药物动力学|肿瘤药物基因组研究的策略|OMIM database|PharmGKB

生命组学

同义突变虽然不改变蛋白质种类，但是影响量，修饰的稳定性。

SNP vs mutation

SNV单核苷酸变化，mutation，SNP是从群体角度思考的，约有1%，mutation比SNP还低。

Alleles and genotype

多种效应叠加比孟德尔遗传出现的概率高。

依据SNP将人群分开，分别用药，研究不同人群（不同变异）对该药物的反应。

疗效研究药物靶点，药物动力学研究药物代谢途径。

======================================

药物动力学

药物代谢酶研究最多，细胞色素P450，不同细胞P450分工不同，

应用：

Eg：对于depression|hypertension|diabetes来来说，治愈除了代谢和靶点之外还有环境因素。

Eg：华法林不同基因型对应不同计量，但是只能解释50%的差异，还有50%不可控。

计划：TCGA the cancer genome atlas

不同癌症的变异频率比较，最高是肺癌（固体流），最低儿童或者血液瘤（液体瘤）。

=============================================================

肿瘤药物基因组研究的策略：

不同的队列类型，分别取一定量的样本量，最少500个样本，样本需要考虑1.收集感兴趣的表型，2.确定样本是何种水平（DNA|RNA），再进行GWAS关联分析，临床验证，最后得到临床指南。

=============================================================

OMIM database遗传性疾病数据库

PharmGKB将药物的毒副作用、变异等信息整合出来。

包括Genes，function，variants、Pathway、Disease等。

用基因型对应用药。