Fuzzy Search

给你文本串 S 和模式串 T,求 S 的每个位置是否能模糊匹配上 T。

这里的模糊匹配指的是把 T 放到 S 相应位置上之后,T 中每个字符所在位置附近 k 个之内的位置上的 S 的字符至少有一个与之相同。

1 ≤ |T| ≤ |S| ≤ 200 000, 0 ≤ k ≤ 200 000。字符串是基因序列。

题解

由于字符集很小,所以对每种字符分别处理。

对 T 每个位置赋值为它是否等于这个字符。对 S 的每个位置前后找找有没有这种字符即可。

然后卷积看看匹配了多少个位置。每种字符的匹配位置数加起来等于 T 的长度的话,匹配就成功了。

时间复杂度 \(O(n \log n)\)。

struct node {LD x,y;};
IN node operator+(CO node&a,CO node&b){
return (node){a.x+b.x,a.y+b.y};
}
IN node operator-(CO node&a,CO node&b){
return (node){a.x-b.x,a.y-b.y};
}
IN node operator*(CO node&a,CO node&b){
return (node){a.x*b.x-a.y*b.y,a.x*b.y+a.y*b.x};
}
IN node operator/(CO node&a,LD k){
return (node){a.x/k,a.y/k};
} CO int N=524288;
char s[N],t[N];
int cnt[100];
node sa[N],sg[N],sc[N],st[N];
node ta[N],tg[N],tc[N],tt[N];
node res[N];
bool ans[N]; CO LD pi=acos(-1),eps=1e-6;
int rev[N];
node omg[N]; void FFT(node a[],int lim){
for(int i=0;i<lim;++i)
if(i<rev[i]) swap(a[i],a[rev[i]]);
for(int i=1;i<lim;i<<=1)
for(int j=0;j<lim;j+=i<<1)
for(int k=0;k<i;++k){
node t=omg[lim/(i<<1)*k]*a[j+i+k];
a[j+i+k]=a[j+k]-t,a[j+k]=a[j+k]+t;
}
} int main(){
int n=read<int>(),m=read<int>(),k=read<int>();
scanf("%s%s",s,t);
reverse(t,t+m);
for(int i=0;i<m;++i){
if(t[i]=='A') ta[i]=(node){1,0};
else if(t[i]=='G') tg[i]=(node){1,0};
else if(t[i]=='C') tc[i]=(node){1,0};
else tt[i]=(node){1,0};
}
for(int i=0;i<n;++i){
++cnt[s[i]];
if(cnt['A']) sa[i]=(node){1,0};
if(cnt['G']) sg[i]=(node){1,0};
if(cnt['C']) sc[i]=(node){1,0};
if(cnt['T']) st[i]=(node){1,0};
if(i>=k) --cnt[s[i-k]];
}
memset(cnt,0,sizeof cnt);
for(int i=n-1;i>=0;--i){
++cnt[s[i]];
if(cnt['A']) sa[i]=(node){1,0};
if(cnt['G']) sg[i]=(node){1,0};
if(cnt['C']) sc[i]=(node){1,0};
if(cnt['T']) st[i]=(node){1,0};
if(i+k<=n-1) --cnt[s[i+k]];
}
memset(cnt,0,sizeof cnt);
for(int i=0;i<m;++i) ++cnt[t[i]]; fill(ans+m-1,ans+n,1); int len=ceil(log2(n)),lim=1<<len;
for(int i=0;i<lim;++i) rev[i]=rev[i>>1]>>1|(i&1)<<(len-1);
for(int i=0;i<lim;++i) omg[i]=(node){cos(i*2*pi/lim),sin(i*2*pi/lim)}; FFT(sa,lim),FFT(ta,lim);
for(int i=0;i<lim;++i) res[i]=sa[i]*ta[i];
for(int i=0;i<lim;++i) omg[i].y=-omg[i].y;
FFT(res,lim);
for(int i=0;i<lim;++i) res[i]=res[i]/lim;
for(int i=0;i<lim;++i) omg[i].y=-omg[i].y;
for(int i=m-1;i<n;++i)
if(fabs(res[i].x-cnt['A'])>eps) ans[i]=0; FFT(sg,lim),FFT(tg,lim);
for(int i=0;i<lim;++i) res[i]=sg[i]*tg[i];
for(int i=0;i<lim;++i) omg[i].y=-omg[i].y;
FFT(res,lim);
for(int i=0;i<lim;++i) res[i]=res[i]/lim;
for(int i=0;i<lim;++i) omg[i].y=-omg[i].y;
for(int i=m-1;i<n;++i)
if(fabs(res[i].x-cnt['G'])>eps) ans[i]=0; FFT(sc,lim),FFT(tc,lim);
for(int i=0;i<lim;++i) res[i]=sc[i]*tc[i];
for(int i=0;i<lim;++i) omg[i].y=-omg[i].y;
FFT(res,lim);
for(int i=0;i<lim;++i) res[i]=res[i]/lim;
for(int i=0;i<lim;++i) omg[i].y=-omg[i].y;
for(int i=m-1;i<n;++i)
if(fabs(res[i].x-cnt['C'])>eps) ans[i]=0; FFT(st,lim),FFT(tt,lim);
for(int i=0;i<lim;++i) res[i]=st[i]*tt[i];
for(int i=0;i<lim;++i) omg[i].y=-omg[i].y;
FFT(res,lim);
for(int i=0;i<lim;++i) res[i]=res[i]/lim;
for(int i=0;i<lim;++i) omg[i].y=-omg[i].y;
for(int i=m-1;i<n;++i)
if(fabs(res[i].x-cnt['T'])>eps) ans[i]=0; int sum=0;
for(int i=m-1;i<n;++i) sum+=ans[i];
printf("%d\n",sum);
return 0;
}

残缺的字符串

很久很久以前,在你刚刚学习字符串匹配的时候,有两个仅包含小写字母的字符串A和B,其中A串长度为m,B串长度为n。可当你现在再次碰到这两个串时,这两个串已经老化了,每个串都有不同程度的残缺。

你想对这两个串重新进行匹配,其中A为模板串,那么现在问题来了,请回答,对于B的每一个位置i,从这个位置开始连续m个字符形成的子串是否可能与A串完全匹配?

1<=m<=n<=300000

两个串均仅由小写字母和*号组成,其中*号表示相应位置已经残缺。

题解

这题跟上面那道几乎一样,只不过模糊匹配的方式更改了而已。

令通配符的位置的值为0,构造

\[ans_i=\sum_{j=0}^{m-1} A_jB_{i+j}(A_j-B_{i+j})^2
\]

ansi=0时匹配成功。

这破题还是权限题。

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