Global Alignment(全局比对)--从算法(Needleman-Wunsch)到python实现
很早就知道有全局比对和局部比对这两种比对方法,都是用到的动态规划的思想,知道一些罚分矩阵的概念,但一直都没有机会搞透彻,一些算法的细节也不太清楚,也没有亲手编程实现。
现在由于项目需求,需要手动写一个简单的全局和局部比对的程序,同时得知团队里有个大牛早就用Perl实现了,看了一下他的代码也才100行,于是我打算从头开始全面的弄懂算法的每一个细节,然后再用python实现一遍。
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