JELLYFISH - Fast, Parallel k-mer Counting for DNA
kmer分析其实是非常耗费计算资源的,如果我们自己写脚本来分析kmer的话,首先要将所有的序列打断成一定长度的kmer,然后将所有的kmer存储起来,最后统计每个kmer出现的频率,或者统计出现指定次数的kmer一共有多少个。
为了节省资源,我们可以使用 Jellyfish 这个现成的软件来分析。
JELLYFISH - Fast, Parallel k-mer Counting for DNA
Jellyfish mer counter (原来和MaSuRCA是一个开发单位,我说怎么这么眼熟呢)
JELLYFISH - Fast, Parallel k-mer Counting for DNA的更多相关文章
- [Agc005D]K Perm Counting
[Agc005D] K Perm Counting Description 糟糕爷特别喜爱排列.他正在构造一个长度为N的排列.但是他特别讨厌正整数K.因此他认为一个排列很糟糕,当且仅当存在至少一个i( ...
- AGC 005 D - ~K Perm Counting
D - ~K Perm Counting 链接 题意: 求有多少排列对于每个位置i都满足$|ai−i|!=k$.n<=2000 分析: 容斥+dp. $answer = \sum\limits_ ...
- 题解-Atcoder_agc005D ~K Perm Counting
Problem AtCoder-agc005D 题意概要:给出\(n,k\),求合法的排列个数,其中合法定义为任何数字所在位置与自身值差的绝对值不为\(k\)(即求排列\(\{A_i\}\),使得\( ...
- AGC 005D.~K Perm Counting(容斥 DP 二分图)
题目链接 \(Description\) 给定\(n,k\),求 满足对于所有\(i\),\(|a_i-i|\neq k\)的排列的个数. \(2\leq n\leq 2000,\quad 1\leq ...
- [AGC005D] ~K Perm Counting [dp]
题面 传送门 思路 首先可以明确的一点是,本题中出现不满足条件的所有的数,都是分组的 只有模$K$意义下相同的数之间才会出现不满足条件的情况,而且仅出现在相邻的情况 那么我们考虑把这个性质利用起来 我 ...
- [AT2062] ~K Perm Counting
AT2602 , Luogu 求对于 \(n\) 个数的排列 , 有多少种方案满足对于所有的 \(i\) , \(|P_i - i| != K\) , 答案对 \(924844033\) 取模 . \ ...
- 【agc005d】~K Perm Counting
题目大意 求有多少中1~n的排列,使得\(abs(第i个位置的值-i)!=k\) 解题思路 考虑容斥,\(ans=\sum_{i=0}^{n}(-1)^ig[i](n-i)!(g[i]表示至少有i个位 ...
- GNU Parallel Tutorial
GNU Parallel Tutorial Prerequisites Input sources A single input source Multiple input sources Linki ...
- Fast Paxos 和 Paxos的区别
详见:http://blog.yemou.net/article/query/info/tytfjhfascvhzxcyt373 自从Lamport在1998年发表Paxos算法后,对Paxos的各种 ...
随机推荐
- meta 如何写
阻止手机号加下划线,可拨打:<meta name="format-detection" content="telephone=no" /> (io ...
- 【转】Java学习:Java中的线程之线程间的通信
hello各位小伙伴 今天我们来搞一下 线程之间的通信 ( • ̀ω•́ )✧ 让线程按照我们的想法来执行 两个线程间的通信 这是我们之前的线程. 执行效果:谁抢到资源,谁运行~ 实现线程交替执行: ...
- 【百度统计】设置页面元素点击事件转化pv、uv
html元素点击事件内添加代码:_hmt.push(['_trackEvent', category, action, opt_label, opt_value]); 1. '_trackEvent' ...
- python 代码覆盖率 coverage用法
先装coverage: D:\test_python\e8_test>pip install coverageCollecting coverage Downloading https://f ...
- 火狐使用Ctrl新开窗口不生效
使用window.open新开页面,火狐浏览器无法使用Ctrl新开窗口后页面停留在当前页面,兼容性问题,使用<a>或者<router-link>标签即可解决 --贡献者:毛毛
- [目前最火的前端开发框架]React组件的应用分析
React组件 一.如何创建React组件 方式一:React.createClass 用 React.createClass 构建组件是 React 最传统.也是兼容最好的方法. const But ...
- JavaScript 表单验证 案例
JavaScript 表单验证 案例 版权声明:未经授权,严禁转载! 编写 HTML 文件,搭建主体界面 <html> <head> <meta charset=&q ...
- 20145333茹翔 Exp5 MS11_050
20145333茹翔 Exp5 MS11_050 实验过程 使用命令msfconsole命令进入控制台 使用命令search ms11_050查看针对MS11_050漏洞的攻击模块 确定相应模块名之后 ...
- 【angular2+typeScript+ng-zorro】Carousel 走马灯的左右方向控件实现
ng-zorro Carousel 走马灯的左右方向控件实现 ng-zorro框架的走马灯本身还没有左右方向控件的实现,作者只是在文档中(0.6x)中曝出几个方法接口,如图: 实现: 在根compon ...
- Python3基础 bool类型变量赋值
Python : 3.7.0 OS : Ubuntu 18.04.1 LTS IDE : PyCharm 2018.2.4 Conda ...