生信数据文件一般是按列分开的,如果我们只想简单的提取一列而不是费尽周折写个程序提取哪一列的话,awk作为一个非常好用的文档处理工具,我们现在来简单看一下他的一些功能:

awk '{print $1}' ./Input.txt > ./out.txt

这里' '中是要输出的表达式,$1代表第一列,Input.txt是输入文件。

awk '{print $1,$2}'

提取前两列。

提取之后的文件就可以用sort等命令进行操作:

sort ./out.txt | uniq out

排序并删除重复行。

【awk】提取文件第一列的更多相关文章

  1. awk删除文件第一列

    awk删除文件第一列 1.采用awk awk '{$1="";print $0}' file 2.采用sed sed -e 's/[^]* //' file sort -R fil ...

  2. shell脚本,awk 根据文件某列去重并且统计该列频次。

    a文件为 a a a s s d .怎么把a文件变为 a s d .怎么把a文件变为 a a a s s d 解题方法如下: 解题思路 [root@localhost study]# awk 'NR= ...

  3. python 读取文件第一列 空格隔开的数据

    file=open('6230hand.log','r') result=list() for c in file.readlines(): c_array=c.split(" " ...

  4. linux提取第一列且删除第一行(awk函数)

    如下文件所示,只想提取红框中的内容,即进行提取第一列,且去除第一行的操作 则用到下列命令行: awk 'NR == 1 {next} {print $1}' file.txt > file_co ...

  5. 删除文件的第一列 -Linux

    删除文件 text中第一列 方式一 awk '{$1="";print $0}' text 方式二 sed -e 's/[^ ]* //' text

  6. awk 统计文件中按照某列统计某列的和(sum)

    把第一列相同的名称的第二列加起来: [root@localhost cc]# cat 1.txtaaa 10 bbb 20aaa 30ccc 40ccc 20ccc 40 [root@localhos ...

  7. CMD批处理把txt文本中的每行写入一个新文件,第一列作文件名

    需求 现在有一个文件格式如图 ID 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17001 89.84 8.87 1.29 -0.0 0.0 68.99 0.0 0. ...

  8. 字符截取:cut,格式化输出:printf,字符截取:awk,文件或命令输出编辑:sed

    cut 选项 文件名 -f 列号 提取第几列 -d 分隔符 指定分隔符把行分成多列 不能以空格为分隔符. [root@localhost ~]# cat testfile no. name sex s ...

  9. Shell基础(六):使用awk提取文本、awk处理条件、awk综合脚本应用、awk流程控制、awk扩展应用

    一.使用awk提取文本 目标: 本案例要求使用awk工具完成下列过滤任务: 1> 练习awk工具的基本用法    2> 提取本机的IP地址.根分区使用率    3> 格式化输出/et ...

随机推荐

  1. Library弱依赖打包

    为减少强依赖,运行时动态监测依赖是否存在. 例如:内置的 HTTP client 可以是 OkHttpClient 或者是 HttpURLConnection.前者拥有更高的性能,但需要引入 OkHt ...

  2. 域渗透之通过DCSync获取权限并制作黄金票据

    环境背景 账号: admin 没有域管权限 admin02 有域管权限 administrator 有域管权限 模拟渗透过程: 利用任意方法已经登录到client1(Windows 7),在clien ...

  3. nginx的日志配置

    本文转自:https://www.cnblogs.com/biglittleant/p/8979856.html 版权归属原作者!!!!!! nginx access日志配置 access_log日志 ...

  4. Python中的test测试

    不知道怎么回事,打开的工程中出现了pytest,难道是检测到了我的命名中有test吗? 参考博文:https://blog.csdn.net/weixin_41605937/article/detai ...

  5. oracle数据库字符集查询

    1>数据库服务器字符集 select * from nls_database_parameters,其来源于props$,是表示数据库的字符集. 查询结果如下 NLS_LANGUAGE AMER ...

  6. rails 杂记 - erb 中的 form_helper

    原文 1. form_tag 1) 基础 Form <%= form_tag do %> Form contents <% end %> 生成 html <form ac ...

  7. 19. vue的原理

    vue:原理1 => Object.defineProperty 当你把一个普通的 JavaScript 对象传给 Vue 实例的 data 选项,Vue 将遍历此对象所有的属性,并使用 Obj ...

  8. javascript匿名函数 闭包

    匿名函数 (function(){                console.info("111111111");            })(); var my = (fun ...

  9. VMware Workstation下ubuntu虚拟机无法上网连不上网络解决

    写在前面:本博客为本人原创,严禁任何形式的转载!本博客只允许放在博客园(.cnblogs.com),如果您在其他网站看到这篇博文,请通过下面这个唯一的合法链接转到原文! 本博客全网唯一合法URL:ht ...

  10. 【转】AngularJS动态生成div的ID

    AngularJS动态生成div的ID 原文链接:http://blog.csdn.net/you23hai45/article/details/52348078 1.问题背景 给定一个数组对象,里面 ...