeq2000测序原理.流程与仪器 NGS文库制备的方法比较[心得点评] 各种测序文库构建方式 样本:就是待测的DNA.RNA或蛋白序列,样本 ...
- stanford NLP学习笔记3:最小编辑距离(Minimum Edit Distance)
I. 最小编辑距离的定义 最小编辑距离旨在定义两个字符串之间的相似度(word similarity).定义相似度可以用于拼写纠错,计算生物学上的序列比对,机器翻译,信息提取,语音识别等. 编辑距离就 ...
随机推荐
- #define DELAY_ONE_MICROSECOND (-10) 时间是负数的原因
以下摘自DOOM的博文<内核同步对象> http://blog.csdn.net/lqk1985/article/details/2541867 “最后一个参数&timeout是一 ...
- python datetime处理时间
原文:http://blog.csdn.net/JGood/article/details/5457284 Python提供了多个内置模块用于操作日期时间,像calendar,time,datetim ...
- <java基础学习>RE 基础语法(2)
Java Modifiers(java修饰符): Like other languages, it is possible to modify classes, methods, etc., by u ...
- 用php获取本周,上周,本月,上月,本季度日期的代码
echo date("Ymd",strtotime("now")), "\n"; echo date("Ymd",str ...
- centos6环境下安装tmux
Install tmux on CentOS 6:1. sudo rpm -ivh http://pkgs.repoforge.org/rpmforge-release/rpmforge-releas ...
- jQuery是什么?
jQuery就是javascript的一个库,把我们常用的一些功能进行了封装,方便我们来调用,提高我们的开发效率. 极大地简化了 JavaScript 编程. Javascipt跟jQuery的区别: ...
- POJ 3683 Priest John's Busiest Day (2-SAT)
题意:有n对新人要在同一天结婚.结婚时间为Ti到Di,这里有时长为Si的一个仪式需要神父出席.神父可以在Ti-(Ti+Si)这段时间出席也可以在(Di-Si)-Si这段时间.问神父能否出席所有仪式,如 ...
- 从C++转向Java的第一课
序:计算机语言的学习,最快捷的方法是从一种语言映射到另一种语言.Java和C++作为最通用的面相对象高级语言,不论从语法或者编程上都极具相似性和可效仿行,这里的可效仿包括——语法理解可效仿和编程规范可 ...
- NUBWO/狼博旺 NO-3000台式电脑耳机头戴式游戏电竞语音耳麦带话筒
产品名称:NUBWO/狼博旺 NO-3000 套餐类型: 官方标配 颜色分类: 蓝色耳机(发光) 黑蓝7.1声道USB 黑色 黑蓝色(发光) 黑蓝色 黑蓝单插孔 白色(发光) 白色 佩戴方式: 头戴护 ...
- UE4 Android相对路径转绝对路径方法笔记
在windows端用FPaths::ConvertRelativePathToFull可以将相对路径转成绝对路径. 在Andoird端,就麻烦些.可模仿UE4源码中AndroidFile.Cpp转换相 ...