interproscan 软件实际上将对输入的查询序列和interpro 数据库中的序列去比对，将比对上的序列对应的GO信息作为查询序列的GO注释

在interpro 数据库中，每条蛋白质序列有一个唯一的interpro 编号，类似 IPR034725 这种格式，而每条蛋白又有对应的GO注释信息；

可以通过下面的链接得到 IPR 编号和GO 注释信息之间的对应关系

ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/interpro/interpro2go

这个链接中的内容如下：

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