什么是soft-clipped reads

当基因组发生某一段的缺失，或转录组的剪接，在测序过程中，横跨缺失位点及剪接位点的reads回帖到基因组时，一条reads被切成两段，匹配到不同的区域，这样的reads叫做soft-clipped reads，这些reads对于鉴定染色体结构变异及外源序列整合具有重要作用。

什么是multi-hits reads

由于大部分测序得到的reads较短，一个reads能够匹配到基因组多个位置，无法区分其真实来源的位置。一些工具根据统计模型，如将这类reads分配给reads较多的区域。

理解soft-clipped reads的更多相关文章

  1. Bowtie2的安装与使用

    Bowtie2的安装与使用  2017-06-15 18:58:52     342     0     0 Bowtie2用来快速比对短reads(50-100bp)与参考基因组,与常规的比对软件不 ...

  2. bowtie2用法

    bowtie2的功能:短序列的比对 用法:bowtie2 [options]* -x <bt2-idx> {-1 <m1> -2 <m2> | -U <r&g ...

  3. shell十三问

    1) 为何叫做 shell ?在介绍 shell 是甚幺东西之前,不妨让我们重新检视使用者与计算机系统的关系:图(FIXME)我们知道计算机的运作不能离开硬件,但使用者却无法直接对硬件作驱动,硬件的驱 ...

  4. 转:shell 经典, shell 十三问

      原文链接:http://blog.csdn.net/freexploit/article/details/626660 我在 CU 的日子并不长,有幸在 shell 版上与大家结缘.除了跟众前辈学 ...

  5. linux shell中的单引号与双引号的区别(看完就不会有引号的疑问了)(转)

    tips: ============================= IFS - LINUX字段分隔符,内部字段分隔符 IFS(Internal Field Seperator)在Linux的she ...

  6. <转>shell经典,shell十三问

    (注:关于变量概念,我们留到下两章才跟大家说明.) 好了,更多的关于 command line 的格式,以及 echo 命令的选项,就请您自行多加练习.运用了... ----------------- ...

  7. [转帖]""(双引号) 与''(单引号) 差在哪？

    ""(双引号) 与''(单引号) 差在哪? http://wiki.jikexueyuan.com/project/13-questions-of-shell/double-sin ...

  8. shell十三问？

    shell 十三问: 1) 为何叫做 shell ?  2) shell prompt(PS1) 与 Carriage Return(CR) 的关系?  3) 别人 echo.你也 echo ,是问 ...

  9. linux系统中的单引号和双引号

    一.为什么用quoting 前面说到,命令行在内容上主要由literal(一般文字)和meta(元字符)组成,而meta又由IFS.CR和其他字符组成(如=,$, > 等),通常这些原元字符都有 ...

  10. shell单引号双引号详解

    linux shell中的单引号与双引号的区别(看完就不会有引号的疑问了) " "(双引号)与 ' '(单引号)的区别    你在shell prompt(shell 提示)后面敲 ...

随机推荐

  1. Oracle 中新增字段后patch

    begin  ad_zd_table.patch('APPLSYS', 'CUX_3_GL_FARMER_BALANCE'); end ;

  2. 生产uuid

    uuid生产功能 近端时间要做一个获取唯一流水号的功能,于是有了:ip+starttime+pid+flow的方式. import java.lang.management.ManagementFac ...

  3. eclipse debug maven项目时出现缺少库的问题

    调试maven web项目时出现缺少库的情况导致项目无法启动  可是打包到tomcat发布却一切正常 后来在stackoverlow上找到了解决方案 项目右键属性->Deployment Ass ...

  4. 关于Comparable与Comparator

    首先说明一下这两个都是用来排序的, 只是应用起来有点差别而已. 有以下情景: 对于 List<String> list = new ArrayList<String>(); 我 ...

  5. C#网络编程二：Socket编程

    一:什么是SOCKET socket的英文原义是"孔"或"插座".作为进程通信机制,取后一种意思.通常也称作"套接字",用于描述IP地址和端 ...

  6. X-Frame-Options 响应头

    [X-Frame-Options 响应头] 参考:https://developer.mozilla.org/zh-CN/docs/Web/HTTP/X-Frame-Options

  7. Unity Application 前后台切换调用关系

    [Unity Application 前后台切换调用关系] http://blog.csdn.net/aa4790139/article/details/48087877

  8. 介绍开源的.net通信框架NetworkComms框架之四 消息边界

    原文网址: http://www.cnblogs.com/csdev Networkcomms 是一款C# 语言编写的TCP/UDP通信框架  作者是英国人  以前是收费的 目前作者已经开源  许可是 ...

  9. exception 'DOMException' with message 'Invalid Character Error' Php + Mongodb

    问题描述: 项目属于MVC设计模式,技术和框架采用了php5.6 + Yii2.0 + MongoDB. 在我从Controller中调用Model 的 findAll([]) 方法获取数据打印到屏幕 ...

  10. 解决：eclipse 非正常关闭，导致无法正常启动

    eclipse 无法正常启动: !ENTRY org.eclipse.ui.navigator 4 2 2016-09-07 11:23:54.181 !MESSAGE 从插件调用代码时出现问题:“o ...