参考:

Lander-Waterman Model

这个模型是鸟枪法测序和基因组装的最基本的理论模型,它揭示了测序深度与覆盖度之间的关系。

该模型回答了一个最基本的问题:How many reads to we need to be sure we cover the whole genome?

Genome Sequencing - PPT

Chapter 5.1. Lander-Waterman Statistics for Shotgun Sequencing

这个模型是用来做基因组装的。
鸟枪法做了shotgun后,每个碱基被检测的概率是很小的,碱基长度长,
即 p小,n长,二次分布就近似为泊松分布。
在这个理论下,碱基期望深度,(就是每个碱基被检测的次数)为泊松分布的期望值u,基因组覆盖率为1-exp(-u)。

Lander-Waterman model的更多相关文章

  1. Evaluate|GC content|Phred|BAC|heterozygous single nucleotide polymorphisms|estimate genome size|

    (Evaluate):检查reads,可使用比对软件:使用SOAPaligner重新排列:采用massively parallel next-generation sequencing technol ...

  2. Spring Boot笔记一

    Spring Boot 入门 Spring Boot 简介 > 简化Spring应用开发的一个框架:> 整个Spring技术栈的一个大整合:> J2EE开发的一站式解决方案: 微服务 ...

  3. 【疯狂造轮子-iOS】JSON转Model系列之二

    [疯狂造轮子-iOS]JSON转Model系列之二 本文转载请注明出处 —— polobymulberry-博客园 1. 前言 上一篇<[疯狂造轮子-iOS]JSON转Model系列之一> ...

  4. 【疯狂造轮子-iOS】JSON转Model系列之一

    [疯狂造轮子-iOS]JSON转Model系列之一 本文转载请注明出处 —— polobymulberry-博客园 1. 前言 之前一直看别人的源码,虽然对自己提升比较大,但毕竟不是自己写的,很容易遗 ...

  5. 详解树莓派Model B+控制蜂鸣器演奏乐曲

    步进电机以及无源蜂鸣器这些都需要脉冲信号才能够驱动,这里将用GPIO的PWM接口驱动无源蜂鸣器弹奏乐曲,本文基于树莓派Mode B+,其他版本树莓派实现时需参照相关资料进行修改! 1 预备知识 1.1 ...

  6. 【AutoMapper官方文档】DTO与Domin Model相互转换(上)

    写在前面 AutoMapper目录: [AutoMapper官方文档]DTO与Domin Model相互转换(上) [AutoMapper官方文档]DTO与Domin Model相互转换(中) [Au ...

  7. 拨开迷雾,找回自我:DDD 应对具体业务场景,Domain Model 到底如何设计?

    写在前面 除了博文内容之外,和 netfocus 兄的讨论,也可以让你学到很多(至少我是这样),不要错过哦. 阅读目录: 迷雾森林 找回自我 开源地址 后记 毫无疑问,领域驱动设计的核心是领域模型,领 ...

  8. 使用mybatis-generator在自动生成Model类和Mapper文件

    使用mybatis-generator插件可以很轻松的实现mybatis的逆向工程,即,能通过表结构自动生成对应的java类及mapper文件,可以大大提高工作效率,并且它提供了很多自定义的设置可以应 ...

  9. “RazorEngine.Templating.TemplateParsingException”类型的异常在 RazorEngine.NET4.0.dll 中发生,但未在用户代码中进行处理 其他信息: Expected model identifier.

    这个问题是由于在cshtml中 引用了model这个单词  它可能和Model在解析时有冲突. 解决方法:把model换成别的单词就可以了.

  10. QT内省机制、自定义Model、数据库

    本文将介绍自定义Model过程中数据库数据源的获取方法,我使用过以下三种方式获取数据库数据源: 创建 存储对应数据库所有字段的 结构体,将结构体置于容器中返回,然后根据索引值(QModelIndex) ...

随机推荐

  1. $.Ajax({});方法使用 返回json格式 string格式

    //Json格式 $.ajax({ url: url + "?action=Save1", type: "post", dataType: "json ...

  2. 对jquery分页的升级

    以前写的分页用了好久了,但是分页时除了传页面外有时还要传一些其它参数,以前操作时要把传的参数放到隐藏hidden中,分页时在取出来,这样比较麻烦,今天无事,重新包装了一下 直接上代码吧 css用了bo ...

  3. h5视频上传之前端视频压缩研究

    今天领导接到一个h5上传手机视频的需求,主要是要看用户在这个视频中有没有完成某个任务,比如投篮进了几个球. 但是由于手机拍摄的视频文件大小有点大,直接上传的话,用户流量顶不住,而且特别耗时,在这样的情 ...

  4. 移植mbed到目标板

    上一篇我们导出了mbed基本环境到mdk,根据实际目标还需要做些修改.手头的硬件是ebox平台,芯片STM32F103C8T6,调试器jlink,默认使用UART1. 导出时所选择的NUCLEO-F1 ...

  5. 2015最新德淘W家(Windeln.de)新人优惠码wcode0520,赠1000积分,可抵10欧元

    德淘W家(Windeln.de)网址:www.windeln.de 德淘W家(Windeln.de)的新人优惠码wcode0520 第一次购物结账时输入wcode0520,提交订单,1000积分划入你 ...

  6. js Date 关于时间获取问题

    var date1 = new Date(); var timeFormat = { 'yyyy-mm-dd': date1 .toJSON().split('T')[0], //"2017 ...

  7. filter(滤镜) 属性 内部资料 请勿转载 谢谢合作

    Filter 描述 none 默认值,没有效果. blur(px) 给图像设置高斯模糊."radius"一值设定高斯函数的标准差,或者是屏幕上以多少像素融在一起, 所以值越大越模糊 ...

  8. 大白的webservice

    1.什么是web服务: web服务是一种可以用来解决跨网络应用集成问题的开发模式,这种模式为实现"软件即服务"提供了技术保障. 2.web服务的三个核心 (SOAP,WSDL,UD ...

  9. 向STM32 CUBE MX 生成的工程里移植stemwin

    我参考这个文章做的: http://bbs.armfly.com/read.php?tid=1678 这次添加的是没有os的版本 另外跟用不用hal库没关系 1. keil自带了emwin 2. 用c ...

  10. 在现有的图像处理软件中融合dxf格式输出

    在现有的图像处理软件中融合dxf格式输出 dxf格式是autocade的支持格式.如果将现有图像识别的结果导出到dxf格式,就能够使用autocad的强大功能进行后续处理. dxf的格式比较复杂,开源 ...