生信数据文件一般是按列分开的,如果我们只想简单的提取一列而不是费尽周折写个程序提取哪一列的话,awk作为一个非常好用的文档处理工具,我们现在来简单看一下他的一些功能:

awk '{print $1}' ./Input.txt > ./out.txt

这里' '中是要输出的表达式,$1代表第一列,Input.txt是输入文件。

awk '{print $1,$2}'

提取前两列。

提取之后的文件就可以用sort等命令进行操作:

sort ./out.txt | uniq out

排序并删除重复行。

【awk】提取文件第一列的更多相关文章

  1. awk删除文件第一列

    awk删除文件第一列 1.采用awk awk '{$1="";print $0}' file 2.采用sed sed -e 's/[^]* //' file sort -R fil ...

  2. shell脚本,awk 根据文件某列去重并且统计该列频次。

    a文件为 a a a s s d .怎么把a文件变为 a s d .怎么把a文件变为 a a a s s d 解题方法如下: 解题思路 [root@localhost study]# awk 'NR= ...

  3. python 读取文件第一列 空格隔开的数据

    file=open('6230hand.log','r') result=list() for c in file.readlines(): c_array=c.split(" " ...

  4. linux提取第一列且删除第一行(awk函数)

    如下文件所示,只想提取红框中的内容,即进行提取第一列,且去除第一行的操作 则用到下列命令行: awk 'NR == 1 {next} {print $1}' file.txt > file_co ...

  5. 删除文件的第一列 -Linux

    删除文件 text中第一列 方式一 awk '{$1="";print $0}' text 方式二 sed -e 's/[^ ]* //' text

  6. awk 统计文件中按照某列统计某列的和(sum)

    把第一列相同的名称的第二列加起来: [root@localhost cc]# cat 1.txtaaa 10 bbb 20aaa 30ccc 40ccc 20ccc 40 [root@localhos ...

  7. CMD批处理把txt文本中的每行写入一个新文件,第一列作文件名

    需求 现在有一个文件格式如图 ID 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17001 89.84 8.87 1.29 -0.0 0.0 68.99 0.0 0. ...

  8. 字符截取:cut,格式化输出:printf,字符截取:awk,文件或命令输出编辑:sed

    cut 选项 文件名 -f 列号 提取第几列 -d 分隔符 指定分隔符把行分成多列 不能以空格为分隔符. [root@localhost ~]# cat testfile no. name sex s ...

  9. Shell基础(六):使用awk提取文本、awk处理条件、awk综合脚本应用、awk流程控制、awk扩展应用

    一.使用awk提取文本 目标: 本案例要求使用awk工具完成下列过滤任务: 1> 练习awk工具的基本用法    2> 提取本机的IP地址.根分区使用率    3> 格式化输出/et ...

随机推荐

  1. Zephyr学习(三)启动过程

    一.写在前面 最近对zephyr这个系统很感兴趣,因此业余有时间的时候都在研究它的源码,而光看代码不去动手这不是我的风格,于是乎在网上淘了一块STM32F103C8T6的核心板和一块NRF52832的 ...

  2. 公司中springcloud项目遇到的问题

    1.更改maven的.m2下的settings.xml文件,程序就可以运行,是不是很神奇?

  3. linux的基本操作(LNMP的基本操作)

    LNMP 的环境搭建 和LAMP不同的是LNMP中的N指的是是Nginx(类似于Apache的一种web服务软件)其他都一样.目前这种环境应用的也是非常之多.Nginx设计的初衷是提供一种快速高效多并 ...

  4. hive 限制本地内存使用量

    hive.mapred.local.mem Mapper/Reducer 在本地模式的最大内存量,以字节为单位,0为不限制. hive-default.xml <property> < ...

  5. mui 窗口管理及窗口之间的数据传递

    <!DOCTYPE html> <html> <head> <meta charset="utf-8"> <meta name ...

  6. C#实现全窗体范围拖动

    using System.Runtime.InteropServices; [DllImport("user32.dll")] public static extern bool ...

  7. 2018今日头条杯 E-Jump a Jump

    Problem E. Jump A JumpInput file: standard inputOutput file: standard outputTime limit: 1 secondsMemor ...

  8. RMQPOJ3264

    Balanced Lineup POJ-3264 DP分析 设A[i]是要求区间最值的数列,F[i, j]表示从第i个数起连续2^j个数中的最大值.(DP的状态) 初状态是F[i,0]=A[i] 状态 ...

  9. 使用阿里云公网ip建立bind,监听客户端连接失败

    bind: Cannot assign requested address 网上的众多答案不能解决我的问题 通过ping可以ping通,但是 使用bind代码,这个ip就是不能用的, 使用 ifcon ...

  10. InnoDB中锁的算法(2)

    Ⅰ.上节回顾 session1: (root@localhost) [test]> select * from l; +---+------+------+------+ | a | b | c ...