ZDOCK3.02安装及注意事项：基于Linux Ubuntu系统操作

cd zdock3.0.2_linux_x64
代码
mark_sur model2choose.pdb model2choose_m.pdb
mark_sur 1bqi2.pdb 1bqi2_m.pdb
zdock -R model2choose_m.pdb -L 1bqi2_m.pdb -o zdock2.out
create.pl zdock.out

安装过程所需代码：
sudo apt-get update
sudo apt-get install synaptic
输入以下命令来打开Synaptic Package Manager：
sudo synaptic
选择了方法2：
(1) 到Synaptic Package Manager 下搜索
libg2, libf2,gcc- g77
(2) 安装
(3) 重启系统

(base) user@user-virtual-machine:~$ dpkg -S libg2c.so.0
libf2c: /usr/lib64/libg2c.so.0
libf2c: /usr/lib64/libg2c.so.0.0.0

sudo ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libgfortran.so.3 /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libg2c.so.0 叉
sudo ln -s /usr/lib64/libg2c.so.0 /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libg2c.so.0 对

下载解压了以后，需要加以下两行 添加到环境变量
添加以下两行到环境变量
#ZDOCK 3.0.2

export PATH=/home/user/zdock3.0.2_linux_x64:$PATH

要将两行新命令添加到 ~/.bashrc 文件中，并使用 source ~/.bashrc 命令进行更新，可以按照以下步骤进行操作：

打开终端，并输入以下命令来编辑 ~/.bashrc 文件：
nano ~/.bashrc
这将使用 nano 文本编辑器打开 ~/.bashrc 文件。

在 nano 编辑器中，向文件的末尾添加您要执行的两个新命令。每个命令应独占一行。例如：
command1
command2
请将 command1 和 command2 替换为您要添加的实际命令。

按下 Ctrl + O 键保存文件，在提示时确认文件名为 ~/.bashrc。

按下 Ctrl + X 键退出 nano 编辑器。

运行以下命令以使更改生效：

source ~/.bashrc
这将重新加载 ~/.bashrc 文件中的内容，使新添加的命令可用。

现在，您已经成功将新命令添加到 ~/.bashrc 文件中，并使用 source ~/.bashrc 命令进行更新。每次终端会话开始时，这些命令都会自动执行。

（1）到论坛http://rpm.pbone.net/ 搜索 libg2c.so.0 找到和你系统相对应的软件
比如使用的系统的是 ubuntu， 我找一个Fedora 软件包下载即可。*.rpm

（2）下一步将*.rpm 转换为 deb包
(2-1) 安装alien
sudo apt-get install alien
(2-2) 将rpm包 转化为deb包
sudo alien libf2c-3.4.4-2.fc3.x86_64.rpm
(2-3) 安装deb包
sudo dpkg -i libf2c_3.4.4-3_amd64.deb
(3) 重新启动系统即可。