关于缺失值(missing value)的处理---机器学习 Imputer
关于缺失值(missing value)的处理
在sklearn的preprocessing包中包含了对数据集中缺失值的处理,主要是应用Imputer类进行处理。
首先需要说明的是,numpy的数组中可以使用np.nan/np.NaN(Not A Number)来代替缺失值,对于数组中是否存在nan可以使用np.isnan()来判定。
使用type(np.nan)或者type(np.NaN)可以发现改值其实属于float类型,代码如下:
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>>> type(np.NaN)<type 'float'>>>> type(np.nan)<type 'float'>>>> np.NaNnan>>> np.nannan |
因此,如果要进行处理的数据集中包含缺失值一般步骤如下:
1、使用字符串'nan'来代替数据集中的缺失值;
2、将该数据集转换为浮点型便可以得到包含np.nan的数据集;
3、使用sklearn.preprocessing.Imputer类来处理使用np.nan对缺失值进行编码过的数据集。
代码如下:
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>>> from sklearn.preprocessing import Imputer>>> imp = Imputer(missing_values='NaN', strategy='mean', axis=0)>>> X=np.array([[1, 2], [np.nan, 3], [7, 6]])>>> Y=[[np.nan, 2], [6, np.nan], [7, 6]]>>> imp.fit(X)Imputer(axis=0, copy=True, missing_values='NaN', strategy='mean', verbose=0)>>> imp.transform(Y)array([[ 4. , 2. ], [ 6. , 3.66666667], [ 7. , 6. ]]) |
上述代码使用数组X去“训练”一个Imputer类,然后用该类的对象去处理数组Y中的缺失值,缺失值的处理方式是使用X中的均值(axis=0表示按列进行)代替Y中的缺失值。
当然也可以使用imp对象来对X数组本身进行处理。
通常,我们的数据都保存在文件中,也不一定都是Numpy数组生成的,因此缺失值可能不一定是使用nan来编码的,对于这种情况可以参考以下代码:
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>>> line='1,?'>>> line=line.replace(',?',',nan')>>> line'1,nan'>>> Z=line.split(',')>>> Z['1', 'nan']>>> Z=np.array(Z,dtype=float)>>> Zarray([ 1., nan])>>> imp.transform(Z)array([[ 1. , 3.66666667]]) |
上述代码line模拟从文件中读取出来的一行数据,使用nan来代替原始数据中的缺失值编码,将其转换为浮点型,然后使用X中的均值填补Z中的缺失值。
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