PCE | 华中农大郭亮团队蛋白质组学揭示油菜内源氧化还原修饰介导盐胁迫响应
蛋白质翻译后修饰(PTM)在控制植物生长发育以及逆境适应方面发挥着重要的作用。发生在半胱氨酸巯基的亚磺酰化修饰(R-SOH)是一种可逆的氧化修饰类型,可以通过与其他修饰形态形成二硫键的形式来保护蛋白不被氧化损伤,是调控蛋白功能、代谢通路以及激素信号的重要方式。蛋白的氧化还原修饰被认为是ROS信号在细胞内和细胞间传递的重要途径。
2021年8月4日,华中农业大学油菜团队郭亮课题组在国际知名期刊Plant, Cell & Environment (IF=7.228)上发表了题为 “Proteome-wide identification of S-sulfenylated cysteines in Brassica napus” 的研究论文,运用氧化还原修饰组学技术,详细阐述了盐胁迫下油菜叶片内源亚磺酰化修饰蛋白的分布及变化特征。景杰生物为该研究的氧化还原修饰组学定量提供了技术支持。
半胱氨酸巯基的亚磺酰化修饰是极其不稳定状态,容易被还原或者进一步氧化,因此亚磺酰化修饰位点的鉴定方法选择尤为关键。该研究结合了iodoTMT标记和串联质谱相结合的方法(质谱策略),对油菜叶片在对照及盐处理条件下(样本策略)的亚磺酰化修饰位点进行定性和定量。iodoTMT标签仅与巯基基团(还原的未经修饰半胱氨酸残基)发生反应,结合强还原剂TCEP和R-SOH特异性的还原剂亚砷酸盐,实现对总半胱氨酸和亚磺酰化修饰半胱氨酸的分别标记和定量。另外在蛋白提取的同时对还原态的巯基进行可逆的封闭,最大限度地保持了样本中原始的巯基状态和水平。采用这种策略,研究总共鉴定到位于912个蛋白上的1821个修饰位点。
油菜叶片内源亚磺酰化修饰蛋白定量分析
进一步生信分析发现,亚磺酰化修饰蛋白大多分布在叶绿体和细胞质中。功能富集分析揭示,在光合作用以及糖酵解等代谢途径有大量的酶发生被修饰。在盐胁迫条件下,细胞内的总体氧化修饰水平表现出明显的上升趋势,并有大量蛋白从低修饰水平(%R-SOH<20%)转变为高修饰水平(%R-SOH>20%)。重组蛋白PGK (磷酸甘油酸激酶) 及FBPase(果糖-1,6-二磷酸酶)的体外修饰验证及酶活性分析也证实了酶的氧化修饰显著影响酶的活性。
盐胁迫下体内亚磺酰化修饰蛋白的差异变化
该研究利用氧化还原修饰组学方法,研究了甘蓝型油菜在短期盐胁迫反应过程中可逆的半胱氨酸修饰。研究在盐胁迫下鉴定到912个氧化还原修饰蛋白的亚磺酰化修饰水平的变化,并观察到盐胁迫期间体内氧化水平的增加。这些亚磺酰化蛋白质含有大量代谢酶,并参与各种生物过程,如光合作用和葡萄糖代谢。研究结果增加了我们对逆境胁迫下蛋白氧化还原修饰景观的认识,并为氧化还原修饰蛋白功能研究及氧化还原调控网络的理解提供了思路和基础。
PCE | 华中农大郭亮团队蛋白质组学揭示油菜内源氧化还原修饰介导盐胁迫响应的更多相关文章
- Nat Comm | 中科院动物所张勇团队合作揭示动物中DNA转座子介导基因重复的机制
1950年Barbara Mclintock 首次在玉米中发现转座子(TEs),并由此获得诺贝尔奖.尽管长期被认为是垃圾DNA,但现在TEs被广泛认可是宿主基因组演化的重要推动力.它们可引起包含基因重 ...
- Alterations of brain quantitative proteomics profiling revealed the molecular mechanisms of diosgenin against cerebral ischemia reperfusion effects(大脑的定量蛋白质组学揭示了薯蓣皂苷元对脑缺血再灌注效应的分子机制)
文献名:Alterations of brain quantitative proteomics profiling revealed the molecular mechanisms of dios ...
- Mol Cell丨吕志民团队揭示琥珀酰化介导的肿瘤细胞氧化应激调控新机制
蛋白质琥珀酰化修饰 (succinylation) ,作为赖氨酸酰化修饰家族的重要一员,于2011年由芝加哥大学赵英明教授团队在Nature Chemical Biology 发文被首次报道,并被评为 ...
