interproscan 软件实际上将对输入的查询序列和interpro 数据库中的序列去比对，将比对上的序列对应的GO信息作为查询序列的GO注释

在interpro 数据库中，每条蛋白质序列有一个唯一的interpro 编号，类似 IPR034725 这种格式，而每条蛋白又有对应的GO注释信息；

可以通过下面的链接得到 IPR 编号和GO 注释信息之间的对应关系

ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/interpro/interpro2go

这个链接中的内容如下：

interproscan 软件对序列进行GO 注释的更多相关文章

  1. 蛋白序列GO号注释及问题

    #===============================      版本1  ===============================================InterProSc ...

  2. InterProScan 5.17-56.0 安装和使用

    InterProScan 5.18-57.0 安装和使用,目前最新版的interproscan 引用自 每日一生信--interproscan安装及使用(终结版)原文官网:http://code.go ...

  3. InterProScan 5.25-64.0 安装和使用

    InterProScan 5.25-64.0 安装和使用,目前最新版的interproscan 引用自 每日一生信--interproscan安装及使用(终结版)原文官网:http://code.go ...

  4. 突变注释工具SnpEff,Annovar,VEP,oncotator比较分析--转载

    https://www.jianshu.com/p/6284f57664b9 目前对于variant进行注释的软件主要有4个: Annovar, SnpEff, VEP(variant Effect ...

  5. GO注释

    1.GO资源简介 由于生物系统的惊人复杂性和需要分析的数据集的不断增加,生物医学研究越来越依赖于以可计算的形式存储的知识.基因本体论(GO)项目为基因功能和基因产物的可计算知识提供了目前最全面的资源. ...

  6. 转录本组装软件StringTie的使用说明

    转录本组装软件StringTie的使用说明 StringTie 转录本组装软件StringTie的使用说明 转录组分析流程 HISTA + StringTie 组合.其Protocol 发表在Natu ...

  7. 扩增子分析解读5物种注释 OTU表操作

    本节课程,需要先完成<扩增子分析解读>系列之前的操作 1质控 实验设计 双端序列合并 2提取barcode 质控及样品拆分 切除扩增引物 3格式转换 去冗余 聚类 4去嵌合体 非细菌序列 ...

  8. 怎样批量删除PDF文件中的注释

    日常我们在阅读一些PDF文章时候,我们会发现有些PDF文章带有非常多的注释,显得非常不美观,影响了阅读体验.那么PDF文章里的批注应该怎么进行删除呢?怎样批量删除PDF文件中的注释?   操作教程: ...

  9. 转录组组装软件stringtie

    StringTie是約翰·霍普金斯大學计算机生物中心开发的一款转录组组装软件,在组装转录本的完整度,精度和速度方面都较以往的cufflinks 有很大的提升,也是目前有参考基因组转录组主流的组装软件. ...

随机推荐

  1. 图解zookeeper FastLeader选举算法【转】

    转自:http://codemacro.com/2014/10/19/zk-fastleaderelection/ zookeeper配置为集群模式时,在启动或异常情况时会选举出一个实例作为Leade ...

  2. sql2008修改数据库文件名称

    例如我们有数据库a,需修改成b,包括文件名称也修改 1.备份数据a 选择数据库->右键->任务->备份,备份出a.bak 2.右键->任务->还原->数据库,跳出“ ...

  3. 知道创宇研发技能表v2.1

    创建时间:2012/12/1 2013/4/26 公开发布 2013/7/15 新增:牛人1,2,3 2013/7/20 优化:成长,增加:小事心态.任务拆分.方法论 2013/8/12 更新:Web ...

  4. [转]Oracle 树操作(select…start with…connect by…prior)

    原文地址:https://www.cnblogs.com/colder/p/4838574.html oracle树查询的最重要的就是select…start with…connect by…prio ...

  5. [转] handsontable的核心方法

    原文地址:http://blog.csdn.net/mafan121/article/details/46122577 1.为handsontable添加钩子方法 addHook(key,callba ...

  6. STM32cube库配置双ADC的同步规则采样

    http://www.stmcu.org/module/forum/forum.php?mod=viewthread&tid=605203&extra=page%3D&page ...

  7. SD卡镜像烧写--树莓派为例

    SD烧写镜像都要先擦除SD卡内容,然后用image烧写工具烧写镜像. SD卡标准官网:www.sdcard.org,提供标准的擦除工具sdformatter. windows下镜像烧写工具可选用Win ...

  8. 使用 Easy Sysprep v4(ES4) 封装 Windows 7教程

      总:1.装系统ctrl+shift+f3(administrator)2.备份系统,快速备份(pe下)3.安装补丁,软件(系统下),不装安全类软件,需激活的软件重装后还要激活4.系统备份(pe下叠 ...

  9. 将安卓手机短信导入到iPhone6 plus中

    不越狱的情况下短信不能直接同步到iphone手机,视频.图片.联系人可以直接使用itools的手机搬家功能超方便从android到iphone中.短信得变通的处理才能导入. 工具: 安卓手机iPhon ...

  10. IDEA快捷键整理（最详细的）

    IDEA快捷键 Ctrl+Shift + Enter,语句完成“!”,否定完成,输入表达式时按 “!”键Ctrl+E,最近的文件Ctrl+Shift+E,最近更改的文件Shift+Click,可以关闭 ...