下载STRING数据库检索互作关系结果为空,但是在STRING网站却能检索出互作关系,为什么呢???关键词用的是蛋白ID(ENSP开头)
首先介绍下两种方法:
一、本地分析
1、在STRING数据库下载人的互作文件,如下图,第一个文件
https://string-db.org/cgi/download.pl?sessionId=HGrreq5g8nLI&species_text=Homo+sapiens

2、在本地电脑上(linux),用grep 检索该蛋白的互作关系:ENSP00000359708 ,发现结果是空
二、直接到STRING数据库进行互作关系分析
1、检索网址
(1)这个支持多个基因ID或者蛋白ID
https://string-db.org/cgi/input.pl?sessionId=HGrreq5g8nLI&input_page_active_form=multiple_identifiers (2)这个是单个基因ID或者蛋白ID
https://string-db.org/cgi/input.pl?sessionId=HGrreq5g8nLI&input_page_active_form=single_identifier
3、通过检索,发现他们同属于FHL1蛋白家族,这样就解释了,为什么在网站中可以检索到了,因为网站展示的基因间的互作,只要改基因对应的蛋白家族中任何一个蛋白与其他基因对应的蛋白家族有互作,就会把该互作关系检索出来。

下载STRING数据库检索互作关系结果为空,但是在STRING网站却能检索出互作关系,为什么呢???关键词用的是蛋白ID(ENSP开头)的更多相关文章
- (0.2.2)如何下载mysql数据库(二进制、RPM、源码、YUM源)
目录 1.基于Linux平台的Mysql项目场景介绍 2.mysql数据库运行环境准备-最优配置 3.如何下载mysql数据库 3.1. 二进制文件包 3.2.RPM文件 3.3.源码包 3.4.yu ...
- DolphinScheduler 功能开发:⼯作流级别任务空跑(后端),测试工作流是否正确执行...
点击上方 蓝字关注我们 ✎ 编 者 按 在今年由中国科学院软件研究所主办的开源软件所供应链点亮计划-开源之夏活动中,有不少小伙伴提交了关于 DolphinScheduler 的项目,本期是来自成都信息 ...
- 阿里巴巴开源项目:分布式数据库同步系统otter(解决中美异地机房) - agapple - ITeye技术网站
阿里巴巴开源项目:分布式数据库同步系统otter(解决中美异地机房) - agapple - ITeye技术网站 阿里巴巴开源项目:分布式数据库同步系统otter(解决中美异地机房)
- java中String是对象还是类?详解java中的String
有很多人搞不懂对象和类的定义.比如说java中String到底是对象还是类呢? 有人说String 既可以说是类,也可以说是对象. 其实他这么说也没问题, 类和对象其实都是一个抽象的概念. 我们可以把 ...
- laravel查询数据库获取结果如何判断是否为空?
laravel 查询数据库获取结果如何判断是否为空? 大家使用的场景是这样的: 1 $users = DB::table('users')->where('id',$id)->get(); ...
- Java String类相关知识梳理(含字符串常量池(String Pool)知识)
目录 1. String类是什么 1.1 定义 1.2 类结构 1.3 所在的包 2. String类的底层数据结构 3. 关于 intern() 方法(重点) 3.1 作用 3.2 字符串常量池(S ...
- mysql 5.7数据库支持emoji符号但是程序总算报错Incorrect string value: '\xF0\x9F\x98\x84\xF0\x9F...' for column ...
1.线上碰到个问题,端上切换搜狗输入法后,原来限制的表情符号还能输入.数据库使用的是5.7.22版本的,刚开始以为数据库不支持表情符号导致的,但是看了线上的数据库以及字段,都是支持的. show va ...
- mysql 保存emoji时报,数据库报错:Caused by: java.sql.SQLException: Incorrect string value: '\xF0\x9F\x98\x82\xF0\x9F...' for column 'review' at row 1
错误原因:我们可以看到错误提示中的字符0xF0 0x9F 0x98 0x84 ,这对应UTF-8编码格式中的4字节编码(UTF-8编码规范).正常的汉字一般不会超过3个字节,为什么为出现4个字节呢?实 ...
- 下载 mysql 数据库 的步骤 完整版
1. 官网(点这里)上下载 2. 3. 4. 5. 6. 7.
随机推荐
- 【题解】Leyni的汽车比赛
[题解]Leyni的汽车比赛 HRBUST - 1404 思维题?居然被我凑出来了 这种图论题先设这样一个状态 \[ ans(i,j,f) \] 表示从i到j,最多使用f个交通工具的最短路 转移的话, ...
- $HDU1846\ Brave\ Game$ 博弈论
正解:博弈论 解题报告: 传送门! 巴什博奕板子题鸭$QwQ$ 就有个结论,是说当$(m+1)\mid n$时先手必败,否则必胜 这个瞎证明一下就能出来 就考虑当$(m+1)\mid 1$时,若先手取 ...
- 语言篇:Java环境
语言篇:Java环境 Java是什么? Java 是一项用于开发应用程序的技术语言,可以让 Web 变得更有意思和更实用.使用 Java 可以玩游戏.上载照片.联机聊天以及参与虚拟体验,并能够使用联机 ...
- Markdown破解及汉化
首先,附上用到的资源链接: 链接:https://pan.baidu.com/s/1ULvvCPcCv_P3KyD9ajXUjQ 提取码:5fkb 第一步 直接解压就可以,解压后运行该程序,会出现下图 ...
- 「CodeForces 476A」Dreamoon and Stairs
Dreamoon and Stairs 题意翻译 题面 DM小朋友想要上一个有 \(n\) 级台阶的楼梯.他每一步可以上 \(1\) 或 \(2\) 级台阶.假设他走上这个台阶一共用了 \(x\) 步 ...
- SQL练习题(一)
目录 题目一:交换性别(简单) 实现思路 提交代码 题目二:连续出现的数字(中等) 实现思路 方式一 方式二 提交代码 方式一 方式二 题目三:换座位(中等) 实现思路 方式一 方式二 提交代码 方式 ...
- vmware workstation12在安装VMware tools时出现问题:A previous installation of VMware Tools has been detected 解决
win10安装的vmware workstation12在安装VMware tools时出现问题: root@lc:/root/vmware-tools-distrib# ./vmware-insta ...
- 简单快速破解IDEA
====================================2019.09.16更新==================================== 可以直接去掉第三步,直接在激活 ...
- 小程序和wepy做循环渲染如何点击拿到相对应的值
数据和其他的就忽略,简单上手,wepy的for渲染方式改成对应的就行,传参触发不用改 <view wx:for="{{list}}"> {{item.title}} & ...
- 程序员如何才能跨过高级级别,譬如腾讯T3.1/阿里P7
首先自我介绍下自己履历:5年前过了腾讯的T3.2,最近又在1年多前过了阿里的P8,目前在B站. **腾讯** 在腾讯我是T2.1社招一般水平入职的,3年后到了T3.2.中间是经历过几个转变:刚来的半年 ...