- Dysregulation of Exosome Cargo by Mutant Tau Expressed in Human-induced Pluripotent Stem Cell (iPSC) Neurons Revealed by Proteomics Analyses(蛋白质组学揭示了人诱导的多能干细胞(iPSC)神经元中表达的突变Tau对外泌体的失调) 解读人:梁玉婷
期刊名:MCP 发表时间:(2020年4月) IF:4.828 单位:Skaggs School of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences, University ...
- NCB | 定量蛋白质组学揭示细胞外泌体通用标志物Syntenin-1
外泌体 (exosomes) 是由哺乳动物细胞通过"内吞-融合-外排"等机制,主动向胞外释放的纳米级 (直径40~60 nm) 双层囊泡小体,携带蛋白质.核酸.脂质等多种生物活性分 ...
- Quantitative proteomics of Uukuniemi virus-host cell interactions reveals GBF1 as proviral host factor for phleboviruses(乌库涅米病毒-宿主细胞互作的定量蛋白质组学揭示了GBF1是个白蛉病毒的前病毒宿主因子)-解读人:谭亦凡
期刊名:Molecular & Cellular Proteomics 发表时间:(2019年12月) IF:4.828 单位:1德国海德堡大学附属医院2德国汉诺威医科大学3德国亥姆霍茲感染研 ...
- Mol Cell | 张令强/贺福初/魏文毅/刘翠华揭示线性泛素化调控血管生成新机制
景杰学术 | 报道 泛素化修饰作为主要的蛋白质翻译后修饰之一,与细胞周期.应激反应.信号传导和DNA损伤修复等几乎所有的生命活动密切相关[1].泛素分子通常含有7个赖氨酸残基,通过这些残基可以和其他泛 ...
- Nature Cancer | 宋尔卫/苏士成团队揭示lncRNA调控巨噬细胞“双刃剑”作用新机制
巨噬细胞 (macrophage, Mϕ) 是先天免疫系统中重要的免疫细胞,也是血液.淋巴和所有哺乳动物组织类型中最常见的吞噬细胞,具有极强的功能多样性.其中,肿瘤微环境组织中存在的巨噬细胞也被称作肿 ...
- 浙大二院姚克团队发现新的NLRP3炎症小体抑制剂,有望用于治疗炎症疾病
期刊:Clinical and Translational Medicine 发表时间:2021年7月19日 影响因子:11.492 角膜炎是一种眼科常见疾病,也是我国主要致盲眼病之一,其特征是炎性细 ...
随机推荐
- webpack(3)基础的打包过程
没有配置文件的打包 如果我们没有使用配置文件webpack.config.js,那么我们就需要通过命令来打包 案例 我们首先创建一个webpackTest文件夹,然后在文件夹中再创建2个子文件夹dis ...
- 《PHP基础知识总结》系列分享专栏
总结PHP基础知识,对初学者还是高手都值得参考巩固. <PHP基础知识总结>已整理成PDF文档,点击可直接下载至本地查阅https://www.webfalse.com/read/2017 ...
- 2013年第四届蓝桥杯C/C++程序设计本科B组省赛 马虎的算式
题目描述 马虎的算式 小明是个急性子,上小学的时候经常把老师写在黑板上的题目抄错了. 有一次,老师出的题目是:36 x 495 = ? 他却给抄成了:396 x 45 = ? 但结果却很戏剧性,他的答 ...
- Leetcode 递归题
24. 两两交换链表中的节点 题目描述: 给定一个链表,两两交换其中相邻的节点,并返回交换后的链表. 你不能只是单纯的改变节点内部的值,而是需要实际的进行节点交换. 示例: 给定 1->2-&g ...
- docker起不来报错:Failed to start Docker Application Container Engine.
报错信息如下: [root@localhost localdisk]# systemctl restart docker Job for docker.service failed because t ...
- Sql Server(3)运算符的使用
where 订货日期 between '2017/10/24' and '2017/10/30' 小的写在前面,大的后面,不可以写反 一:运算符的使用 T-SQL的运算符应用指派运算符算术运算符比较 ...
- ARTS第一周
开始进行的第一周. 1.Algorithm:每周至少做一个 leetcode 的算法题2.Review:阅读并点评至少一篇英文技术文章3.Tip:学习至少一个技术技巧4.Share:分享一篇有观点和思 ...
- CF1444D Rectangular Polyline[题解]
Rectangular Polyline 题目大意 给定 \(h\) 条长度分别为 \(l_1,l_2,--,l_h\) 的水平线段以及 \(v\) 条长度分别为 \(p_1,p_2,--.p_v\) ...
- C语言:渔夫打鱼晒网问题
//如果一个渔夫从 2011 年 1 月 1 日开始三天打渔,两天晒网,编程实现当输入 2011 1 月 1 日以后的任意一天,输出该渔夫是在打渔还是在晒网. #include <stdio.h ...
- python numpy 数据集合操作函数
arrarray([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9])arr1array([0, 1, 2, 3, 4])np.intersect1d(arr,arr1)#计算数组ARR A ...