interproscan 软件实际上将对输入的查询序列和interpro 数据库中的序列去比对，将比对上的序列对应的GO信息作为查询序列的GO注释

在interpro 数据库中，每条蛋白质序列有一个唯一的interpro 编号，类似 IPR034725 这种格式，而每条蛋白又有对应的GO注释信息；

可以通过下面的链接得到 IPR 编号和GO 注释信息之间的对应关系

ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/interpro/interpro2go

这个链接中的内容如下：

interproscan 软件对序列进行GO 注释的更多相关文章

  1. 蛋白序列GO号注释及问题

    #===============================      版本1  ===============================================InterProSc ...

  2. InterProScan 5.17-56.0 安装和使用

    InterProScan 5.18-57.0 安装和使用,目前最新版的interproscan 引用自 每日一生信--interproscan安装及使用(终结版)原文官网:http://code.go ...

  3. InterProScan 5.25-64.0 安装和使用

    InterProScan 5.25-64.0 安装和使用,目前最新版的interproscan 引用自 每日一生信--interproscan安装及使用(终结版)原文官网:http://code.go ...

  4. 突变注释工具SnpEff,Annovar,VEP,oncotator比较分析--转载

    https://www.jianshu.com/p/6284f57664b9 目前对于variant进行注释的软件主要有4个: Annovar, SnpEff, VEP(variant Effect ...

  5. GO注释

    1.GO资源简介 由于生物系统的惊人复杂性和需要分析的数据集的不断增加,生物医学研究越来越依赖于以可计算的形式存储的知识.基因本体论(GO)项目为基因功能和基因产物的可计算知识提供了目前最全面的资源. ...

  6. 转录本组装软件StringTie的使用说明

    转录本组装软件StringTie的使用说明 StringTie 转录本组装软件StringTie的使用说明 转录组分析流程 HISTA + StringTie 组合.其Protocol 发表在Natu ...

  7. 扩增子分析解读5物种注释 OTU表操作

    本节课程,需要先完成<扩增子分析解读>系列之前的操作 1质控 实验设计 双端序列合并 2提取barcode 质控及样品拆分 切除扩增引物 3格式转换 去冗余 聚类 4去嵌合体 非细菌序列 ...

  8. 怎样批量删除PDF文件中的注释

    日常我们在阅读一些PDF文章时候,我们会发现有些PDF文章带有非常多的注释,显得非常不美观,影响了阅读体验.那么PDF文章里的批注应该怎么进行删除呢?怎样批量删除PDF文件中的注释?   操作教程: ...

  9. 转录组组装软件stringtie

    StringTie是約翰·霍普金斯大學计算机生物中心开发的一款转录组组装软件,在组装转录本的完整度,精度和速度方面都较以往的cufflinks 有很大的提升,也是目前有参考基因组转录组主流的组装软件. ...

随机推荐

  1. 【Android】ADB常用指令与logcat日志

    ADB命令简介 ADB是一个功能强大的命令行工具.通过它可以直接和模拟器或真机进行交互.它是一个具有客户端和服务器端的程序. 它主要由三个部分组成: 客户端,它运行在你的开发机上,你可以通过执行adb ...

  2. vue的全局引用

    1 一般在vue中,有很多vue组件,这些组件每个都是一个文件.都可能需要引用到相同模块(或者插件).我们不想每个文件都import 一次模块. 如果是基于vue.js编写的插件我们可以用 Vue.u ...

  3. ss安装

    安装很简单,如下: apt-get install python-pip pip install shadowsocks 配置文件格式如下: { "server":"0. ...

  4. 【Deep Learning】Hinton. Reducing the Dimensionality of Data with Neural Networks Reading Note

    2006年,机器学习泰斗.多伦多大学计算机系教授Geoffery Hinton在Science发表文章,提出基于深度信念网络(Deep Belief Networks, DBN)可使用非监督的逐层贪心 ...

  5. 虚拟机三种网络模式详解（Bridge，Nat，Host-only）

    虚拟机网络模式 无论是vmware,virtual box,virtual pc等虚拟机软件,一般来说,虚拟机有三种网络模式: 1.桥接 2.NAT 3.Host-Only 初学者看到虚拟机有三种网络 ...

  6. S3C2440的七种模式之——未定义模式（去掉bl print1 bug解决）

    现在做第一个实验,模拟未定义模式. 未定义模式,是cpu遇到自己不能识别的指令时候做出的异常处理. arm指令的机器码一定是按照某种规范要求的,不然你随意写一条指令,cpu不是都可以执行吗?在cpu没 ...

  7. tomcat 远程命令执行漏洞复现

    影响范围 Apache Tomcat 7.0.0 - 7.0.81 不受影响的版本 Apache Tomcat 8.x Apache Tomcat 9.x 漏洞分析 在Tomcat安装目录下的配置文件 ...

  8. [转]ssh中如何实现定时任务（spring对quartz的支持）

    原文地址:http://blog.csdn.net/qq_18675693/article/details/50413889 实现定时任务:quartz spring中对quartz进行了封装,使得我 ...

  9. [转]Teleport Ultra/Teleport Pro的冗余代码批量清理方法

    原文地址:http://www.abcd9.com/?post=402 Teleport Pro 是款优秀的网站离线浏览工具(即网站整站下载工具),Teleport Ultra是其增强版,但使用此系列 ...

  10. bzoj1103【POI2007】大都市meg

    1103: [POI2007]大都市meg Time Limit: 10 Sec  Memory Limit: 162 MB Submit: 1544  Solved: 776 [Submit][St ...