Biopython 安装使用

Biopython 官网：https://biopython.org/

安装 Biopython  https://biopython.org/wiki/Download

可以使用 pip 进行安装， 注意有时需要使用管理员权限，即管理员打开 cmd

pip install biopython

验证安装是否成功

Biopython 官方教程

https://biopython.org/wiki/Documentation

Biopython 的 API 文档

http://biopython.org/DIST/docs/api/

读取并输出 fastq 文件

from Bio import SeqIO
bc_file = opne("bc_file.fastq", "a+")
for record in SeqIO.parse(fastq_file, "fastq"):
            fastq_bc = id_bc[record.id]
            print(record.format("fastq"), file = bc_file, end = "")
bc_file.close()