参考：

Lander-Waterman Model

这个模型是鸟枪法测序和基因组装的最基本的理论模型，它揭示了测序深度与覆盖度之间的关系。

该模型回答了一个最基本的问题：How many reads to we need to be sure we cover the whole genome?

Genome Sequencing - PPT

Chapter 5.1. Lander-Waterman Statistics for Shotgun Sequencing

这个模型是用来做基因组装的。
鸟枪法做了shotgun后，每个碱基被检测的概率是很小的，碱基长度长，
即 p小，n长，二次分布就近似为泊松分布。
在这个理论下，碱基期望深度，（就是每个碱基被检测的次数）为泊松分布的期望值u，基因组覆盖率为1-exp(-u)。

Lander-Waterman model的更多相关文章

  1. Evaluate|GC content|Phred|BAC|heterozygous single nucleotide polymorphisms|estimate genome size|

    (Evaluate):检查reads,可使用比对软件:使用SOAPaligner重新排列:采用massively parallel next-generation sequencing technol ...

  2. Spring Boot笔记一

    Spring Boot 入门 Spring Boot 简介 > 简化Spring应用开发的一个框架:> 整个Spring技术栈的一个大整合:> J2EE开发的一站式解决方案: 微服务 ...

  3. 【疯狂造轮子-iOS】JSON转Model系列之二

    [疯狂造轮子-iOS]JSON转Model系列之二 本文转载请注明出处 —— polobymulberry-博客园 1. 前言 上一篇<[疯狂造轮子-iOS]JSON转Model系列之一> ...

  4. 【疯狂造轮子-iOS】JSON转Model系列之一

    [疯狂造轮子-iOS]JSON转Model系列之一 本文转载请注明出处 —— polobymulberry-博客园 1. 前言 之前一直看别人的源码,虽然对自己提升比较大,但毕竟不是自己写的,很容易遗 ...

  5. 详解树莓派Model B+控制蜂鸣器演奏乐曲

    步进电机以及无源蜂鸣器这些都需要脉冲信号才能够驱动,这里将用GPIO的PWM接口驱动无源蜂鸣器弹奏乐曲,本文基于树莓派Mode B+,其他版本树莓派实现时需参照相关资料进行修改! 1 预备知识 1.1 ...

  6. 【AutoMapper官方文档】DTO与Domin Model相互转换（上）

    写在前面 AutoMapper目录: [AutoMapper官方文档]DTO与Domin Model相互转换(上) [AutoMapper官方文档]DTO与Domin Model相互转换(中) [Au ...

  7. 拨开迷雾，找回自我：DDD 应对具体业务场景，Domain Model 到底如何设计？

    写在前面 除了博文内容之外,和 netfocus 兄的讨论,也可以让你学到很多(至少我是这样),不要错过哦. 阅读目录: 迷雾森林 找回自我 开源地址 后记 毫无疑问,领域驱动设计的核心是领域模型,领 ...

  8. 使用mybatis-generator在自动生成Model类和Mapper文件

    使用mybatis-generator插件可以很轻松的实现mybatis的逆向工程,即,能通过表结构自动生成对应的java类及mapper文件,可以大大提高工作效率,并且它提供了很多自定义的设置可以应 ...

  9. “RazorEngine.Templating.TemplateParsingException”类型的异常在 RazorEngine.NET4.0.dll 中发生，但未在用户代码中进行处理 其他信息: Expected model identifier.

    这个问题是由于在cshtml中 引用了model这个单词  它可能和Model在解析时有冲突. 解决方法:把model换成别的单词就可以了.

  10. QT内省机制、自定义Model、数据库

    本文将介绍自定义Model过程中数据库数据源的获取方法,我使用过以下三种方式获取数据库数据源: 创建 存储对应数据库所有字段的 结构体,将结构体置于容器中返回,然后根据索引值(QModelIndex) ...

随机推荐

  1. New Concept English 1-10

    Lesson 10 The loss of Titanic The great ship, Titanic, sailed for New York from Southampton on April ...

  2. hadoop 多表join：Map side join及Reduce side join范例

    最近在准备抽取数据的工作.有一个id集合200多M,要从另一个500GB的数据集合中抽取出所有id集合中包含的数据集.id数据集合中每一个行就是一个id的字符串(Reduce side join要在每 ...

  3. html5，单击显示详细信息

    <details open="">    <summary>点击率</summary>        <p>详细信息</p&g ...

  4. “error LNK2019: 无法解析的外部符号”之分析

    最近在用VS 2008开发,初学遇到不少问题,最头疼的问题之一就是:LNK2019. 百度一下讲的并不够全面,反正都没解决我的问题. error LNK2019问题在VC 6.0中是error LNK ...

  5. SOSO街景地图 API （Javascript）开发教程（1）- 街景

    SOSO街景地图 Javascript API 干什么用的? 你想在网页里嵌入个地图,就需要它了! 另外,它还支持:地点搜索.周边/附近查询.地图标注.公交/驾车路线规划.地理坐标与地址相互转换.地理 ...

  6. JavaScript笔记 Function

    在JavaScript中方法由两部分组成: 方法名和方法体. JavaScript中的方法跟其他传统面向对象语言不同,它跟普通的变量没有区别,唯一不同点是它是Function对象,因此它会有一些Fun ...

  7. Tween.js的使用示例

    可参考:http://www.htmleaf.com/jQuery/Layout-Interface/201501271284.html 官方文档:https://github.com/tweenjs ...

  8. Linux中环境变量文件及配置

    Linux中环境变量文件及配置   一.环境变量文件介绍 转自:http://blog.csdn.net/cscmaker/article/details/7261921 Linux中环境变量包括系统 ...

  9. C# 利用反射

    .NET基础篇——反射的奥妙 C#获取实体类属性名和值 | 遍历类对象 c#通过反射获取类上的自定义特性 C#利用反射+特性实现简单的实体映射数据库操作类

  10. 如何：在 ASP.NET 网页中检测浏览器类型

    https://msdn.microsoft.com/zh-cn/library/3yekbd5b(VS.80).aspx private void Button1_Click(object send ...