首先介绍下两种方法:

一、本地分析

1、在STRING数据库下载人的互作文件,如下图,第一个文件

https://string-db.org/cgi/download.pl?sessionId=HGrreq5g8nLI&species_text=Homo+sapiens

2、在本地电脑上(linux),用grep 检索该蛋白的互作关系:ENSP00000359708 ,发现结果是空

二、直接到STRING数据库进行互作关系分析

1、检索网址

(1)这个支持多个基因ID或者蛋白ID

https://string-db.org/cgi/input.pl?sessionId=HGrreq5g8nLI&input_page_active_form=multiple_identifiers 
(2)这个是单个基因ID或者蛋白ID
https://string-db.org/cgi/input.pl?sessionId=HGrreq5g8nLI&input_page_active_form=single_identifier 
 
2、输入蛋白ID: ENSP00000359708 ,检索结果如下,该蛋白对应的基因是FHL1 ,点击该节点,会显示该基因与其他基因发生互作关系的蛋白,
发现是这个蛋白:ENSP00000377710 ,这个蛋白和前边那个蛋白是什么关系呢?

3、通过检索,发现他们同属于FHL1蛋白家族,这样就解释了,为什么在网站中可以检索到了,因为网站展示的基因间的互作,只要改基因对应的蛋白家族中任何一个蛋白与其他基因对应的蛋白家族有互作,就会把该互作关系检索出来。

https://asia.ensembl.org/Homo_sapiens/Gene/Family?family=PTHR24208_SF26;g=ENSG00000022267;r=X:136146702-136211359

下载STRING数据库检索互作关系结果为空,但是在STRING网站却能检索出互作关系,为什么呢???关键词用的是蛋白ID(ENSP开头)的更多相关文章

  1. (0.2.2)如何下载mysql数据库(二进制、RPM、源码、YUM源)

    目录 1.基于Linux平台的Mysql项目场景介绍 2.mysql数据库运行环境准备-最优配置 3.如何下载mysql数据库 3.1. 二进制文件包 3.2.RPM文件 3.3.源码包 3.4.yu ...

  2. DolphinScheduler 功能开发:⼯作流级别任务空跑(后端),测试工作流是否正确执行...

    点击上方 蓝字关注我们 ✎ 编 者 按 在今年由中国科学院软件研究所主办的开源软件所供应链点亮计划-开源之夏活动中,有不少小伙伴提交了关于 DolphinScheduler 的项目,本期是来自成都信息 ...

  3. 阿里巴巴开源项目:分布式数据库同步系统otter(解决中美异地机房) - agapple - ITeye技术网站

    阿里巴巴开源项目:分布式数据库同步系统otter(解决中美异地机房) - agapple - ITeye技术网站 阿里巴巴开源项目:分布式数据库同步系统otter(解决中美异地机房)

  4. java中String是对象还是类?详解java中的String

    有很多人搞不懂对象和类的定义.比如说java中String到底是对象还是类呢? 有人说String 既可以说是类,也可以说是对象. 其实他这么说也没问题, 类和对象其实都是一个抽象的概念. 我们可以把 ...

  5. laravel查询数据库获取结果如何判断是否为空?

    laravel 查询数据库获取结果如何判断是否为空? 大家使用的场景是这样的: 1 $users = DB::table('users')->where('id',$id)->get(); ...

  6. Java String类相关知识梳理(含字符串常量池(String Pool)知识)

    目录 1. String类是什么 1.1 定义 1.2 类结构 1.3 所在的包 2. String类的底层数据结构 3. 关于 intern() 方法(重点) 3.1 作用 3.2 字符串常量池(S ...

  7. mysql 5.7数据库支持emoji符号但是程序总算报错Incorrect string value: '\xF0\x9F\x98\x84\xF0\x9F...' for column ...

    1.线上碰到个问题,端上切换搜狗输入法后,原来限制的表情符号还能输入.数据库使用的是5.7.22版本的,刚开始以为数据库不支持表情符号导致的,但是看了线上的数据库以及字段,都是支持的. show va ...

  8. mysql 保存emoji时报,数据库报错:Caused by: java.sql.SQLException: Incorrect string value: '\xF0\x9F\x98\x82\xF0\x9F...' for column 'review' at row 1

    错误原因:我们可以看到错误提示中的字符0xF0 0x9F 0x98 0x84 ,这对应UTF-8编码格式中的4字节编码(UTF-8编码规范).正常的汉字一般不会超过3个字节,为什么为出现4个字节呢?实 ...

  9. 下载 mysql 数据库 的步骤 完整版

    1. 官网(点这里)上下载 2. 3. 4. 5. 6. 7.

随机推荐

  1. .NetCore集成Dapr踩坑经历

    该篇内容由个人博客点击跳转同步更新!转载请注明出处 前言 之前自己有个core2.2的项目一直是用的Surging作为微服务框架的,后来了解到了Dapr,发现比较轻量级,开发部署等也非常方便,故将自己 ...

  2. DEVOPS技术实践_12:创建持续集成的管道

    持续集成不仅包含了Jenkins或者相关其它的CI工具,也包含了包含代码如何控制,采用的什么分支策略等.不同的组织可能采用不同的类型的策略来完成CI,策略类型和项目的类型的有很大的关系. 一 分支策略 ...

  3. QTableView 控件的简单使用

    QTableView类提供了一个表视图的默认模型/视图实现. 一个QTableView实现一个表视图,它显示来自一个模型的项目.这个类用于提供以前由QTable类提供的标准表,但是使用Qt的模型/视图 ...

  4. 看完这篇HTTP,跟面试官扯皮就没问题了

    我是一名程序员,我的主要编程语言是 Java,我更是一名 Web 开发人员,所以我必须要了解 HTTP,所以本篇文章就来带你从 HTTP 入门到进阶,看完让你有一种恍然大悟.醍醐灌顶的感觉. 最初在有 ...

  5. 开启我的python之路,第一节,git版本管理工具

    git版本管理工具 一.git功能与结构 1.Git是分布式管理系统,服务端和客户端都有版本控制功能,都能进行代码的提交,合并 2.git分为工作区,暂存区,本地仓库和远程仓库 二.git安装与查看 ...

  6. 3maven常用命令和配置依赖

    依赖: 例:spring-context.jar 依赖 spring-aop.jar... A中的某些类 需要使用B中的某些类,则称为A依赖于B 在maven项目中,如果要使用 一个当时存在的Jar或 ...

  7. 【一起学源码-微服务】Hystrix 源码一:Hystrix基础原理与Demo搭建

    说明 原创不易,如若转载 请标明来源! 欢迎关注本人微信公众号:壹枝花算不算浪漫 更多内容也可查看本人博客:一枝花算不算浪漫 前言 前情回顾 上一个系列文章讲解了Feign的源码,主要是Feign动态 ...

  8. Linux安装python和更新pip

    一.安装python 1.安装依赖包 1).安装gcc 通过gcc --version 查看,若没有则安装gcc yum -y install gcc 2).安装其他依赖包 yum -y instal ...

  9. Django CBV方法装饰器

    from django.utils.decorators import method_decorator 1.在post 或 get方法 添加 @method_decorator(装饰器) 2.给类添 ...

  10. session跨域丢失问题

    配置一个 filter package com.psm.filter; import javax.servlet.*; import javax.servlet.http.HttpServletReq ...